【第218章 殊途同歸的美感】
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整個會場大概能容納一千多人。
麵對這麼多人的目光，這個年輕人表現的很沉穩。
他把PPT翻到標題頁。
大屏幕上同步彈出一行字。
《基於直接耦合分析的植物基因組功能位點全基因組預測技術》
緊接著，聲音從四周的音響裡傳出來。
“尊敬的各位領導、各位同仁，大家上午好!”
“歡迎大家蒞臨今天的學術交流活動。”
“我是林曉。”
林曉邊說，忍不住用餘光掃了一下台下。
會場比他預想的要滿啊。
好家夥，有這麼多人的嗎？
之前，常院長確實提前跟他說過。
來的人比他想象的要多，讓他講慢一點，別急。
但依然有些出乎他的意料。
不過，林曉這會似乎一點都不帶緊張的。
心裡全是對任務獎勵的向往。
簡短的開場白過後。
林曉的聲音接著在整個會場響起。
“今天這場報告的內容，是我本科期間在MIT訪問時完成的一項工作，最近剛發表在PNAS上。”
“我把它從蛋白質領域的DCA方法遷移到了植物基因組的功能解析上，得出了一些初步的結果。
“接下來我會把整個思路和驗證過程完整地講一遍，大概一個小時左右，之後留出時間給大家提問和交流。”
“如果中途有什麼問題，隨時可以打斷我。”
“好，那我們直接開始。”
"直接耦合分析，大家可能不太熟悉。”
“但如果換成縮寫DCA，我想大家就逗了解了，因為蛋白質結構預測領域很有名。"
他轉向屏幕，用激光筆圈了一下畫麵左側的一張蛋白質結構圖。
“它的基本原理很簡單，如果兩個氨基酸位點在進化過程中總是同進同退。通俗點說就是，一個變了另一個也跟著變，那它們多半在三維結構裡也是物理接觸的。"
"這個思路，二十年前由一篇PNAS論文被正式提出，後來成為了蛋白質接觸預測的標準方法之一。"
林曉停了一下，往台下看了一眼，然後繼續說："我當時在MIT上課的時候，當時的授課教授突然講到了這個內容。”
“當時我就在想，這個邏輯，能不能放到基因組上去用？"
“靈光一現看起來很簡單，但後續的工作其實並不容易。”
他翻了一頁，大屏幕上出現了一張擬南芥根尖的細胞圖。
"蛋白質裡的協同變異反映的是空間約束，兩個氨基酸在空間上靠得近，所以不能隨便變。那基因組裡的協同變異反映的是什麼？"
他點了下屏幕，圖上出現了幾條從不同細胞核向外延伸的虛線段，連接著基因組的遠端區域。
"不是物理接觸。”
“而是功能約束。”
“某個位點的變異，如果必須被另一個遠端位點的變異補償。”
“這個關係就不再是物理上的挨著，而是功能上的耦合。"
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說完，他翻頁，屏幕上出現了一組代碼。
"我的工作就是把DCA的模型重寫成能在群體基因組數據上運行的形式。”
“把同源蛋白質序列換成群體SNP位點，把氨基酸狀態換成核苷酸多態性，把殘基接觸概率換成功能約束強度。"
他沒有逐條解釋，而是用兩句話概括了最核心的部分。
"模型框架沒變，變的是輸入和輸出。”
“輸入從幾十條同源序列變成幾百個個體的全基因組SNP。”
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