容易地把自己的應用軟件轉換成可供CE運行的版本，因此，WindowsCE的可使用軟件的種類將會越來越多的。
WindowsCE3.0
WinCE3.0是微軟的WindowsCompactEdition，是一個通用版本，並不針對掌上產品，標準PC、家電和工控設備上也可以安裝運行，但要做許多客戶化工作，當然也可以做掌上電腦。微軟鼓勵大家在任何硬件平台(WinCE3.0支持5係列CPU:x86,PowerPC,ARM,MIPS,SH3\/4)上使用（為了和VxWorks,Linux等競爭），所以早期的WINCE運行在不同的硬件平台上，而且可以更換顯示方向，以便為不同的平台服務。WinCE3.0屬於付費軟件，安裝許可（Licence）費用為$20，10份起，批量時大致能降到$15\/一份。
2000年微軟公司將WinCE3.0正式改名為WindowsforPocketPC，簡稱PocketPC。就是把PocketWord和PocketExcel等一些日常所需的辦公軟件的袖珍版裝了進去PocketPC，同時在娛樂方麵的性能做很大的加強。當然對於微軟的所有舉動，捧場的廠商自然也不會少，加入PocketPC陣營的現在就有HP、Compaq、Casio等一些著名廠商。當Compaq的iPAQ3630的誕生和在市場的熱銷，支持和加入PocketPC陣營的廠商就越來越多。2002年智能手機商機再現，不少PPC廠商希望推出整合手機功能的PPC，於是在2002年8月，專門為手機優化過的微軟PocketPC2002PhoneEdition操作係統匆匆問世，2002年10月，國內第一款PPC手機--多普達686上市了，隨後熊貓推出了CH860、聯想推出ET180，越來越多的pocketpc產品出現了。
WindowsCE4.0
WinCE.Net（即WinCE4.0）是微軟於2002年1月份推出的首個以.Net為名的操作係統，從名字上我們就可以知道它是微軟的.net的一部分。WinCE.Net是WinCE3.0的升級，同時還加入.NetFramework精簡版，支持藍牙和.Net應用程序開發。
WindowsCE4.2
WindowsCE.NET4.2是WindowsCE.NET4.0\/4.1的升級版，對WindowsCE先前版本的強大功能進行了進一步的擴充和豐富，基於其開發的設備將從這些微小但重要的變化中獲得更好的性能和更強的Windows集成功能。微軟在WinCE4.2版時曾提供開放源代碼，不過隻針對研究單位，而程序代碼較少，為200萬行。
WindowsCE5.0
WinCE5.0在2004年5月份推出，微軟宣布WinCE5.0擴大開放程序源代碼。在這個開放源代碼計劃授權下，微軟開放250萬行源代碼程序作為評估套件（evaluationkit）。凡是個人、廠商都可以下載這些源代碼加以修改使用，未來廠商OEM時，則再依執行時期(Run-time)授權，支付WinCE5.0核心每台機器3美元的授權費用，這也是微軟第一個提供商業用途衍生授權的操作係統。
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WindowsCE6.0
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