到施勒茲和霍夫，以保護其左側翼。普軍的全部集結都是在叢林密布的圖林根山林和弗蘭肯山林的遮掩下進行的。那道長八十英裡，高達千米的山巒構成了北邊的易北河盆地與南邊的美因河左側支流之間的分水嶺。圖林根山是埃爾茨山脈向西的延伸部分，它將薩克森和波西米亞分隔開來。
拿破侖根本沒有料到普魯士會有任何敵對行動。8月中旬，他還在考慮把大軍團的大部分從德意誌撤走的問題。7月20日，俄國代表已在巴黎與法國簽訂了一個和平條約。8月6日，他寫信給正在布勞瑙密切注視奧軍的蘇爾特說：
對俄和約以及我與英國人正在進行的談判都使我深信一切都會很快地平靜下來，而目前所進行的這些軍事行動必將繼之以持久的和平。
8月17日，他寫信給貝爾蒂埃說：
我們應該認真考慮調回大軍團的問題，因為在我看來，有關德意誌的疑慮已經完全澄清。你也許會宣布大軍團即將行動，但實際上，在我得知對俄和約批準之前，我是無意把布勞瑙交還給奧地利人的。此時，應停止一切戰爭準備，不要再讓部隊渡過萊茵河，所有人員都要作好返回法國的準備。
但是，9月3日，拿破侖獲悉沙皇8月24日已拒絕批準7月20日簽訂的條約，所以，他又打消了準備讓軍隊退回法國的念頭。不過，次日，他又給他的兩個軍長內伊和達武批了三周的假，因為他們兩人的夫人都快臨產了。貝爾蒂埃也被告之可以返回巴黎休假。
9月5日，拿破侖收到了普軍正向其南部邊界移動的情報，於是立即征召1806年度的五萬新兵和三萬後備軍。當天，他寫信給貝爾蒂埃說：
歐洲事態的新變化迫使我認真地考慮我軍的處境。
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他指示貝爾蒂埃派工兵軍官去偵察班貝格至柏林的道路，並要求大軍團各軍作好準備在八天之內在班貝格-拜羅伊特地區集結。
我的意圖是，八天之內，所有各軍都應在克羅納赫以遠集結。我估計從班貝格邊界的集結地到柏林大約有十天的行程。……我想知道薩勒河和埃爾斯特河在格拉的情況。……易北河在維滕貝格處的渡口情況又怎樣？德累斯頓、托爾高和馬格德堡等鎮的設防情況如何？將在慕尼黑和德累斯頓所能弄到的最好的地圖都收集起來。派情報官去德累斯頓和柏林弄清普軍此次調動和集結的真實意圖。你在搜集情報時務必非常慎重，因為我尚無意與柏林為敵；我之所以要這方麵的詳細情報，主要是以防不測。我以為馬格德堡是班貝格與柏林之間的唯一要塞。
不出一周，他就了解到普軍意在一戰，他在9月19日寫信給貝爾蒂埃說：
普軍的行動依然十分奇怪。是得教訓教訓他們。明天我就把我的馬先送走。近日內即命近衛軍出發。如果情報證實普軍的確發瘋了，我將直接前往維爾茨堡或班貝格。
他命令其禦廄總管科蘭古將其八匹馬和所有的望遠鏡都先送走，但對外卻揚言他不過是去貢比涅打獵而已。
9月19日，拿破侖命大軍團在10月的第一周內完成初步集結，其序列如下：
第一軍，貝爾納多特，二萬五千人，班貝格；
第三軍，達武，三萬三千人，班貝格；
第四軍，蘇爾特，三萬五千人，安貝格；
第五軍，拉納，二萬三千人，柯尼學芬；
第六軍，內伊，二萬一千人，安斯巴赫；
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