張居正見了朱翊鈞的批示，心中給朱翊鈞點了讚，知道皇帝終於明白了他的意思，對日後展布改革事也多了些信心。
他的角度和朱翊鈞截然不同，在他內心深處，恨不得把離間君臣、敗壞國事的餘懋學給宰了，以為亂政者戒。
然而，作為文官之首，儒學門徒，張居正必須堅持大明朝的政治正確——禦史、科道言論自由。
反之作為皇帝的朱翊鈞，心裏麵是不想抓餘懋學的，雖然其心可誅，但製衡之道也在這「可誅之心」上頭，不然的話就把言官的操守看得太高了。
不管皇帝和首輔心裡怎麼想，令人無語的現實卻是，想殺餘懋學的一本本的上奏要保他；想輕輕放過餘懋學的，卻派錦衣衛將他從南京抓來，投入北鎮撫司的大牢。政治的弔詭之處，即在於此。
首先被處置的，是「受賄妄言亂政」的王琢玉。錦衣衛拷掠不到兩個時辰，王琢玉就如同竹筒倒豆子一般，把兩淮鹽商重金賄賂，買奏章杯葛曬鹽之法的實情交代了出來。
說實話這是大明的穿越文化還沒生發，王琢玉做夢也想不到朱翊鈞清楚知道以後曬鹽法才是主流。他的想法和全體朝臣差不多，應該是某個希求媚上的中官向皇帝說了曬鹽法之利，皇帝在深宮拍腦袋決策才大興曬鹽。
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既然可被言語動之，也會被言語反之。王琢玉在奏章裡煞費苦心，說自己訪了老鹽工，「為之哂笑」。心說以皇帝年齡，被人恥笑了還不惱？隻要惱了，必派員查看，那時才是上下其手的時候——鹽商所要的，不過是朝廷派出欽差而已。
可惜這價值三千兩的一本，把自己栽了進去。錦衣衛順藤摸瓜，把賄賂禦史的鹽商一股腦提溜出來，全部押進京受審。
朱翊鈞行事不像武宗，常有混不吝的時候，不跟朝臣講道理。他最擅長的是後世我軍的破敵要義：全力突破一點，然後以點帶麵，接著迂迴包圍——偶爾條件成熟了還有中心開花大餐等等。鹽政和京營興革，最能體現他的治政特點。
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此次從王琢玉身上打開缺口，還不大挖特挖的話，如何對得起自己身上這身皇帝皮。
鹽政官商勾結，朱翊鈞用腳指頭想，都知道早成痼疾。在鹽政改革即將推出的時候，不把這鹽政官收拾穩當，談何興革。
被捕鹽商哪裡受得了被朱翊鈞親自調教、指點過的錦衣衛，沒留任何外傷，北鎮撫司已讓鹽商們求死不能。
鹽商金某交代兩淮鹽司每年私吞餘鹽一萬萬多斤，超過兩淮幾十家鹽場正鹽產量的兩倍半——都混在他們鹽商持引銷售的正鹽內一起發賣，沿途鈔關等關節早已被他們儘數打通。
這大雷爆出，讓已成為錦衣衛同知的王通大喜過望，立即密奏朱翊鈞。
這每年一億多斤的餘鹽之利，被官、商和沿途地方官儘數瓜分，中央大員以「冰敬、炭敬」方式分利。朱翊鈞雖對大明鹽政腐敗早有所料，但沒想到他們乾的如此奔放，命王通繼續秘密深挖。
而後鹽商王貢俞咬出戶部鹽司員外郎等明知兩淮販賣私鹽之事，隱而不報，年收例銀三千五百兩，並有受託請超發鹽引給勛貴之事，王貢俞是新進大學士王國光夾袋中私人，這裡麵的道道也不用多說。
王通取得供詞，把證據鏈查的基本完整後，就領了密旨，近半數錦衣衛出動，把兩淮都轉鹽運使司衙門和江蘇、安徽、江西、湖北、湖南、河南六省的涉鹽官員，包括戶部鹽司等官吏，幾乎大半抓進了南苑專案營地跟鹽商做伴。
行動雖然做不到後世那般保密，但在錦衣衛近年來嚴酷家法約束下，隻跑了應抓官員十幾個——高官也沒有跑的，全數落網。
皇帝指揮錦衣衛的這一雷霆行動，把朝廷內閣以下所有官員全數打懵。為了做到行動的突然性，朱翊鈞除了和張居正密議一次之外，宮內宮外無人得知。
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