個軍中，凡到達普法芬霍芬的部隊部應出動，進攻查理親王的後尾部隊，或弗賴辛和莫斯堡之間的部隊。一切跡象表明德意誌戰事在18、19和20日之間即可告終。……我認為如果烏迪諾軍和你的三個師於拂曉前出發，而且如果在此關鍵時刻你們能有力地指導我所有部隊應該如何行動，那麼敵人必敗無疑。……你們此次行動至關重要，因此我本人可能隨同你們一道行進。
信末，拿破侖又附記：積極，主動，迅速！
4月19日，拿破侖將其大本營前移三十七英裡至因戈爾施塔特，他原來預料那一天會發生主力會戰，但形勢發展比他預想的要慢，這部分是由於他下達給達武的命令被耽擱了，部分是由於奧軍結構臃腫行動遲緩。查理大公在達武和勒費弗爾防守正麵(位於雷根斯堡和錫根堡之間)部署了四個軍，且由席勒指揮的另一個軍則在伊薩爾河穀構成其左翼。現在法軍已與敵軍全線接觸，馬塞納的前衛，在從普法芬霍芬向弗賴辛推進時，已俘虜了席勒軍四百人。中午時分，拿破侖給馬塞納又下達了一道命令：
將烏迪諾軍推進到奧和弗賴辛。我將根據今天獲得的情報再指揮你們從奧和弗賴辛推進到蘭茨胡特。這樣，查理大公就會發現其交通線被切斷，由於他們有伊薩爾河作屏障，我們將攻擊其左翼。……所有這些都必須在今天之內予以解決，時間寶貴，分秒勿失！
4月20日，拿破侖將其大本營又向前推進了十二英裡到達多瑙河上的沃堡，距前線不足十英裡，戰況正在發展。拉納和貝西埃爾從西班牙趕到了皇帝的大本營。拉納奉命指揮由達武的兩個師臨時編成的一支部隊，貝西埃爾則奉命指揮馬塞納的前衛騎兵。上午6時，拿破侖給馬塞納又下達了另一份指示：
今天上午收到的所有報告表明敵人正全線潰逃。戰場上敵屍橫陳，而法軍到目前為止僅兩個軍和一個巴伐利亞師投入戰鬥。我正要騎馬去偵察前哨陣地，如發現敵軍仍在某處頑抗，則予以攻擊，如發現敵軍正在撤退，則予以窮追。我希望你爭分奪秒，在伊薩爾河渡口——最好是在蘭茨胡特，但至少要在莫斯堡將敵截住。
這是對戰局的一種過分樂觀的估計，因為戰鬥還剛剛開始。拿破侖一向過於自信，而且他也總是喜歡用這種盲目自信來激勵部下。
迄此法軍遭遇的僅是奧軍的前衛部隊，但到20日黃昏時，奧軍右翼已拿下了雷根斯堡，這是因為達武在那裡隻留了一小支後衛部隊。查理大公的主力現正從雷根斯堡起在正南方向寬20英裡的正麵上展開，但在其北麵的四個軍和席勒的那個軍之間即蘭茨胡特西北10英裡處卻出現了一個缺口。馬塞納率領四個步兵師和兩個騎兵師經過艱苦行軍終於按拿破侖的命令在弗賴辛和莫斯堡之間完成了集結。
4月21日一整天，查理大公對在雷根斯堡和埃克繆爾(位於雷根斯堡以南16英裡處的格羅斯-拉貝河穀)之間的達武和勒費弗爾發起了強大的攻勢。在叢林密布的河穀之中，奧軍的攻勢失去了內聚力，隻能零星地逐次投入兵力，而法軍和巴伐利亞軍，儘管在數量上遠居劣勢，卻不僅守住了陣地，而且還能適時反擊，逐退敵軍。
拿破侖仍以為伊薩爾河穀是解決問題的關鍵，所以他將拉納軍和勒費弗爾軍的一部分南調蘭茨胡特以加強其右翼。到黃昏時分，這支兵力會同馬塞納從莫斯堡開進的兵力終於將席勒軍逐出了蘭茨胡特。貝西埃爾率兩個騎兵師乘勝追擊，把奧軍一直追到東南的蓋森豪森。
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拿破侖本人騎馬行軍二十五英裡於4月21日下午7時抵達蘭茨胡特。直到這時，他才意識到，把席勒軍往南逐過因河恰恰放過了在雷根斯堡地區殲滅查理大公的奧軍主力這個主要目標。次日淩晨2時，他收到了達武的報告說他正受到奧軍三個軍的重壓而且缺乏彈藥。拿破侖當即決定馳援達武。淩晨三時，他向貝爾蒂埃口授了下述命令：
命令符雷德將軍率所屬師支援貝西埃爾元帥自蓋森豪森出擊，將敵一舉逐過因河。巴代利亞師則於上午4時出發。
命令利沃裡公爵(馬塞納)將其三個師連同火炮和埃斯佩恩的騎兵師調集到蘭茨胡特和埃爾哥丁(蘭茨胡特東北四英裡處)之間。其先頭師應沿伊薩爾河左岸成縱隊隊形，並準備在上午6時出動。利沃裡公爵應率其三個師兵力向埃克繆爾開進，並包圍敵軍。朕將與他一道前進。
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