計劃\"。這個作戰計劃要求太平洋海區部隊\"在西南太平洋部隊攻占菲律賓群島中部的作戰中，要給予掩護和支援\"。要求哈爾西的第3艦隊\"消滅在菲律賓或威脅菲律賓的敵海軍和航空兵\"。9月27日，尼米茲在計劃上簽字。這一切，充分體現了尼米茲和他的太平洋艦隊優良的協作精神。
隨著萊特灣戰役作戰計劃的日臻完善，一些深謀遠慮的軍官開始思考攻占該島之後的行動方向。當時爭論焦點主要集中於進攻台灣還是呂宋這兩個方案上。金上將堅持要在中國的台灣登陸，而麥克阿瑟在9月21日向美參謀長聯席會議提出，在兩個月以後他有能力在呂宋島發起登陸作戰。
許多將領也紛紛獻計獻策，試圖打破僵局。斯普魯恩斯主張直搗硫黃島和衝繩島：福雷斯特爾、謝爾曼主張根本放棄台灣，12月進軍呂宋，1945年初進攻小笠原群島和琉球群島。
謝爾曼的方案得到尼米茲、斯普魯恩斯以及陸軍第10集團軍司令巴克納將軍、中太平洋航空兵司令哈蒙將軍的支持。在9月29日一10月1日，金上將在舊金山召集的非正式會議上放棄了自己的主張，同意打硫黃島和衝繩島，而不打台灣，並表示將向參謀長聯席會議提出建議。
10月3日，美參謀長聯席會議對麥克阿瑟和尼米茲頒發了這次戰爭中最後一個重要的戰略指令：麥克阿瑟於1944年12月20日進攻呂宋島，尼米茲負責掩護和支援。尼米茲於1945年1月20日進攻小笠原群島、硫黃列島中的一個或數個島嶼（如流黃島），於3月1日進攻琉球群島中的一個或數個島嶼（如衝繩島）。
在萊特灣戰役即將開始之際，哈爾西不遺餘力地實施了大規模的空中轟炸。他的初步任務是切斷日本和菲律賓之間的交通線，儘可能多地消滅敵機。尼米茲通過哈爾西的報告，知道第38特混艦隊10月10日襲擊了衝繩島，11日掃射了呂宋機場，從12日起連續3天向台灣發動了攻擊，襲擊運輸艦隻、機場和島上設施，擊落了大批敵機，其中不少是艦載機。
空戰和空襲結果，日本損失飛機600餘架，損失艦船26艘。一而哈爾西僅僅損失89架飛機，另有2艘巡洋艦\"堪培拉\"號和\"休斯頓\"號被日機魚雷擊中，失去了自航能力。哈爾西指示一個特混大隊將受傷艦隻拖回烏裡錫島。
不料第二天，東京廣播電台宣布了一條驚人消息：\"我部隊自10月12日以後，連夜猛攻台灣及呂宋東部海麵的敵機動部隊，擊潰其過半兵力，迫使其潰退。\"廣播電台還報道日本各城市慶祝勝利的情況。為了抵消日軍的宣傳，尼米茲發表了一個新聞公報：\"尼米茲將軍欣悉，最近東京廣播電台所謂第3艦隊被擊潰的艦隻已被哈爾西營救出來，正在收回準備迎戰敵人。\"
就在日本國民還陶醉在\"勝利\"的彌天大謊之中時，麥克阿瑟率18萬之眾，在金凱德第7艦隊的738艘艦隻的運送與直接掩護下，在哈爾西第3艦隊的16艘航空母艦、6艘戰列艦以及73艘輕重巡洋艦和驅逐艦的支援下，直趨萊特灣。10月20日淩晨，美軍在萊特灣大舉登陸。
10月20日下午，麥克阿瑟將軍在菲律賓總統奧斯梅納陪同下，涉水上岸。他在驟雨中手持麥克風，向菲律賓國民演講。演講通過大功率電台反複播出：
這裡是自由之聲廣播電台，麥克阿瑟將軍在講話。菲律賓的朋友們：我回來了！托上帝的福，我們的軍隊又站在菲律賓這塊灑滿我們兩國人民鮮血的土地上了。……團結在我的周圍吧。讓我們在巴丹和科雷希多不屈不撓的戰鬥精神的鼓舞下繼續前進。站起來戰鬥吧！抓住一切有利時機進行戰鬥。
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為了你們的家園和子孫後代戰鬥吧！
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