本尊，同樣在上述位置。如此一邊觀想，一邊念誦上師瑜伽。念完後開始祈禱上師，上師若有心咒的話，此時也可以念上師心咒。念誦結束後，觀想上師變成一個明點，由頭頂融入自己心間，這時想：希望自己也和上師一樣功德圓滿。然後觀想自己的心與上師的心無二無別，安住一段時間，出定。入定時間可長可短，由個人能力決定。
上師瑜伽是一切教法的源頭，直指諸法實相，雖是無上究竟法門，卻易懂易行，隨時隨地都可以修持。
每天早晨醒來，觀想上師從心間的蓮花中躍然而出，如魚兒躍出水麵，活潑而利索，一下升至頭頂上方；晚上睡覺時，右側吉祥臥，觀想上師從頭頂進入心間的蓮花上，上師身體發光，照亮自己及周圍的一切；吃飯時，觀想上師在自己的喉部，美味的食物都敬請上師享用；走路時，觀想上師在自己右肩的上方；感受快樂時，想到這是上師的恩賜；生病、受排擠、被誹謗等處於逆境時，想到這是我的果報。慈悲的上師加持我，讓我在還有能力清淨以往業障的時候，經曆這一切，抓住機會體驗他人的痛苦，從而更快地生起菩提心。
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也可以觀想自己變成一個五色明點，迅速融入上師心間。上師不斷往上升，越來越高，越來越遠。如此觀想，安住於自心與上師心無二無別中。
總之，把行住坐臥間一切所見所聞都觀想成上師的化現。這都源於上師，就像陽光源於太陽。
經常想上師的功德、上師對自己的恩德，並誠心祈禱上師或念誦上師的心咒。相信上師沒有一刻離開過自己，因此對上師的恭敬也不要有一刻懈怠。
5. 早課的“上師瑜伽”修完後，就可以開始“念誦”功課。
一般情況下，大家可以按照《顯密念誦集》的順序，即從第一頁的《語加持》開始念誦，然後是《八吉祥頌》《供養儀軌》《普賢行願品（七支供）》《發心儀軌》《大自在祈禱文》《文殊禮讚》《釋迦牟尼佛修法儀軌》等。
在念誦前，先熟悉誦詞漢文的意思，然後按藏音念誦，這樣最好。如果暫時做不到，需要儘快地熟練。
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