有3種不同類型的矽基生物酶，其中兩種屬於不明生物亞型，後來再未出現，推斷為已滅絕的異形生物種類，第三種與現存磁晶簇基因同源。沈晉明通過磁偏角反演技術還原當時場景：由於大量異星黑石生物為快速生長而瘋狂吞食海水，導致古特提斯海水源急劇減少，黑石生物開始爆發種內競爭，優勢個體通過吞噬同類獲取基因與能量，這正是‘生存鬥爭’的直接體現。
中層樣本中的磁晶簇開始出現適應性強化的特征，剩餘磁化強度提升至“每千克0.15安培平方米”，且能記錄地磁場極性變化，說明到這一階段，黑石生物已進化出“磁場同步”能力，可以通過調整自身磁場來適應地球環境波動，這完全符合“適者生存”的篩選邏輯。
接下來將深層與中層樣本進行比對，沈晉明又和助手們觀察到，岩石蜂巢結構的密度由每立方米127個大幅度降至19個，並且多伴隨破碎殘骸，因此可以得出結論，“異形生物體自相殘殺導致種群數量驟減”，隻有攜帶“高效代謝”、“基因吞噬”基因的個體，才成功得以留存。
第三階段，在100-200米深的淺層岩層，屬於約2300萬年前延續至今的新近紀到第四紀，被沈晉明稱為是“勝利者的終極隱藏與消失”。
此深度的主力岩層為新近紀風成砂岩，含典型的沙漠環境沉積構造，明顯可見交錯層理、風蝕痕，標誌著撒哈拉沙漠的最終形成。岩芯磁偏角數據顯示，這一時期的磁場穩定，乾旱化程度加劇。
150米深的更新世砂岩層中，岩芯腔壁包裹著與砂岩成分一致的石英薄膜，磁晶簇剩餘磁化強度降至0.01 Am²\/kg，與周邊岩層磁場誤差小於2%。沈晉明指出：這是達爾文進化論中“適者生存”的終極形態，黑石生物逐漸擺脫深地約束爬到地麵，進化出雙重偽裝能力——形態模擬岩石，磁場融入環境，在大自然中完美隱藏了自身蹤跡。
更令團隊感到震驚的是，淺層磁晶簇樣本提取的生物酶中，僅檢測到1種矽基基因序列，且包含“低代謝”、“磁場偽裝”、“水分高效提取”等7個優勢模塊——證明經過八千萬年“強者戰勝弱者”的篩選，僅單一亞型的勝利者留存，其基因庫高度特化。
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120米深的全新世砂岩層，僅殘留零星磁晶簇和空蜂巢結構，未發現任何完整生物個體。結合岩層約一萬年的年齡與撒哈拉古人類活動痕跡，沈晉明推測：經過優勝劣汰選出來的異形生物，因種群數量過少，可能在末次冰期的極端乾旱中進入休眠狀態，又被早期人類偶然獲取後帶離原地，這大概能成為為何黑石消失，僅遺留岩層痕跡的最合理的解釋。
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