賄賂的細節，還有淳於長的親筆批注，是貪腐的鐵證。此外，他們還在抽屜中找到大量書信，其中就有幾封淳於長寫給許皇後的親筆書信，言辭曖昧，充滿挑逗之語，還詳細說明了助許皇後複位的計劃，約定了私會時間地點，落款清晰，無可抵賴。
隨後，王莽帶領陳武等人前往長定宮。長定宮守衛得知淳於長被拿下，早已人心惶惶，不敢隱瞞。王莽等人順利找到綠萼，綠萼見淳於長被抓、罪證確鑿，知道自己無路可逃，如實供述了為兩人傳遞書信、財物、協助私會的全部經過，還主動交出了留存的幾封書信，成為重要人證。
王莽將所有罪證整理好，連同淳於長的親信、綠萼一同押送到天牢，交給王根負責審訊。王根強撐著病重的身體，親自坐鎮天牢。天牢陰暗潮濕，彌漫著血腥味和黴味，刑具林立，寒氣逼人。
審訊開始後，淳於長起初還想狡辯，一口咬定自己被王莽誣陷，罪證是偽造的，綠萼是被脅迫的。但當王根拿出親筆書信、行賄賬本、綠萼供詞和行賄官員證詞時，淳於長的心理防線徹底崩潰。他癱坐在地上，臉色慘白，痛哭流涕，一一如實供述了自己貪腐、私通許後、結黨營私、欺壓百姓、出賣宮廷機密的所有罪狀，每一件都令人發指，足以株連九族。
王根坐在審訊席上，臉色冰冷，一邊聽供述一邊讓人詳細記錄，心中怒火難以遏製。審訊持續到深夜，淳於長的所有罪狀都被核實，鐵證如山。
審訊結束後，王根和王莽將所有罪證整理好，一同入宮向漢成帝稟報。漢成帝得知淳於長的所作所為後，震怒不已，拍案而起：“淳於長那廝，朕待他不薄，他竟敢背叛朕，私通廢後、貪腐結黨、敗壞朝綱，罪該萬死！”
王政君在一旁抹著眼淚說道：“陛下，老婦教子無方，縱容外甥，讓他做出如此大逆不道之事，老婦有罪。懇請陛下嚴懲淳於長，以正朝綱，切勿因他是老婦外甥而姑息。”
王莽躬身說道：“陛下，淳於長罪證確鑿，所作所為令人發指，不嚴懲不足以平民憤、正朝綱。懇請陛下下令將淳於長處死，誅連其黨羽，沒收家產救濟百姓，彰顯陛下公正無私。”
漢成帝沉默片刻，眼中滿是怒火與失望。他雖寵信淳於長，但淳於長已觸及底線，不嚴懲會失去民心與威嚴。“好！”漢成帝語氣堅定，“朕下令，將淳於長腰斬於市，株連其黨羽，沒收家產救濟百姓，其家屬全部流放三千裡，永世不得回京！”
“陛下英明！”眾人齊聲行禮。
就在此時，王莽上前一步，躬身說道：“陛下，臣有一事懇請。淳於長身為衛尉，掌宮廷宿衛多年，掌握大量宮廷機密，包括守衛部署、禁軍調動規律和陛下起居作息。若是將他腰斬於市，他臨死前可能泄露這些機密，被別有用心之人利用，危害朝廷安危。臣懇請陛下，下令將他在天牢中秘密處死，既嚴懲罪犯，也防止機密泄露，兩全其美。”
其實，王莽另有盤算——他要徹底斬草除根，防止淳於長臨死前反咬一口，泄露不利於自己的消息，比如搜集罪證的手段、拉攏王根的過程，甚至他穿越者的身份（雖淳於長不知，但王莽不得不防）。隻有讓淳於長秘密死去，才能徹底掌控局麵，保住自己的“聖賢”人設。
漢成帝點了點頭，覺得王莽說得有理：“好，就按你說的做。朕下令，將淳於長在天牢中秘密處死，不得泄露任何消息，其黨羽按律嚴懲，一個不留！”
“臣遵令！”王莽躬身領命。
離開皇宮後，王莽立刻前往天牢。天牢陰暗潮濕、寒氣刺骨，彌漫著血腥味和黴味，嘶吼聲、哀求聲不絕於耳。淳於長被關押在天牢最深處，牢房狹小陰暗，牆壁布滿血跡，地麵泥濘不堪，他衣衫襤褸、頭發淩亂，臉上滿是汙垢和傷痕，早已沒了往日的驕奢跋扈，眼中隻剩下絕望和恐懼。
看到王莽前來，淳於長眼中閃過一絲恨意，掙紮著想要撲上來，卻被獄卒按住。他聲音嘶啞，瘋狂咒罵：“王莽！是你陷害我！我到底哪裡得罪你了？你竟然如此害我！我做鬼也不會放過你！我要將你的陰謀公之於眾，讓你身敗名裂！”
獄卒想要嗬斥，被王莽抬手製止。王莽緩緩走到牢房門口，神色平靜，語氣冷淡：“淳於長，你落到今天這個地步，都是咎由自取。你貪婪無度、私通廢後、結黨營私、欺壓百姓，罪該萬死，就算沒有我，你也遲早會栽跟頭。我今日所做，不過是替天行道、為民除害、正朝綱罷了。”
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