曾在《廣東新語》一書中將南海神廟的木棉樹比喻為“十丈珊瑚”。現在的兩株當然是後人補種的。由於栽種曆史年代久遠，它們均被列為廣州的古樹名木。
大殿
禮亭的背後是南海神廟中規格最高，也是最重要的建築物。 大殿是南海神廟的第四進。它是仿明代木結構琉璃瓦歇山頂建築。屋頂用綠色的琉璃瓦覆蓋；中間有雙鳳飛翔、鼇魚倒懸等紋飾的琉璃瓦脊；上部有兩條軀體彎曲作騰飛疾走狀的蒼龍造型，它正在爭奪當中的寶珠。據說，雙鳳代表美麗，整魚代表自由，蒼龍代表權力，而寶珠代表智慧。 大殿正中安放了連座3.8米高的南海神祝融。他頭戴王冠，身著龍袍，手執玉圭，體態豐碩，神情卻十分端莊，一派和藹的王者風度。 大殿左右兩旁有六侯塑像。據說這六個人都是為南海神治理海上風雲而各自立下大功的，因此在“多神教”的道教寺廟中爭得立足之地。他們分別是達奚司空為助利侯、杜公司空為助惠侯、巡海曹將軍為濟應侯、巡海提點使為順應侯、王子一郎為輔靈侯、王子二郎為讚寧侯。 大殿東側還有一麵著名的東漢大銅鼓和一個明代的鐵鐘。銅鼓直徑138厘米，高71.4厘米，厚0.4至0.6厘米，是一件極為珍貴的文物，僅次於廣西、上海的大銅鼓，在中國現存大銅鼓中排位是第三。它是東漢時期鑄造，鼓麵正中太陽芒紋，鼓邊原鑲有6隻銅蛙，不知怎的現已失散殆儘。其鼓身有圓形的方孔錢紋和雲紋。大銅鼓是古越族人祭祀的重要禮器，代表著權力和地位。這麵銅鼓除在神誕慶典中使用之外，據說它還有鎮妖、定海的作用。 祝融像的背後有一塊照壁，浩蕩的海水上有一條龍騰雲駕霧，兩邊有對聯：“順水千舟朝洪聖；伏波萬裡顯真龍。”
昭靈宮
第五進叫昭靈宮，也叫做後殿，是南海神夫人的寢宮。南海神夫人在宋朝時期被封為“明順夫人”。據說她原來是順德的一個養蠶女子，後化為神，許配給了南海神。她除了具有與南海神一樣的法力外，還有“送嗣”的職能，是婦女、兒童的保護神。
浴日亭
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在南海神廟西側，有一座小山丘，古時叫做章丘。這大約10多米高的山上有一座小亭。唐宋時這裡是三麵環水，“前臨大海，茫然無際”，人立亭中，當然是觀賞海景、對大海抒懷的最佳位置。 據有關史書記載，古代這山崗的階梯共108級，但如今僅餘72級崗階了。這裡東連獅子洋，煙波浩渺，夜幕漸退，紅霞初現，萬頃碧波頓時染上一層金光，一輪紅日從海上冉冉升起之際，有一半仍沉在大海之中，吞吞吐吐，此景象壯觀極了——這就是曆史上宋元羊城八景之一的“扶胥浴日”。難怪當時有眾多的文人墨客遊完南海神廟，喜歡黃昏泛舟於此，第二天拂曉時分才登上古亭觀日出呢！ 北宋紹聖初年（1094年），大文豪蘇東坡被貶至嶺南途中，在廣州停留，慕名拜祭南海神。他登上浴日亭，驚歎這大海的壯闊，太陽的輝煌，天地的浩茫，廟宇的古樸，便感懷身世地寫下了“南海浴日亭”一詩：“劍氣崢嶸夜插天，瑞光明滅到黃灣。坐看暘穀浮金暈，遙想錢塘湧雪山。正覺蒼涼蘇病骨，更煩沆瀣洗衰顏。忽驚鳥動行人起，飛上千峰紫翠間。” 詩因亭作，亭也因詩威。有好事者將蘇東坡所吟之詩刻到石碑上以作留念。碑立亭中，亭也因而叫做浴日亭。後名聲漸漸遠播，更有許多文人墨客慕名而來觀賞“海中浴日（因神廟古時叫波羅廟，故又叫為“波羅浴日”），亦留下不少與蘇東坡應和的詩句。其中最著名的是明人陳獻章的《浴日亭和蘇東坡韻》一詩。詩是這樣寫的：“殘月無光水拍天，漁舟數點到灣前。赤騰空洞昨霄日，翠展蒼茫何處山。顧影末須悲鶴發，負暄可以獻龍顏。誰能手抱陽和去，散入千岩萬壑間。” 後人同樣也將陳獻章的詩鑿刻立碑。現兩詩碑並存亭內。 南海神廟像是一位曆史老人，親眼見證西漢以來海上絲綢之路發源於廣州的曆史，神廟真不愧是廣州對外交通和對外貿易繁榮的一個縮影。它集我國的宗教、古建築、書法、雕刻、諸種文學藝術於一體，具有較高的曆史價值與旅遊價值。 最近廣州市政府已製定了南海神廟開發的總體規劃，並即將實施。整個規劃占地44萬平方米，將恢複“古扶胥一條街”，在“海不揚波”石牌坊前，恢複古碼頭與海景，並開辟水道通珠江。還將籌建“南海海上絲綢之路博物館”。建成後，遊人可在此遨遊極其壯觀的海上絲綢之路的風情勝景，發思古之幽情。
河運胥扶古
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峰融祝：章四第
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