怎麼一回事。
最後，他從一個叫做AZ的人那得知了事情的真相，原來是之前弗拉達利的首領啟動了最終兵器，導致在稜鏡塔內的守護裝置昂主出現了異常。
一開始情況尚且還在可控範圍，但最近密阿雷市中的不少精靈已經開始受到影響了，有許多狂暴的精靈甚至會去主動攻擊人類，還有一些精靈深山不知道為什麼攜帶著MEGA進化石，受到昂主能量的照射，導致精靈不需要訓練家就能進行MEGA進化。
隻不過這種MEGA進化會讓精靈理智全失，能量暴走不可控。
整個密阿雷市亂成了一鍋粥。
最終AZ和闊星公司想出了一個計劃，那就是決出一名最強訓練家，由那名訓練家去稜鏡塔內阻止昂主。
而想要阻止昂主，就需要AZ身邊的一隻精靈，存活了三千年的遠古花葉蒂。
隻有實力強勁的訓練家，才能操控遠古花葉蒂，讓其進行MEGA進化，從而阻止昂主。
這份責任最終也是落在了冠軍小智的頭上，他也不負眾望的搞定了稜鏡塔的事情。
但卻不是依靠花葉蒂，而是靠著甲賀忍蛙和基格爾德的力量。
【進階者小智：甲賀忍蛙是卡洛斯地區的精靈吧？基格爾德是守護世界生態的守護神，這兩隻精靈能夠產生配合嗎？】
由於冠軍小智隻是粗略的講了個大概，小智也不清楚具體細節，隻是在聽到甲賀忍蛙和基格爾德配合的時候感覺十分怪異。
這就好像你說讓大嘴雀和鳳王配合去解決世界危機一樣，太怪了吧！
【冠軍小智：我的這個甲賀忍蛙有點不一樣，不僅僅是我，所有的小智」都是如此，包括你新人，有朝一日，你也會遇見你命定的呱呱泡蛙的，到那時候你就明白我說的是什麼意思了。】
冠軍小智隻是粗略的提了一嘴便一筆帶過了，有的時候說的太多的話，或許會影響命運本身所發生的事情，所以他並沒有打算將甲賀忍蛙的特殊之處告訴小智，而是接著往下講。
解決了稜鏡塔事件後，密阿雷市的異動還沒有結束。
在密阿雷市之中出現了一些特殊的異空間，異空間中是顏色灰暗的密阿雷市，裡麵有著諸多地區的精靈。
而且隨著時間的流逝，異空間密阿雷的範圍正在逐漸擴大，而現實的密阿雷則是在被逐漸吞噬。
於是冠軍小智找了個關係，將胡帕給找了過來，藉助胡帕的能力他總算是搞懂了異空間的出現的一些規律，以及鎖定了異空間的始作俑者—達克萊伊！
那隻達克萊伊吸收了昂主溢出的超級能，導致自身進行了MEGA進化暴走了。
利用噩夢神的能力，將夢中世界映照到了現實中，導致密阿雷市被夢境吞噬。
在冠軍小智將達克萊伊擊敗後，密阿雷市的異動才總算結束了。
異動雖然結束，但因為異空間的出現，導致有更多的MEGA進化精靈被發掘，可那些在異空間裡麵所發現的MEGA進化精靈，在現實世界中卻沒有辦法MEGA進化。
最終，冠軍小智發現了原因。
那就是那些精靈體內潛藏的基因鏈並沒有被激發出來，所以做不到和MEGA進化石共鳴，所以才會無法進行MEGA進化。
異世界密阿雷市的原理是噩夢那裡麵充斥著整個密阿雷市民眾的幻想。
所以一些精靈體內潛藏的基因鏈無意間在夢境之中被激發了出來，最終導致他們可以在異世界的密阿雷裡麵MEGA進化。
路卡利歐的另一種進化形態就是如此。
可如果你的路卡利歐沒有進入過異世界密阿雷的話，就沒有辦法依靠夢境的力量激發出潛藏的基因鏈，那便會導致路卡利歐無法利用另外的一枚進化石進化。
【進階者小智：也就是說，我想要讓路卡利歐進化另一種MEGA形態，還需要先找到達克萊伊？】
【冠軍小智：這隻是其中一種辦法而已，現在你知道原因的話，為什麼不用你神奇的波導之力試試看能不能激發出來呢？】
夢境的激發隻是其中一種方法而已，如果是別人的話，那除了復刻冠軍小智那邊的事跡外，還真沒有辦法去激發出精靈的基因鏈。
畢竟這種東西涉及到精靈基因方麵，一般隻有研究員能想想辦法，訓練家的話就洗洗睡吧，那可不是靠著訓練什麼的就能激發出來的。
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