國綱領》為藍本加以修改。
中共代表團提出《和平建國綱領草案》，提出諸如規定和平建國基本方針、保障人民自由權利、取消一黨專政以及改革軍事、財政經濟和文化教育等施政綱領。董必武對此作了說明。
章伯鈞主張製定綱領要以國民黨“一大”宣言《訓政時期約法》為依據，並參考中共及其他政黨的綱領、各界人士的意見。羅隆基認為中共的提案“很切合需要，可做討論根據”，並批駁了吳鐵城關於政協會議沒有法律根據的謬論。李燭塵批評了國民黨扼殺民族工商業的政策，提出了發展民族工商業的經濟建設方案。
經過鬥爭，會議最後通過了《和平建國綱領》。這個綱領在內容上雖然同中共的主張有很大距離，但確定了和平、民主、團結的方針，規定了政治民主化、軍隊國家化和黨派的平等合法為達到和平建國的途徑，規定人民有各種民主權利。
3.關於軍隊問題，這是鬥爭的焦點。國民黨仍然提出首先“軍隊國家化”，然後再“政治民主化”。青年黨提出了《停止軍事衝突實行軍隊國家化案》，表麵上主張政治民主化與軍隊國家化二者並重，實際強調“軍隊國家化為政治民主化的必要條件”，反映了國民黨的意圖。周恩來在《關於軍隊國家化問題》的發言中提出了中共關於軍事改革的十二項建議，著重指出軍隊國家化與政治民主化“不僅要平行前進，以達統一，而且要認識過去曆史的發展”。“如果以為先有軍隊國家化，然後才能政治民主化，那麼今天協商的問題，將用什麼方法來解決呢?政治協商會議，就要平心靜氣來商討，以達到政治民主化、軍隊國家化的目的。”
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民盟提出《實現軍隊國家化並大量裁兵案》，主張兩大原則：一是“全國所有軍隊應即脫離任何黨派關係，而歸屬於國家，達到軍令政令之完全統一(現役軍人脫離黨籍)”。二是大量裁減常備軍額。為達到這兩點，應即成立整軍計劃委員會，由國共兩黨軍事人員、非兩黨之軍事人員、非軍事人員參加；同時可聘請美國軍事專家為顧問。梁漱溟特別解釋說：軍隊國家化，“即是軍隊不屬於任何私人，任何地方，任何黨派所有”。這反映出中間勢力希望國共雙方都把軍隊交出來，由他們來代表國家，接管軍隊，建立資產階級共和國。會議最終達成的軍事協議，雖然規定了“軍黨分立”、“軍隊屬於國家”、“軍民分治”、“以政治軍”等原則，實際上未能解決什麼問題。
4.國民大會問題。對這個問題鬥爭特別尖銳，爭議最多，時間也最長。爭論焦點是1936年由國民黨包辦選舉的代表是否有效。
國民黨提出《關於國民大會之意見》，聲稱：“(1)民國三十五年五月五日召開國民大會；(2)第一屆國民大會之職權為製定憲法；(3)第一屆國民大會代表除已選出者外，其餘名額可使之合理增加；(4)第二屆國民大會於憲法頒布六個月內，依憲法之規定選舉召集之。”具體說，國大代表總數1440名，前已選出950名，尚需選出490名，其中240名由國民黨指定。這就是說，共產黨、民主黨派及其他代表隻有250名。
這樣的國大，受到中共、民盟和進步的無黨派代表一致強烈反對。章伯鈞提出國大代表必須重選，認為國大是一政治問題，而非“法統問題”，必須有黨派的合法地位，才能有真正的國大。羅隆基反對舊國大代表有效。郭沫若主張重新普選。中共為了避免談判破裂和爭取中間勢力，承認舊代表有效，但必須增加足夠量的新代表。
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