其餘的中央機構還有翰林院：
中漢國的翰林院成為一個龐大的機構，內部劃分為上三院和下三院，設立院長和院判兩人負責管理。
上三院為中極殿大學士、內閣大學士和文華殿大學士，其中中極殿大學士為正一品且做過首相但還未退休之人，為皇帝的最高參議機構；
內閣大學士均為一品大員，為內閣成員的備選，一般多有兼職；
文華殿的職能改為中央最高的科學機構，大學士多為科學或者工程方麵的頂尖研究學者；
下三院為文淵閣學士，東閣學士，翰林學士，其中文淵閣學士長掌管機要文書，為皇帝的秘書機構；
東閣學士為狀元、榜眼、探花一甲之人，或者是在地方的政績極為優秀者，在東閣學習一段時間後，都要再次下放升官，相當於文官的高級培訓機構“黨校”；
翰林學士則為進士二甲，主要在中央機構進行實習工作，有可能下放為一方主官或者提拔進東閣學士。
其他還有教育機構國子監、掌管星相和天氣等事務的欽天監。
相對於中央機構的簡單高效，地方行政方麵則是相對而言比較複雜，地方最高一級為直轄府、省和都護府，簡稱“省級”，其中直轄府巡撫為正二品，省巡撫為從二品，都護府大都護為輔二品（新設立）；
“省級”以下為“府級”，直轄府下屬直隸州（不轄縣），省下屬府和郡（轄縣），都護府下屬州（不轄縣）、都督府、盟；
“府級”以下為“縣級”，稱呼為縣（分為大縣知縣、中縣縣令、小縣縣長）、盟下屬旗和都督府下屬各將軍府；
縣級以下則無論內外民族區域，一律設為“鄉級”，名稱統一設立為坊、鎮、鄉，其中坊為城市內部的二級機構；鎮則多為城池以外的城郊地帶，下屬有城市部分也有鄉村部分；鄉則隻下屬有鄉村部分。
坊設坊正，鎮設鎮長，鄉設知鄉官，下屬則有負責鄉小學教育的“校長”，負責治安的“遊繳”，負責民兵訓練的百夫長，財務和出納各一名，負責女性工作的“女薔”一人。
坊正、鎮長和知鄉官均為縣級的派出機構人員，受“縣級”主官和佐貳官領導；
“鄉級”以下按區域設立有社、村，顧名思義，社在城市地帶，村為農村地方，社村不再單獨派遣政府官員，由地方上德高望重的“鄉老”擔任負責人，沒有餉銀，被稱為“社長”或者“村正”，隻能擔任一屆，不得由同一家族把持，每五年換選一屆；
社、村以下則有自然形成的村落，按照民族地域不同，稱為裡，弄，莊，寨，堡，洞，壩等，均屬於村民居民自治組織。
中漢國現有區域劃分為一個應天直轄府、十個省和一個熱河都護府。
以上為中央和地方行政體係，為了確保行政體係的正常運轉，必須配備相應的軍事體係。
中漢國的軍事體係大體分為中央軍和地方軍，其中的中央軍劃分為羽林軍（軍官學校，負責軍官教育）、禁衛軍（皇家的親軍）、衛國軍（野戰軍）和邊防軍（邊境設立）。
羽林軍的士兵被稱作羽林郎，必須中學畢業，主動申請才能獲取，要求嚴格，但是從羽林軍畢業後，就能成為軍中的基層軍官，平時偶爾也會執行皇帝的指示，也屬於皇帝的親軍和儀仗兵；
禁衛軍為皇家的親軍，下屬左右護衛、左右驍衛、左右翎衛和左右屯衛共八軍，分別以“赤橙黃綠青藍紫黑”為各軍旗底色，在原近衛鎮的基礎上擴編而成，每軍有兵額人，總兵力有十萬人，均為複合型編製，除了水師以外，每軍均包含騎兵、步兵、炮兵編製，具體編製略；
衛國軍相當於國防軍，也是直接聽命於皇帝，作為中漢國的野戰軍，內部劃分為水、陸兩師，為了與地方行政機構“鎮”作區分，特將各“軍鎮”改稱為“軍”，每軍人，軍領導為總兵和副將；
軍下設三協一軍部，每協四千人，協領導有參將和偏將；
每協下設三營加一個協本部，每營兵額1250人，營長官為遊擊和裨將；
營下分設一營部和三哨，每哨四百人，哨長官為千總和把總；
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