但是後來，黃教興起，開始挑戰噶舉、薩迦等舊派的地位，但是一切的轉折，還是在蒙古人這裡。
當初漠南蒙古俺答汗為了統一蒙古各部、鞏固自身統治，主動引入黃教，意圖藉助宗教的力量凝聚人心。
公元 1578年，俺答汗與黃教領袖索南嘉措在仰華寺會晤，俺答汗贈索南嘉措「達賴喇嘛」尊號（即三世達賴），索南嘉措則封俺答汗為「轉千金法輪咱克喇瓦爾第徹辰汗」，雙方結成同盟。
此後，黃教在蒙古全境迅速傳播，取代薩滿教成為主流，蒙古成為黃教最大外部護法，為其在西藏的擴張提供軍事後盾。
自此之後，紅教與黃教便勢同水火，爭鬥不休，打的不可開交。
這宗教戰爭的殘酷，遠超尋常的權力爭鬥。 伴你讀，.超貼心 ,提供給你，的閱讀體驗
如今，紅教聯合藏巴汗政權，對黃教展開了殘酷的打壓，焚毀黃教寺院、沒收其土地、迫害其僧人，無所不用其極，黃教已然到了瀕臨覆滅的邊緣。
黃教實在是頂不住了，連忙搖人，向自己的蒙古護法求援，漠南土默特部應邀入藏助戰。
青海土默特首領拉尊窮哇羅桑丹增、洪台吉率領數千騎兵進入藏地，與拉薩本地的黃教武裝（吉雪巴）匯合，在拉薩城郊與藏巴汗的大軍展開激戰，最終擊敗了藏巴汗的一萬大軍，暫時緩解了黃教的危機。
可好景不長，土默特部雖然在1621年取得了勝利，但彼時土默特部內部早已四分五裂，紛爭不斷，根本無力長期在藏地駐軍，也無法徹底消滅藏巴汗政權，隻能草草撤兵返回青海。
土默特部一走，黃教再次陷入孤立無援的境地，紅教與藏巴汗政權捲土重來，對黃教的打壓愈發嚴苛。
要是按照原來的歷史發展，後來外喀爾喀蒙古領主卻圖汗，因在蒙古內部鬥爭中被排擠，於1632年率部南下青海，征服了當地的土默特殘部，成為青海的霸主。
這卻圖汗原本信奉黃教，後來卻轉而改信紅教，在青海境內大肆捕殺黃教高僧、拆毀黃教寺院、沒收其寺產，與藏巴汗、白利土司結成同盟，三方聯手，把黃教往死了整！
當時的黃教高層，五世達賴，四世班禪這幫人一看，土默特已經沒了，必須找更強蒙古勢力，不然就隻能等死了。
於是1635年，黃教派密使赴衛拉特，邀請和碩特部首領固始汗入藏，取代土默特部成為黃教新的護法。
這和碩特部，是衛拉特四部中最早皈依黃教的部落，與達賴喇嘛、班禪額爾德尼的關係最為密切。
固始汗本身早已皈依黃教，還被黃教高層贈予「大國師（顧實汗）」尊號，視護持黃教為「天命」。
與此同時，衛拉特四部中，準噶爾部日漸崛起，不斷擠壓和碩特部的生存空間，固始汗也急需南下開闢新的領地，擴充自身勢力。
黃教的求援，恰好為固始汗提供了「名正言順」的藉口——既可「護教」，又可擴張至青海、西藏，建立屬於自己的汗國。
後來固始汗率軍入藏，擊敗藏巴汗、白利土司與卻圖汗的同盟，結束了西藏近三百年的教派混戰，建立了和碩特汗國，形成了「汗王掌軍、黃教掌教」的政教合一格局。
固始汗自任汗王，執掌藏地的軍事與行政大權，同時設立第巴（西藏行政長官）處理日常事務，還留下自己的諸子鎮守青海，建立穩固的後方。
當然，這些都是原本歷史上的走向。
在原來的時空裡，彼時的大明早已步入王朝末期，內有農民起義風起雲湧，外有後金虎視眈眈，朝廷自顧不暇，根本無力顧及藏地的局勢。
所以後麵發生的這一切，大明基本上沒有任何參與感，隻能眼睜睜看著藏地脫離掌控，落入蒙古部落之手。
但現在，一切都不一樣了。
如今是天啟四年，1624年，距離外喀爾喀蒙古領主卻圖汗南下青海還有八年，距離黃教邀請固始汗入藏更是還有十一年。
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更重要的是，林丹汗被王毅率領的騎兵打得連連西遷，又因改信紅教，被蒙古諸部落排斥，如今正盤踞在青海一帶，與土默特部打得難解難分，青海正是一片混亂。
沒有了土默特部的有效牽製，藏地的黃教，日子比原本歷史上還要艱難，已然到了山窮水盡的地步。
朱由校想起這段時間大都督府傳來的情報，心中愈發清楚。
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