及其核心黨羽的逃亡，意味著戰事尚未徹底終結。此人能篡國稱帝，必有其勢力根基，若讓其喘息整頓，或煽動南部勢力，恐再生波折。
主帥張輔與副帥沐晟稍事休整，立即分派任務，展開追剿。
沐晟率西路軍一部，負責清剿紅河三角洲地區零星的抵抗，並保障後勤糧道暢通，同時派兵南下占領一係列戰略要點，防止黎季犁向北反撲。
張輔則親率東路軍主力，水陸並進，南下追擊。陸路騎兵沿官道快速推進，水路則征集、建造船隻，載運步兵和給養沿海南下，形成立體追擊態勢。
在南下追擊的同時，張輔做了一項至關重要的政治舉措：分兵攻克並進駐安南故都升龍。
升龍城是安南陳朝多年的都城，政治意義非凡，且人口眾多，商業繁盛。張輔率軍入城時，嚴令部下秋毫無犯，張貼安民告示。
他親自在昔日陳朝宮殿前召集城中父老、士紳、僧道，宣讀帝國詔書，聲音洪亮而肅穆：
“安南陳氏，世代恭順，乃天朝藩屏。逆賊黎季犁，弑君篡位，罪惡滔天，更欺瞞上國，襲殺天使，人神共憤！朕承天命，遣師南下，非為土地人民，實為伐罪吊民，為陳氏複血仇，為安南伸正義！”
“今逆黎已遁，王師克複升龍。爾等原係陳朝子民，遭逆胡脅迫，情有可原。自今日起，各安其業，勿驚勿疑。帝國天兵，隻誅首惡，不擾良善。待平定全境，自當訪求陳氏遺裔，重續宗祀，還爾等太平！”
這番宣示，極大地安撫了升龍及周邊地區的民心。許多原本對胡朝不滿或持觀望態度的安南官民，開始轉而接受甚至歡迎帝國軍的到來，減少了南進大軍的後顧之憂。
黎季犁一路南逃，惶惶如喪家之犬。他最初逃往其起家之地清化，試圖組織抵抗，但帝國軍推進速度太快，當地勢力見其大勢已去，紛紛閉門不納或甚至倒戈。
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黎季犁隻得繼續向南逃竄，最終與其子黎蒼等人彙合，帶領最後一點殘兵敗將和家眷，乘船逃往安南中部的乂安、順化一帶沿海地區，企圖依托複雜的海岸線和山林負隅頑抗，甚至做好了流亡海外的準備。
張輔洞察其奸，一麵令陸路大軍加緊壓迫，一麵命令水師艦隊沿海岸線南下，嚴密監視所有可能出逃的海口，張網以待。
最終，帝國的天羅地網在奇羅海口收緊。
得到當地百姓的線報，帝國水師艦隊鎖定了黎季犁殘部藏匿的幾艘海船。陸路追兵也及時趕到，控製了海岸。
一場毫無懸念的圍捕戰打響。帝國水師戰船火炮齊鳴，瞬間擊毀、擊傷數艘敵船。陸軍在灘頭設防，阻止任何登陸逃竄企圖。
走投無路的黎季犁父子，眼見逃生無望，在絕望中被帝國士兵從破損的船艙裡拖出，束手就擒。與他們一同被俘的，還有黎朝的主要宗室和官員。
曾經不可一世、弑君篡位的胡朝皇帝，如今成了帝國的階下囚。黎朝，自立國至滅亡，僅短短數年。
肅清殘敵、初步穩定局勢後，張輔在升龍城整理戰報，書寫奏章，派遣快馬以八百裡加急，飛報皇帝王十三。
奏章詳細稟報了自多邦城破後，分路追擊、攻克升龍宣撫百姓、直至奇羅海口擒獲黎季犁父子的全過程。最後，張輔以沉穩而恭敬的筆觸寫道：
“仰賴陛下天威，將士用命，逆首黎季犁並其子黎蒼等一乾首惡，已於奇羅海口悉數擒獲，黎朝宗廟已隳，黨羽儘散。安南全境，寇氛滌蕩，百姓初安。臣等謹奏：安南已定。”
張輔“安南已定”的捷報以最快的速度送達。群臣歡欣鼓舞，然而關於如何處置安南故地的爭論，也隨之展開。
以部分文臣和翰林院清流為代表的一派，主張“興滅繼絕”的儒家傳統理念：
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