西班牙王城的士兵，就是依託王城的棱堡和火炮，才能抵抗大漢呂宋軍的進攻。
棱堡城牆坍塌，火炮失去作用的時候，戰鬥也就沒有懸念了。
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有士兵試圖在城牆下方集結，在街道上抵抗漢軍的進攻，但是全都頂不住一個衝鋒。
進攻部隊很快就控製了總督府、城堡、教堂等關鍵機構，然後打開了城門。
菲律賓總督阿爾塞多、主教岡薩雷斯、陸軍團長加西亞等人，看到大群士兵挺著刺刀衝進總督府的大廳的時候，立刻高舉著雙手跪地投降：
「我們投降！」
「投降！」
「不要殺我。」
士兵其實聽不懂他們在吼什麼，但是既然跪在地上舉起了雙手，也就被視為是投降了。
於是一部分士兵端槍盯著他們，幾個士兵上前去將他們控製住，將雙手拉到背後綁住。
阿爾塞多三人被捉之後，心中反而鬆了口氣，不斷地在心中自我安慰：
「雞和狗都不留隻是威脅，他們還是能夠接受投降的。」
「能接受投降就好，能投降就好啊……」
當天下午四點多的時候，大漢呂宋軍主力基本控製了西班牙王城。
城內的將近三千名士兵，有大約一千人在混戰之中被殺，剩餘的全部繳械投降。
城內的將近兩萬居民，麵對挺著火槍和刺刀的士兵，也沒有集體對抗，全都服從管製了。
陳化成安排士兵把軍隊先押解出城，安排五千名士兵駐紮在城中控製局勢。
另外安排軍隊在城外打掃戰場，將己方的傷亡統計出來。
攻破西班牙王城後，馬尼拉戰役基本結束，大漢軍隊戰死總計六十五人。
其中有五個是在攻占甲米地的時候戰死，三個是在控製馬尼拉城區的混戰中戰死。
二十個是在壓製城頭火炮時中彈戰死，三十七個是在最後奪取西班牙王城的肉搏中戰死。
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另外有一百二十八人受了不同程度的傷。
若是不是因為軍隊進攻欲望格外強烈，衝鋒和肉搏的時候不夠謹慎，傷亡會更加輕微。
第二天上午，陳化成親自指揮親兵，將所有的戰死士兵放入棺木中收殮。
然後安排兩千名士兵作為儀仗隊，將他們送到了西班牙王城南三公裡外的臨時大營南側。
安排士兵挖掘葬坑，將他們的棺木分別放入坑中，但是暫時先不掩埋。
另外兩萬名士兵兵分多路，將城中的所有白人、白人的配偶、白人和他族的混血子女，全部驅趕到墳地的南方。
命令所有人排成隊伍，在墳地前麵依次跪下。
成年男人在最前方，總督阿爾塞多、主教岡薩雷斯、陸軍團長加西亞被驅趕到最前排。
三人以為這是要求自己向戰死的士兵贖罪，就按照要求跪在了墳地前。
然後他們身後的士兵挺起刺刀，捅穿了他們的胸脯。
三人都感覺胸口突然傳來劇痛，下意識的低頭，就看到了從胸口出來的刺刀尖：
「你們……為什麼……要殺我……」
三人難以置信，目眥欲裂，帶著滿臉的驚愕，慢慢的摔倒在地上。
腦海中最終的念頭是：大漢果然說話算話。
周圍的士兵圍攏上來，將其他的成年男性也全部捅死。
有人驚恐的用漢語求饒：
「不要殺我，我娘是大漢人，我是大漢人啊……」
士兵毫不留情的捅死他，然後還要踢一腳，再罵一句，：
「婊子養的雜種，你算什麼大漢人……」
還有懂漢語的西班牙傳教士和土人，他們絞儘腦汁的展現自己的特徵求饒：
「我們會說漢語，我們可以給大漢當翻譯，我們願意遵守大漢的法律，我們願意效忠大漢皇帝，我們也想當大漢人……」
士兵同樣毫不留情，直接捅死還要再罵幾句：
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