第一道防線在波蘭軍隊進攻的第一天就多處被突破。德國守軍雖然進行了頑強的抵抗，但兵力差距實在太大。在南部地段，波蘭第十九師用一個上午就撕開了德軍防線，深入境內十五公裡。在中部，波蘭裝甲部隊繞過了德軍堅固據點，直插後方。德國守軍被迫向第二道防線收縮。
最激烈的戰鬥發生在北路的馬祖裡湖區。這裡的地形對防守方極為有利——湖泊、沼澤、森林交錯分布，隻有幾條狹窄的堤道可以通行。德國在這裡部署了三個步兵師，試圖阻攔波蘭軍隊前進的腳步。
他們也確實成功地做到了。波蘭的裝甲部隊被沼澤困住，隻能沿著堤道緩慢前進，成為德軍炮兵的活靶子。
4月17日，波蘭一個裝甲營試圖強行通過一座湖間堤道，結果被德軍反坦克炮伏擊，十二輛坦克中有九輛被擊毀，剩餘的坦克倉皇後撤。
同一天，波蘭步兵在另一個地段發動進攻，試圖用浮橋繞過湖泊，但被德軍機槍火力壓製在開闊地帶，傷亡超過六百人。
馬祖裡湖區的戰鬥持續了整整一周。德軍在這裡打退了波蘭人十餘次進攻，自身也付出了沉重的代價。
但波蘭人的兵力優勢實在太大了。4月19日，波蘭指揮部調整戰術，不再強攻正麵，而是從南北兩翼同時迂回。
北路立陶宛軍隊配合進攻，從北麵威脅德軍側後。南路波蘭第二十師繞過湖區南端，直接插向德軍後方補給線。麵對被包圍的危險，德軍指揮部被迫下令放棄馬祖裡防線，向科尼斯堡收縮。
科尼斯堡是東普魯士的心臟。
當撤退的命令傳達到前線時，戈爾茨將軍已經在這座城市裡布置了整整兩周的防禦。這位參加過上次大戰的老將把科尼斯堡變成了一座要塞。
城市的每一條街道、每一座建築都成了防禦工事的一部分。老城區的石頭建築被改造成火力點，地下室被打通連接成地下交通網，廣場和主要街道上堆滿了用碎石和倒下的樹木砌成的路障。
就連城市外圍的上個世紀的堡壘群也被重新啟用，那些古老的磚石結構在火炮和機槍麵前意外地堅固。
兩天後，波蘭軍隊抵達科尼斯堡外圍。
第一波進攻在4月22日清晨開始。炮火準備持續了兩個小時，數百門火炮將數以千計的炮彈傾瀉在德軍陣地上。
柯尼斯堡的老城區多處起火，幾座中世紀教堂的尖頂在爆炸中坍塌，堡壘的磚牆也被炸出巨大的缺口。
在一輪猛烈的炮火轟炸後，波蘭軍隊開始浩浩蕩蕩地向柯尼斯堡發動進攻。
德國這邊，他們嘗試在第一道防線就阻攔波蘭人的腳步。
德國動用了大量的機槍和輕型火炮，為的就是對付波蘭的騎兵和輕型坦克部隊。
為了對付這些裝甲，德國甚至創造性的設立了反坦克步兵，說白了就是讓士兵拿著炸藥包和捆綁在一起的手雷，冒著生命危險爬到敵人的坦克周圍，引爆並且炸毀敵人的坦克。
在德國的種種防禦措施下，波蘭的坦克損傷慘重，騎兵部隊也傷亡巨大。
但這些根本無法阻止波蘭軍隊的進攻，他們對東普魯士勢在必得。
波蘭指揮部從後方調來更多的火炮和飛機，對科尼斯堡進行晝夜不停的轟炸。老城區在轟炸中變成一片廢墟，街道被瓦礫堵塞，地下水道被炸塌，守軍的補給越來越困難。
雙方在柯尼斯堡的城區進行了猛烈的攻防戰，每一棟樓都要被來回攻防好幾遍。
上半天波蘭人成功占領了一棟樓，下半天德國士兵就會重新奪回來。
在此期間，雙方軍隊都有巨大的傷亡。德國憑藉防禦方的優勢對於波蘭軍隊造成了更大的殺傷，但因自身兵力劣勢的原因，根本無法阻止柯尼斯堡的陷落。
為了摧毀德國軍隊的抵抗，波蘭可謂無所不用其極。
一開始，波蘭軍隊還隻是派出步兵去清剿占領的房區。隨著德國軍隊的激烈反抗，波蘭選擇了全部摧毀這些房子，順帶著也能炸死潛藏在房子中的德國士兵。
這麼做雖然降低了進攻的效率，但也有效降低了自己的傷亡，對於波蘭來說是個好消息。
4月25日，經過連續三天的猛攻後，波蘭軍隊終於突破了外圍防線，進入老城區。
在這裡，戰鬥變得更加殘酷。老城區的街道太窄，波蘭人的騎兵和坦克完全喪失了作用。
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