【第246章 沒必要收著講了呀！】
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台下的學生本來還聽的津津有味。
因為這堂課實在講的太通俗易懂了。
但聽到最後，突然有人不約而同的發現了華點。
“一個本科生？”
“最後出現在PNAS的封麵上？？？”
等等！
那個第三人好像有點熟悉。
頓時，不少人開始憋起笑來。
林神，你要誇自己，可以直接一點。
大可不必......
而林曉還在自顧自地講著。
“所以統計耦合的意思很簡單。”
“在群體中觀察兩個位點的變異是否具有協同性。”
“如果位點A變了，位點B也跟著變，那它們之間就存在一種統計上的依賴關係。”
“這種依賴可能來自連鎖不平衡，可能來自共同的選擇壓力，也可能來自功能上的相互約束。”
這時，他看了一眼台下繼續道：“所以我們要做的，就是拆開這幾種可能性，找出真正屬於功能約束的那一部分。”
說到這裡，前排有一個學生舉了舉手。
林曉停下來，朝他點了一下頭：“你請說。”
男生站起來，聲音像是有點緊張，但語速不慢。
“老師，您剛才說要把幾種可能性拆開，連鎖不平衡、選擇壓力、功能約束。”
“但我想問的是，拆開之後，怎麼確定剩下那部分就一定是功能約束？”
“會不會有什麼東西，拆完之後還混在一起？”
他說完之後，教室裡安靜了一瞬。
林曉也有些意外。
“好問題。”
於是，他調出一張新的圖。
“這是我們在預處理階段做的一組對照，先用中性位點模擬出LD背景信號，然後把它從觀測到的信號裡去掉。”
“剩下那部分，再跟已知功能位點做比對。如果它和已知功能位點的重合率超過隨機預期。”
“那你基本可以認為，拆剩下的那部分，大概率屬於功能約束。”
他補充道：“當然，這不是百分之百保證。”
“因為我們並不知道所有已知功能位點的集合是否是完整的。”
“有些功能區域可能還沒被標記出來，如果它們恰好被當作背景信號過濾掉了，那我們就有可能會漏掉一些真正重要的信號。”
“所以目前的策略，是先跟已知位點做一輪比對，再留下那些未被標記但信號特征穩定的區域作為新的候選。”
“雖然不能保證絕對準確，但至少在實際驗證中，這些候選區域的表現還不錯。”
而這時，林曉看著台下這麼多人，跟著這個男生頻頻點頭。
教室裡的反響和效果非常不錯。
喲嗬！
沒想到還是他太保守。
之前小看這群清北的學生啊！
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看樣子是沒必要收著講了呀！
林曉滿意的點點頭：“前麵那些背景大家應該都有所了解，就不多講了。”
“我們直接從玉米的LD衰減曲線對窗口大小的影響開始。”
他點擊翻頁器。
屏幕上出現了一張布滿曲線和散點的圖。
縱軸標注著連鎖不平衡係數，橫軸是物理距離。
圖的下方還疊著幾根顏色不同的參考線。
“玉米的LD衰減速度大約是擬南芥的六到七成，這意味著如果用擬南芥的那套參數來跑玉米的數據，可能會遇到計算上的偏差，結果也會出現誤差。”
他指著其中一條曲線說，“所以遷移的第一步，是重新估計窗口大小。”
“這個不是憑經驗猜的，需要通過計算LD衰減半衰期來反推。”
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