如果盧漢不到，後果不堪設想；如果盧漢到重慶，將由張群保證其安全。
在形勢的逼迫下，盧漢無奈，於9月6日飛重慶。臨行前，盧漢對龍澤彙、安恩溥等心腹人說：“我這次去重慶，吉凶難卜，萬一被扣，你們就打電報來要求放人。要求不準，你們就插起紅旗，通電起義，不要管我。我走後，軍事由龍澤彙負責，政務由安恩溥負責。”看到盧漢心意已決，他的親信們也就同心協力。盧漢走後，昆明城實行宵禁，部隊官兵停止休假外出，高級軍政人員集中到昆明五華山省政府內辦公。昆明氣氛緊張，箭在弦上。
盧漢做好了被捕的準備，一到重慶，即向蔣介石提出辭職。但他沒想到蔣介石對他卻十分熱情，一再表示會全力幫助盧漢解決困難，並且願意雲南問題交給盧漢全權處理，還準許他把保安團擴編為兩個軍，軍費撥發現銀100萬元，武器、彈藥裝備陸續補充。然而作為條件，蔣向盧提出三條：一是取消雲南省參議會，二是逮捕100多人(附有名單)，三是要封幾個報館和學校。
盧漢考慮到如果此時起義，條件尚不成熟，因而答應了蔣介石的要求。
9月8日下午，盧漢回到昆明，暗示共產黨人迅速轉移。9月9日，在昆明實行大逮捕，由特務頭子、軍統西南特區區長徐遠舉率領數十人執行任務，共逮捕數百人之多。經過審訊後，準備槍決的有100多人，其餘大多判處3年至20年不等的徒刑。這就是“九九整肅”事件。
軍統特務、保密局長毛人鳳企圖借刀殺人，嫁禍盧漢，乃將處理人員的名單報送盧漢要他立即批準。他連夜驅車駛向盧公館，向盧漢說：“盧主席，九九整肅的400多名共產黨不能再留了，盧主席應該趁熱打鐵才對。”
“毛局長的意思？”
毛人鳳用右手做了砍脖子的姿勢。盧漢道：“毛局長，這恐怕做不到，人命關天啊！”
毛人鳳道：“你不是答應委員長要製裁嗎？”
“哈、哈……”盧漢大笑幾聲說：“毛局長，我答應對他們進行製裁，並不是要殺他們啊，而且這批人關在監獄中，失去人身自由，這本身也是一種製裁嘛。”
毛人鳳在心裡罵了一聲“他媽的”，表麵上卻十分鎮靜：“盧主席是雲南省的父母官，生殺大權的事情，當然是盧主席決定。但是委員長的命令也是……”
盧漢叫道：“這我當然有主意，毛局長，你看時間不早了，我內人要休息了。”
毛人鳳雙目炯炯地盯著盧漢，心中已經起了殺機。
徐遠舉聽說毛人鳳要殺盧漢，立即說道：“毛局長，這盧漢可是雲南王啊！”
毛人鳳怪笑道：“盧漢是雲南王，但沈站長的槍法也是很準的！盧漢和沈醉都不是好東西，讓他倆火拚好了，我們把這邊安排好，抽身去台灣。”
徐遠舉連稱“局長高明”，可是沈醉畢竟是摸爬滾打十幾年的弟兄，這樣過河拆橋，讓人看起來確實有些心寒。
毛人鳳好像看出徐遠舉內心似的，“遠舉兄，你可不能有婦人之仁，沈醉自從到了雲南就老是心懷不滿，如果放他一馬，他肯定會投奔共產黨的！”
徐遠舉點點頭。
毛人鳳厲聲地說：“召集餘程萬、李彌在沈醉家裡開會。”
此時的昆明已經實行了燈火管製，夜黑漆漆的，看不見任何東西。徐遠舉和毛人鳳駕著車向沈醉家駛去。
沈醉從被窩裡被拽出來，他不耐煩地對徐遠舉說：“遠舉兄，你安排會議也應該用電話通知嘛！是不是毛局長對我也不信任了？對我也突然襲擊。”
牢騷歸牢騷，沈醉穿好衣服，從臥室到客廳，看見毛人鳳正坐在屋內，望著他一陣陣怪笑。
不一會兒，國民黨退守雲南的第二十六軍軍長餘程萬、第八軍軍長李彌、副軍長彭佐熙等人齊集沈醉家。
毛人鳳首先說：“今天我們在沈站長家開個臨時會議，有幾件事情要通報一下。”
”！令手長員委“：音聲了高提鳳人毛，語不默沉人眾到看
𝘄𝘁.𝗽𝗼𝗼問訪請，節章新最受享間時一第您讓
”……道通西滇的南越與甸緬通溝是的保確須必。棄放可明昆，守據力無在實若。令司總擊遊兼任主署公員專南雲為職晉，將中為醉沈升晉。部令司總為稱改部令司擊遊南雲部防國；署公員專為改室公辦員專區南雲駐部防國將，準核座委報呈經……“：道念鳳人毛聽隻，子身了直挺即立人眾
。說地意醋無不舉遠徐”。令司總將中到升晉你賀祝，兄沈“
”。你給個一讓我，令司總擊遊與任主署公這，灣台去不果如兄舉遠“：說遂，製壓法無然依惡厭的心內但，望願的財發官升他了足滿竟畢這是可，套的下鳳人毛是這知明醉沈
”。事的漢盧下一談來們我，在現。對才作工極積要你，任信的你對長員委是這，誌同醉沈，情事的要重更有還舉遠徐“：說即立鳳人毛
”。害其受深會就們我，他掉搞快儘能不果如，知皆人路心之昭馬司的漢盧“：道說彌李，這到想。了的他是就置位的席主省南雲，掉拔被釘中眼的石介蔣個這漢盧要隻，法想的他照按，久很置位的席主省南雲著瞅已早他，人南雲是彌李的言發有沒直一
”。對才疑不人用要們我，國黨變叛即立會不漢盧看我“：道說卻萬程餘
”。握把的分萬有是必想，氣口的定肯樣這長軍餘“，隊部力主的南雲握掌竟畢餘為因，疼頭到感他令也，外意的鳳人毛乎出法看的彌李意同不萬程餘
”。的行後而思三會他，明聰的漢盧以。漢盧濟接法無但，隊擊遊軍共的股小有然雖，象跡的動活軍共股大有沒尚南雲前目，二第；的行不是力實有沒共投要，巫大見巫小是真，比相軍六十二笫、軍八第們我和力兵總的南雲在盧，一第“：說步兩了踱來起站萬程餘
”。業事國黨利不，牆跳其逼會而反，敗失一萬，手下盧對在現果如，析分的長軍餘成讚我“：道說即立醉沈
盧裁製對反人四有已中之人五到看鳳人毛
