當原體走到皇宮門口時，迎接他的是帝皇的嚴厲斥責。帝皇以從未有過的嚴厲語氣斥責原體忘記了銀河中鬥爭的殘酷性，並讓他跪倒在永恆之門前的紀念廣場上為每一個因為自己「指揮失當」喪失生命的戰士懺悔。
通常而言，帝皇對自己的這些超人子嗣並不會使用太嚴厲的態度，除非像羅嘉.奧瑞利安那樣極大忤逆了大遠征計劃的原體。而對於第二軍團原體這個一直與帝皇亦父亦友的原體這種態度更是從未出現過。帝皇在稱呼中不再使用原體的名字，甚至連「兒子」的稱呼也不曾出現，卻使用了表達陌生態度的「第二號基因原體」，這讓在場禁軍不由生出些許詫異。看著帝皇的態度，淚流滿麵跪在犧牲將士紀念碑前的原體甚至一度以為下一秒帝皇就會命令禁軍當場逮捕自己。
但這一切始終沒有發生。當原體抬起頭時，怒火中燒的帝皇已經不見了蹤影，帝國宰相馬卡多則向他宣布了帝國和帝皇的裁決：第二軍團將被流放到帝國邊疆之外甚至銀河之外，進行一次「贖罪遠征」。
原體失魂落魄的回到了自己的戰艦上，帝國政務院將進一步的命令送到了原體手上。第二軍團被命令在自己的母星上休整一年之後要立刻啟程。而原體能帶走的部隊也不是軍團的全部——當時軍團剩餘的部隊中，有大概三分之一正在銀河各處執行著各種作戰或者建設任務，來不及在一年之內趕回母星。根據帝國政務廳的命令，這些部隊從此將脫離第二軍團編製，由各軍團就近接手（其中大多被第七軍團和第十三軍團接納，這對原體和軍團來說是個相對較好的結局）。
第二條命令則讓人有些摸不清頭腦。帝國授予了第二軍團開發未知星球、可以在帝國邊疆星域中徵兵、徵集資源和收繳什一稅（不得超過帝國官方稅額）的權力。並允許軍團募集平民參與遠征。
第三條命令是：目前在第二軍團遠征隊中的其它軍團人員將作為代表和證人參加第二軍團的遠征。
對於這個命令，軍團上下非常牴觸。在他們看來：這是帝國對自己擺在明麵上的不信任。也有一些人自我安慰：其它軍團的人員是作為證人和代表而非監軍參加本次遠征，這說明帝國和帝皇並對軍團還沒有徹底的喪失信心，他們依舊是一支被信任的部隊。
然而這個幻想在遠征即將開始前一個泰拉月被徹底打破：一支禁軍百人隊和兩個寂靜修女中隊被作為監視者派到了軍團遠征艦隊，這樣赤裸裸的不信任幾乎讓軍團士氣跌入穀底。但好在不論是禁軍還是寂靜修女都很清楚自己的責任，對軍團表示了一定程度的善意，並表示：除非與自己的任務相悖，他們在遠征中將服從原體的命令。至於他們的命令是什麼，這些戰士三緘其口，堅決拒絕回答。
遠征的準備工作是在一片沉悶和低落的環境中完成的。唯一的好消息是，軍團人員雖然低落，但到底沒有絕望，所有的命令都被一絲不苟的執行著，直到最後的遠征日到來。
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隨著遠征日的到來，軍團艦隊告別了母星，告別了帝國，告別了自己熟知的銀河。母星人民拖家帶口前來送別艦隊，一如他們之前每一次送別。還不知道內情的母星人民歡呼著向艦隊和穿梭機拋灑鮮花，仿佛期待著這些自己的勇士在不久的將來就能凱旋歸來，這讓軍團所有人的心都沉重無比：所有人都知道，這些人註定看不到自己歸來了，而自己也
註定再也看不到母星——這是一場不知道時間、不知道前路的遠征，即使是阿斯塔特，也不能保證自己一定能活著等到歸期。
看著舷窗中逐漸遠去的星球，艦隊中上至原體，下至底層船艙的船工，所有人都望向了自己對母星唯一的牽掛——在自己的懷中一小袋來自母星的塵土。遠征艦隊中所有人都達成了一致：在遠征途中不幸去世的人將被燒成骨灰統一保管，不論遠征持續多少年，都要讓活著的人帶回家鄉。
遠征的前十年，遠征軍籠罩在一片愁雲慘澹中。
被帝國放逐的屈辱、再也回不去母星的哀愁以及未知前路的惶恐讓遠征軍的士氣長時間在穀底徘徊。艦隊在這十年中處理了上萬起自殺事件，其中甚至包括了一名阿斯塔特老兵。
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