廷和帝國主義一度中斷的關係，畢竟國家沒有實力，個人的實力再強也沒有用，就像當初的李中堂一樣，雖然他自詡要比日本的那些人強，但是在那些人麵前他還不是要陪著笑臉。
後來他當上了參預政務大臣，辦理新政。政務處的實權掌握在榮祿手中。從表麵看，清政府的各項新政似乎是在貫徹康、梁變法的精神，而實質上卻是洋務運動的繼續和發展，。各省督撫鑒於變法失敗的教訓，開始對“新政”大都敷衍搪塞，存心觀望，畢竟戊戌變法的影響太大了。而他自己則是憑著政治敏感，對朝廷推行新政的用意心領神會，他看出必須進行一些“改革”，才能爭取人心，以擺脫這種弱國的命運。所以在山東時他對新政就表現出異乎尋常的熱心。1901年4月，他曾奏陳十事：“慎號令”，“教官吏”，“崇實學”，“開民智”，“增實科”，“重遊曆”，“定使例”，“辨名實”，“裕度支”，“修武備”，請求清廷“甄擇”。並建議以越王勾踐臥薪嘗膽和日本“明治維新”的精神，“切實整頓，力求富強”。紒紜矠同時，他在山東整頓財政，創立了銀元局、課吏館、校士館等新政機構。10月28日在致徐世昌函中，他自鳴得意地說：“自強各要政，現已湊有的款，比初到東時司庫如洗者，可謂甚富省分矣。”紒紝矠到直隸後，他更大刀闊斧地乾起來，其所辦的新政包括籌餉練兵、創辦巡警、興學、立憲等，而以籌餉練兵為中心。這也是他人生最自豪的事情之畢竟這些都是在自己的支持下辦起來的。
而他真正的輝煌卻是在北洋，為了練新軍，他提出一百萬兩銀子，作為募練新兵的費用。又參照曾文正公練湘軍初期的辦法，定出《募練新軍章程》十九條，如規定所募兵丁，須有確定籍貫，並代扣贍家餉銀等。派王士珍、王英楷赴正定、大名、冀州各屬，會同地方官，選募壯丁六千，分別帶領至保定訓練，編為十營，稱“新練軍”。6月，又仿效德國常備軍製度，定出《北洋常備軍營製餉章》，規定常備兵支給全餉，每月餉銀四兩二錢；在營三年退為續備兵，月支餉銀一兩；又三年退為後備兵，月餉減半；平時各就其業，冬季調操一月，發全餉；又三年除其軍籍，不豫征調；並以“新練軍”六千人為基礎，創練“北洋常備軍”。同月，在保定成立北洋軍政司，作為全省“軍務總彙之所”，他自兼督辦。軍政司下轄兵備、參謀、教練三處，以劉永慶、段祺瑞、馮國璋分別提任總辦。這個機構不僅是1903年末中央成立練兵處的藍本，也是1904年各省設立督練公所的楷模。同年底，清政府任命他為京旗練兵大臣，從駐北京的旗兵中挑選三千人，分批派到保定進行訓練，稱“京旗常備軍”。他怕嬌生慣養的旗兵不聽擺布，就奏派青年貴胄鐵良為京旗練兵翼長。
在朝廷的不斷催促下，1902年底至1903年初，各省督撫也陸續開始編練新軍。但“軍製操法器械未能一律”。朝廷一方麵想改變各省兵製不一的紛亂局麵，另一方麵又擔心形成由漢族軍閥掌握的統一的軍事力量，難以控製。當時，除北洋軍外，以湖廣總督張之洞所練的新軍為最優。朝廷決定以北洋軍和湖北新軍為主乾，使其平行發展，形成兩大軍事係統，以便互相牽製。1902年12月12日，清政府命令河南、山東、山西各省“選派將弁頭目赴北洋學習操練。江蘇、安徽、江西、湖南各省選派將弁頭目赴湖北學習操練。俟練成後，即發回各原省令其管帶新兵，認真訓練。每年由北洋、湖北請旨簡派大員分往校閱，按其優劣，嚴加甄別”。
這也是他最喜歡的時期，因為在這個時候北洋還是一個心思，不像現在這麼多人有著這麼多的心思，當時的北洋隻聽他一個人的。
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袁世凱不斷的回憶著一幕幕當年自己的往事，最後他真的發現自己老了，自己真的老了，再也不像以前那樣敢打敢拚了，自從他當上了這個大總統，就再也沒有想過被別人打敗，他一直認為這個國家已經讓自己給摸透了脾氣，因此他才會和國民黨的軍隊開戰，他才會和西南的軍隊開戰，他才會不給任何人麵子，但是現在他忽然覺得他錯了，他大錯特錯了，這並不是他能夠完全控製的國家，他對於這個國家的脾性還沒有弄清楚。
“嗬嗬，嗬嗬”袁世凱看著自己手中的那種當年給李鴻藻的信劄初稿，大聲的笑道，不過他的笑聲中更多的是一種無奈是一種悲傷。
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