平一方麵對台灣的民眾實施苛酷的鞭撻，但在另一方麵又施以懷柔政策，以所謂的“治台三策”為幌子，玩耍貓哭老鼠的伎倆，處心積慮地推行帝國主義的殖民統治政策。在對台灣的經營中，他將其“生物學的殖民地經營原則”發揮得淋漓儘致。後藤新平以“漸進同化”為目標，大力推行統一台灣的幣製，以促進金融與商業的流通；同時還推動各種交通運輸企業及鐵路、海港、公路等交通設施的建設；開發水利與火利發電廠，從而奠定了台灣發展工業的動力基礎；他還在台灣原本就有良好基礎的蔗糖業中，引進新式製糖技術、經營模式以及大量資本，促使台灣的蔗糖和稻米產業有了很快的發展。兒欲源太郎雖然是這一階段的台灣總督，但他又於1900年12月兼任了伊藤博文內閣中的陸軍大臣；1903年7月出任桂太郎內閣的內務大臣；1904年日俄戰爭爆發後，又即任滿洲軍總參謀長。因此，有“缺席總督”的稱謂。從1898年至1906年的8年間，在台灣地區積極推行日本殖民統治政治的魁手就是時任民政長官的後藤新平。由於其所謂的政績，獲得了“殖民地經營家”的稱謂。後藤新平作為一位殖民地的經營開發者，其出發點自然是不會為殖民地的民眾謀取社會福利的。相反這些開發卻帶有強烈的剝削壓迫和掠奪的xing質。後藤新平就曾多次於不同的場合提出過這樣的觀點，殖民地的行政計劃在目前進步的情況下，應不失時機地根據生物學的原則，發展農業、工業、衛生、教育、交通、警察等。
1906年，受兒欲源太郎的舉薦，後藤新平出任南滿洲鐵道株式會社首任總裁。期間更以“舉王道之旗行霸道之術”，提出“文裝的武備”這一殖民主義統治政策。使南滿洲鐵道株式會社的經營擴張一步步發展起來。籌建滿鐵時，日本政fu曾規定滿鐵受關東都督監督，同時還要受外交大臣的指揮，政fu和現地軍部均可乾預其業務。對此，後藤新平強烈反對，他要求滿鐵兼任關東都督顧問，政fu不乾涉選任滿鐵副總裁和各理事，得到日本政fu許可，總攬了日本在我東北的殖民統治大權。為更有效地掌握地方行政大權，他要求日本政fu任命滿鐵副總裁為關東都督府民政長官。當時，滿鐵本社設在大連，關東都督府設於旅順，日本政fu偏重經營大連，默認了後藤新平的要求，確立了以大連為中心發展滿鐵事業的方針。由於設在旅順的關東都督府由軍部把持，軍部到處設立“陸軍用地”、“海軍用地”的界牌，後藤新平指責旅順患了“軍人病”，提出“旅順解放論”與軍部相對抗。1908年，他又進一步提出“舉王道之旗行霸道之術”的殖民政策，在發展經濟的同時，發展殖民教育、文化、衛生等事業，以征服人心，構成潛在軍備。大連的病院、旅順工科大學、滿鐵中央試驗所以及新聞機構等設施，都是他的殖民政策的產物。此後，滿鐵以大連為殖民擴張軸心，把投資重點放在大連，扶植南滿鐵路的運營，續建、擴建大連港口，大力發展工業，開展貿易，興辦教育，使大連按照他設計的殖民地模式發展起來。
後藤新平在入主滿鐵後迫不及待地提出了“文裝的武備”這一殖民主義統治策略。所謂的“文裝的武備”這個詞，隨著時間的流逝其具體內容也逐年有所不同。最初的“文裝武備”簡而言之，就是用文事設施，以備外來的侵略，能夠在突發事變時兼可有助於武力行動。後藤新平的這一主張，形象地說，就好象是在文人的服裝內裹著一個體格強健的軍人。但有一點是可以肯定的，後藤新平這裡就是要在中國的東北通過以發展經濟力量的方法，來達到增強軍事實力的目的，而不是露o地去加強軍事力量。其實在他的“文裝的武備”統治策略中還有另外一種含義，就是要把其在台灣所施行的慣用手段“王道與霸道”更好地運用於滿鐵的施政管理之中。後藤新平從一個殖民擴張主義者的立場出發，認為“帝國的殖民政策就是霸道”，就必須是以強硬的手段來加以推行和實施；但同時又應不失適宜地推行“王道”。所謂“王道”，就是要通過以“發展經濟、學術、教育、衛生等”，達到“建設一個廣義的文明社會”。後藤新平也正是妄想通過這些具體的措施來達到籠絡人心，磨滅中國人民的民族精神，“使之皈依帝國”。這裡的“王道”隻是一種手段，具有極大的隱蔽xing和欺騙xing。而“霸道”才是根本的目的。就是要把滿鐵所能達到的區域，統統地變成日本的屬地。正是在這種“文裝的武備”的思想指導下，滿鐵建立了一係列的科技、文教、衛生設施。開辦大量的學校，大肆進行殖民主義的奴化教育，企圖為日後長期殖民統治培養人才；建立諸多的醫院，並力爭使每一所醫院都具有野戰醫院的功能。成立滿鐵中央實驗所，全麵推進和開發對中國東北的科技殖產。
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