就在赤眉軍大亂的時候，馮異身先士卒，帶領漢軍就朝著十倍於自己的赤眉軍反衝了過來，赤眉軍再也無力抵擋，緊接就在自相殘殺中變成了潰逃，漢軍頓時把赤眉軍追的真真正正地開始丟盔卸甲，直到此時樊崇才意識到，即便沒有祥瑞神鳥的加持，單論兵法戰術，自己依然不是馮異的對手。
這一場大戰下來，馮異奇跡般地俘虜了赤眉軍八萬餘人，斬殺無數，而八萬餘人，這比馮異整個投入戰場的全部兵力都要多，可謂打了個大大的勝仗。
在外圍布防的劉秀得到這個消息，非常欣喜，立即下旨褒獎馮異和眾將士，特別是對馮異先敗後勝的戰績給出了極高的評價，並留下了“失之東隅，收之桑榆”的千古名句。
這一次赤眉軍大傷元氣之後，就開始被馮異追著打，赤眉軍隻能被動逃跑，跑著跑著，就跑到了宜陽，而在宜陽防守的，正是少年將軍耿弇，耿弇正愁沒地方打仗呢，赤眉軍就送上門了，立刻開始狠揍赤眉軍，劉秀布置在其他關口的將領得到消息也朝著宜陽彙聚，不久之後就徹底把赤眉軍包圍在了宜陽，直到此時，赤眉軍終於徹底意識到，是真的回不去了。
赤眉軍的小皇帝劉盆子讓自己的哥哥去和劉秀請降，劉秀也沒有把赤眉軍徹底趕儘殺絕，就接受了劉盆子的投降，劉盆子在自己哥哥的暗中指導下，早就對獻上印璽和綬帶的禮儀爛熟於心，所以整個過程極為順利，而劉秀也終於拿到了象征皇權正統的傳國玉璽。
至此，橫掃天下九年，讓在華夏大地上留下無數枯骨墳塋的赤眉軍被劉秀徹底蕩平，天下再也看不到眉毛赤紅的兵士了，而軍中的重要將領，劉秀也沒有斬殺，全部遷到洛陽，不僅給住宅還給了田地，意思就一個，你們也別折騰了，就在我的眼皮子底下好好過日子吧，而對於年僅十六歲的劉盆子，劉秀則予以厚待，雖然史書上再也不會出現他的名字，卻因為他在投降的時候給足了大漢體麵，劉秀就回報給他未來一生的富足安穩。
這其中唯一不甘心的就隻有赤眉軍最早的首領樊崇了，在不久之後又糾集同伴準備反叛，消息泄露之後，劉秀在失望之餘就把他斬殺消亡了。
就在劉秀帶著大軍在宜陽解決赤眉軍的時候，那個如瘟神一般的延岑趁著關中空虛，迅速占領了關中的大部分地區，然後把關中原本各自為戰的勢力全部收歸麾下，一時間儼然一副關中之主的姿態，但是被延岑收歸麾下的勢力隻是攝於延岑的難纏，表麵上歸附罷了，私底下依舊相互廝殺拚鬥，這就給原本滿目瘡痍的關中大地帶來了新一輪的浩劫。
劉秀在處理完赤眉軍的事情之後，就繼續命馮異攜勝利之姿平定關中，別人都怕這個猶如瘟神一樣的延岑，馮異卻絲毫不懼，因為馮異軍中可是有大漢的祥瑞神鳥坐鎮，有這麼一尊不著調的大神在，即便什麼都不做，也會讓漢軍軍威大盛。
不久之後，馮異就帶著漢軍在上林苑這個地方和延岑的大軍接觸上了，上林苑這個地方原本就是大漢孝武皇帝劉徹的宮苑，劉徹在這裡培養出了完全效忠自己的親兵羽林軍，更是在最後把這支親兵交給了大漢雙壁之一的衛青，見證了一代軍神的崛起。
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此時漢軍再來到這個尚武的地方，氣勢比出發之前更勝，發誓一定要在這個地方重振漢軍威名，此時別說延岑不是瘟神，即便是瘟神親臨，麵對漢軍的勇猛都得退避三舍，一戰下來，延岑被殺的大敗，聚集的烏合之眾統統被馮異全部降服，此時的投降就不再是表麵上認慫，而是真真正正的認馮異為統領了，至此，關中終於在大亂好幾年之後得以被漢軍光複。
但是光複歸光複，整個長安已經被各路軍閥霍霍的不成樣子了，糧食的價格都快飆升到金子一般了，普通百姓已經完全失去了存活的根本，馮異一見這樣的情況，再次效仿從前劉秀在河北的做法，打擊盜匪，恢複官署，重建秩序，然後從其他東邊的城池不斷調集糧食補給關中，終於在一番辛苦的治理之下，長安城終於緩過了這口氣，開始漸漸有了生氣，一時間馮異的威望達到了頂點，甚至私下有人稱馮異為“關中王”，更有從前被馮異打敗的人在劉秀麵前進讒言，說馮異準備關閉關中門戶，自立造反。
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