隨著第二軍團的艦隊在大遠征中為帝皇和帝國收復了一個又一個世界，原體也與自己一個又一個兄弟相逢、合作。
暗黑天使
第一軍團的原體萊恩是第一個與原體見麵的兄弟。在原體回歸之前，第二軍團曾經在萊恩的指揮下戰鬥過一段時間。而原體回歸後，萊恩也對這位第一次見麵就不同尋常的兄弟表示出了相對濃厚的興趣。萊恩是唯一一個對第二軍團政治體係表示過興趣的原體。在萊恩眼中，第二軍團的政治體係與第一軍團的內環體係有異曲同工之妙，都是為了加強對部隊控製而造成的產物。基於這種認識，萊恩甚至建議原體將政治體係「隱藏」起來，認為第二軍團當前的政治體係過於「光明正大」會讓很多不能見光的工作難以進行。當然，在原體向他詳細講述了政治體係的意義、用途之後萊恩便失去了興趣，但不可否認，第一軍團原體依然是對軍團最有善意的人之一，甚至第一軍團的不少遺物級裝備都曾開放給第二軍團進行研究。
帝皇之子
第三軍團對第二軍團的態度就不太友善。一方麵，第三軍團認為第二軍團的士兵們既不優雅，也不精致，彼此之間的關係也過於親密和隨意。特別是第二軍團對待凡人「僕役」（實際上在原體回歸之後，第二軍團就廢除了僕役）實在是太過仁慈和軟弱。對於原體甚至會在閒暇時跟船艙底層的工人一起修理設備、扛運重物的行為，第三軍團原體福根也認為是他自降身份，對於自己帝皇兒子身份的不尊重。
同樣的，第二軍團的戰士們對第三軍團也不怎麼感冒。不止一個政治導師私下嘲笑第三軍團是一群矯揉造作的娘娘腔。在軍團內部的出版物裡，甚至有過對第三軍團「脫離帝國人民」、「自視甚高」的專版嘲笑。雖然這篇文章被原體緊急下令撤稿而沒流傳出去，但毫無疑問反映了軍團大部分人對第三軍團的不屑。
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兩個軍團的另一個矛盾在於對帝皇本人的態度。在福根和他的軍團看來，第二軍團缺乏對帝皇的儀式化崇拜，就算是戰鬥口號裡，「為了帝國」也排在「為了帝皇」之前，這在以「帝皇之子」為名的第三軍團眼中無疑是一種褻瀆。而在第二軍團眼裡，帝皇不應該是個神聖的符號，他是個有血有肉、有自己理想和煩惱的人。第二軍團尊敬帝皇，第二軍團服從帝皇，但第二軍團絕不把帝皇供上神壇。對第二軍團來說，帝皇是領袖，是導師，是人類的引路人，尊敬帝皇的最好方式是遵照帝皇的願景，為了全人類的未來奮鬥終身。
福根曾經跟原體當麵爭論究竟應該如何對待帝皇。據後來軍團記載裡描述：兩個人的爭論一開始就非常激烈，相互認為對方對待帝皇的方式是「褻瀆」。爭論到高潮時，麵對福根指責原體對父親缺乏尊重時，原體反唇相譏：「哈？難道尊重我們父親的方式就是一輩子做一個想要搞出點動靜取悅自己父親的孩子？不！他更希望我們是一個有思想、有能力、可以為了他的理想和全人類的未來奉獻自己的幫手！」
爭論最終在荷魯斯的乾預下沒有發展成鬥毆，兩名原體不歡而散。從此之後兩個軍團再也沒有過合作記錄。原體在這次爭吵後也曾私下裡對帝皇之子的不健康心理狀態表示了擔憂。
鋼鐵勇士
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第四軍團對待第二軍團的態度跟他們的原體一樣，不冷不熱。一方麵，第二軍團對第四軍團崇尚科技、對戰略戰術的重視表示欽佩，雙方之間技術、戰術交流比較頻繁。佩圖拉博雖然對原體的態度不冷不熱，但對原體的交流要求一般儘量給與滿足。甚至一度有一隊鋼鐵勇士在一名戰爭鐵匠的率領下常駐在軍團旗艦，共同研究和開發在大遠征時尋回的黃金時代人類科技以及部分異形科技造物。
唯一讓第二軍團不解的是第四軍團內部瀰漫的怨氣——這種怨氣部分來自於他們所承擔的任務。在第二軍團看來，自己應當是帝國的一塊磚石，隨時準備被用在需要的地方，而第四軍團卻為此變得如此不滿實在是匪夷所思。因此，軍團曾主動要求接替了第四軍團的部分「不受歡迎」的任務，這讓第四軍團的戰友們非常感激，但這不包括他們的基因原體——鋼鐵之主認為這是第二軍團在給自己難堪。
痕疤色白
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