事基地的全部士兵、吞噬他們的全部能
量並收回此處的滅世魔能平衡倉時，猛獁擎天柱率領部下趕到。
猛獁擎天柱等人遭到宇宙大帝發動的黑洞攻擊，但在眾人協力下得以倖存，並猜出宇宙大帝的目的，示警塞伯坦做好應戰準備。
宇宙大帝隨即對塞伯坦發動進攻，麵對魔力神球勸說宇宙大帝放棄野心的話語，宇宙大帝哈哈大笑，並以能量體光之龍的形態摧毀了整個巨無霸原始獸聯合艦隊，猛獁擎天柱等人對宇宙大帝展開拚死伏擊，宇宙大帝於是選擇收回滅世魔仆的力量擊退眾人，隨後進入塞伯坦的核心與魔力神球結合成為新的變形金剛之神，並在塞伯坦上出現了他象徵性的大角。
不過之前的戰鬥中，因為猛獁擎天柱的努力，宇宙大帝的滅世魔能絕大部分都在眾多平衡倉內封印著沒能取回，而他在消滅巨無霸原始獸聯合艦隊時又損耗過大，使得能量體形態下的宇宙大帝在力量恢復前變得非常虛弱，被從異空間逃回的炎衝天抓住機會從魔力神球中趕了出來。
憤怒的宇宙大帝殺死了炎衝天，並宣稱「我的心和這個宇宙一樣是絕對冰冷的」，向最後的巨無霸們發起攻擊，最後被猛獁擎天柱結合領導模塊和全體巨無霸的正義之力打敗。
「我就是宇宙大帝，世界的毀滅之神！」
宇宙大帝本作（微型金剛傳說、邪神三部曲）中，作為最高位的毀滅之神的宇宙大帝因同時具有最終極的無限的毀滅和創世之力而得以肆意妄為。宇宙大帝曾一度不受任何力量製約在宇宙中肆意活動（作為宇宙大帝宿敵的元始天尊在第二部出場時隻剩下火種），在塞伯坦星球變形金剛的神話傳說裡，宇宙大帝留下了濃重的一筆。
宇宙大帝橫行宇宙時，無數文明因他滅亡，因為擁有隨意創造和毀滅宇宙的力量，宇宙大帝對一切毫無珍惜，將一切都視為滿足自身飢餓感和破壞欲望的工具，他曾經因自身無法滿足的飢餓，吞噬過包括五麵怪母星在內的許多星球，後來，在整個宇宙因宇宙大帝的恐怖力量麵臨滅亡之際，他自身因不明原因陷入了沉睡。
宇宙大帝在自身即將陷入沉睡時，選擇變形為星球形態並偽裝成了塞伯坦的月亮。在變形體沉睡期間，宇宙大帝千萬年來一直秘密監視著塞伯坦，吸收汽車人和霸天虎交戰產生的負麵能量修復自身變形體，並創造出原本是自己細胞的迷你金剛，妄圖通過加劇戰爭來加快自身變形體的自我修復。
但迷你金剛雖是宇宙大帝的細胞，本性卻與他不同，他們擁有了自知力，不願參與戰爭，並因此選擇背叛了宇宙大帝，駕駛飛船逃離了塞伯坦，並墜落到月球和地球。
當汽車人和霸天虎在地球進行迷你金剛爭奪戰時，宇宙大帝派遣了他的意識細胞Sideways/Doubleface邊路/雙麵人前去調查，邊路先後加入汽車人和霸天虎從中挑釁，加劇雙方的鬥爭來吸取負麵力量強化宇宙大帝。
在邊路入侵汽車人基地計算機時，萊德、卡洛斯和阿萊克莎被捲入電子世界，在那裡救回了迷你金剛。正當逃出電子世界之時，萊德他們看到了一個巨大的黑影正在逼近。
邊路之後和威震天的軍師衝鋒暗中結盟，令其誘使威震天利用三神器一星辰劍、鎮魂槍和天雷盾造出了九頭蛇重炮，險些毀滅地球。返回塞伯坦時，雙麵人曾化作黑暗擎天柱襲擊雙方，但因為迷你金剛們出現而失敗。
在雙方返回塞伯坦後，宇宙大帝先是用黑洞意圖吞噬所有變形金剛，但黑洞被迷你金
剛消滅，令變形金剛們意識到宇宙大帝的存在。衝鋒公開背叛威震天後盜走了鎮魂槍和天雷盾，在邊路的幫助下進入宇宙大帝偽裝的月球深處，令宇宙大帝開始初步甦醒過來，紅蜘蛛和萊德他們試圖阻止未果，卻因此看到了另一條時間線，意識到迷你金剛正是宇宙大帝的細胞，宇宙大帝製造迷你金剛就是為了讓變形金剛們為之爭鬥。
此時隨著宇宙大帝開始甦醒，宇宙大帝撕開過去的偽裝掩護，兩隻大角從月球伸出。
隨著宇宙大帝從沉睡中逐漸醒來，宇宙大帝的岩石外殼外出現雷霆組成的星環。
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