止失去航行能力的“列克星敦”號落入日軍之手，尼米茲隻好下令由驅逐艦“菲爾皮斯”號擔當“送葬人”的角色，向正在熊熊燃燒的“列克星敦”號航空母艦的船殼發射了4條魚雷，將其擊沉。
當尼米茲將軍得到“列克星敦”號已經沉沒的消息時，實在忍受不了這樣的打擊，掉下了幾滴傷心的眼淚。後來，當值班參謀向他報告說：據日軍廣播電台說，負傷的日軍航空母艦“翔鶴”號，正以16節的航速向北逃竄，預計5月17日返回日本本土時，複仇心切的尼米茲立即命令道：“馬上派潛艇去追，隻要發現目標，就把它徹底擊沉!”
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日本工人正在裝配飛機螺旋槳。可是，在浩瀚無際的西南太平洋上，一艘航空母艦就好似滄海一粟，儘管尼米茲派出的幾艘潛艇燃料都快耗光了，還是沒能找到“翔鶴”號，最後不得不悻悻返航。
在雙方的這場海空大搏殺中，“約克城”號自然也不能幸免。該艦在日軍飛機的猛烈攻擊下，被1顆重磅炸彈穿透甲板，在下麵的儲藏室裡爆炸，引起了大火，破壞相當嚴重，很快就失去戰鬥力退出了戰場。
然而，就在尼米茲將軍感到實在難以支持的時候，高木艦隊也已成了強弩之末。幾乎就在當天下午的同一時間，兩位高級指揮官發出了同樣的命令：“艦隊立即撤離，飛機返航!”
就這樣，珊瑚海海空戰結束了!
參戰雙方的主要損失情況如下：
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