時，拿破侖才終於又抖擻起精神，發布了迅速采取行動的命令。
按照拿破侖的計劃，格魯希率第3軍、第4軍、第5軍的1個師、4350名騎兵，並攜帶96門火炮——總計約3.3萬人的兵力——奉命追擊和消滅普魯士人。然而，主要由於對普軍撤退的確切方向缺乏了解，拿破侖隨後簽發給格魯希的書麵命令不令人滿意，也不夠完整。與此同時，拿破侖還給內伊簽發了一道簡短而緊急的命令，命他與拿破侖派往馬爾拜的部隊協同動作，立即發起攻擊。
以上這些都很值得稱道，但這一切實在是太晚了。上午10時剛過，威靈頓便已巧妙地開始撤退了。而當拿破侖於下午1時到達馬爾拜的時候，內伊仍未發起進攻。即使在那時，在拿破侖的親自督察下，法軍仍有可能趕上並消滅威靈頓的部隊。但恰在這時，一場持續不斷的大雨把郊外變成了一片水澤，道路被堵塞了。曆史竟這樣具有諷刺意味，一個曾經說過“我也許會失去一場戰鬥的勝利，但我絕不失去一分鐘”的人，竟會白白失去5個小時的寶貴時間，從而失去了一場戰爭的勝利。
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