航行器在靜默模式下穿越那片外層星域的過程持續了相當長的時間。
治裡的航行日誌從穿越引力層邊界後的第十五日開始記錄，到遭遇第一批大筒木外遣小隊時，日誌的頁碼已經翻過了相當厚的篇幅。那些頁碼之間的時間跨度不是以日計算的，而是以月計算的。治裡在每一頁的頂部標注著航行器內部的計時係統讀數——那套係統以忍界標準的時辰和日為單位運行，但她在穿越引力層後的第三個月開始注意到，計時係統的讀數與她對時間流逝的主觀感知之間出現了一定程度的偏差。那種偏差不是係統故障，而是她的生理節律在沒有日升日落的外部參照物時，正在逐漸偏離標準計時器的節拍。她在第三個月的日誌末尾注明了一行備注：主觀時間感知與係統計時之間存在約百分之三的偏差。正在嘗試調整。
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光在感知麵板前積累了大量的星圖數據。她的麵板在靜默模式下運行了數月之後，上麵已經覆蓋了一層由數千個信號標記組成的密集網絡——那些標記涵蓋了從航行器當前位置向外延伸約十二光時範圍內的所有可感知信號源，包括了移動的、靜止的、周期性的和偶發性的各種類型。她在長時間的靜默航行中發展出了一種新的數據整理方法，將信號標記按照它們的移動模式分為三類：軌跡固定的歸入類，軌跡變化的歸入移動體類，軌跡以某種可預測的規律重複的歸入循環體類。三類標記在麵板上以不同的顏色顯示，使得星圖的可讀性比初期提高了約一倍。
止水的瞳術在真空中的演化在第三個月至第六個月之間進入了一個相對穩定的階段。他的感知視野寬度和深度在這個階段中達到了一個平衡點——寬度約覆蓋前方一百二十度扇區，深度約延伸至六光時距離，在這兩個參數之間他不再需要以犧牲其中之一來換取另一個的提升。他的瞳術在穩定後呈現出的新形態與忍界地表時的形態有所不同：在真空中，他的感知信號呈現出更明顯的擴散傾向，像是某種在低密度介質中傳播時會自然擴張的波形，使得他的感知覆蓋麵積比在地表時大了約三成，但單位麵積上的分辨率比在地表時低了約一成。他把這個變化稱為真空瞳，並在航行日誌中正式標注了這個術語。
鏡和白牙在漫長的航行中完成了從忍界戰鬥方式向星際戰鬥方式的過渡。那種過渡不是通過學習獲得的，而是通過在實際環境中的反複試錯和參數調整逐步實現的。鏡在第三個月的某次自檢中發現，他在真空環境下的體術動作需要比在地表時提前約零點二息完成每個動作的預判，因為真空中的空氣阻力缺失會導致他的肌肉在動作開始時獲得比預期更快的加速度，從而使目標位置與命中位置之間產生偏差。他花了約兩周的時間來重新校準他的肌肉記憶，校準完成後他在一次內部訓練中的命中精度恢複到了地表時的水平。白牙的調整方向與鏡不同——他需要調整的是他對距離的判斷方式。在真空中沒有大氣散射造成的光學距離衰減效果，所有物體在視覺上呈現出比實際更近的外觀，他在前兩個月的地麵式判斷導致了若乾次次空間操作的偏位，在第三個月完成了校正。
治裡在此期間持續監控著小十尾的查克拉儲備狀態。小十尾在靜默模式下的消耗速率比治裡在航程初期估算的還要低約一成，原因是在真空環境中推進器所麵臨的阻力遠低於在星球大氣層中，使相同的能量輸入能夠產生更長的推進距離。她在第六個月的儲備狀態檢查中計算出，以當前的消耗速率，小十尾的儲備足以支持這趟航行完成遠超已規劃距離的行程——裕度約為一倍半。她在日誌中記錄了那個數據，沒有調整推進模式。
蒼在航行期間將相當一部分注意力投入到了對芝居遺骸碎片的持續研究中。他在航行器內部一個隔離區域中設置了專門的碎片分析台，台麵上放置著他在忍界時收集到的那些碎片樣本和他在穿越引力層後的航行中通過空間掃描捕獲到的若乾微小顆粒物樣本。他將那些樣本與從桃式三人處獲取的本源信息進行了交叉對照，在長時間的持續比較中發現了一個他在忍界時未能識別的特征——芝居的遺骸碎片中存在著一種底層共振頻率，那種頻率與桃式三人本源中某些邊緣頻段之間存在約四成的匹配度。不是桃式一個人的本源與芝居匹配，是桃式、金式、浦式三個人的本源在各自的邊緣頻段中各自貢獻了約一成五的匹配度，三者相加形成了那個約四成。那意味著桃式三人的本源不是彼此獨立地從不同的源頭獲得的——它們是從同一個源頭分裂出來的，那個源頭有著與芝居相同的底層共振頻率。
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