吳周統治的雲南麵積廣大，原本的二級區劃特別複雜，省下有數十個府、州、宣慰司、安撫司、土州等等，實在是管理不便。
當地又是少數民族為核心的聚居區，貿然使用內地流官治理，一旦政策過於超前就很可能引起動亂。
三年的征戰已經使得雲南一地滿目瘡痍，實在是再也經不起動蕩了。
原本孫可望時代建立起來的屯墾體係已經完全崩潰，吳周時期的雲南又是“先軍政治”，一切都是為了軍事作戰服務，造成當地民生凋敝。
中漢朝廷想要穩定地統治雲南，既要將雲南省與內地其他省份一視同仁，又得兼顧當地的民情，給予一定的照顧。
中漢朝廷皇帝張鹿安於是決定在雲南建省，但是省下一級參照結合都護府的編製，實行二元製行政體係，即省以下設立府和都督府兩種行政機構。
雲南省巡撫為錢澄之，布政使為熟悉雲南情況的呂鳴章，按察使為韓霖，都指揮使為舉義有功的何進忠，以昆明為首府，調李發愚為昆明知府。
錢澄之按照呂鳴章的建議，在雲南實行“精兵簡政”的政策，寬待百姓，輕徭薄賦，著力恢複經濟生產，進行了一定程度的行政改革:
將鎮雄、烏蒙、烏撒三府合並為烏蒙府；
將東川、武定、尋甸三府合並為東川府；
曲靖府區域不變，但將府內所有的衛、所一律取消，變為縣；
以行政機構重名為由，裁撤臨安府、廣西府和廣南府，將原本隸屬臨安府的嶍峨縣、河西縣和通海縣以及隸屬於廣西府的彌勒州改隸澂江府，將廣西府的北境師宗縣劃給曲靖府，將廣西府的南境維摩州與廣南府、原臨安府東半部分合為新的行政區文山府；
在原臨安府剩餘的一半區域建立蒙自府；
合並元江府、鈕兀安撫司、威遠州、鎮沅府、者樂甸安撫司和新化州，成立新的元江府；
將車裡宣慰司改為景洪都督府；
將孟艮府改名為景棟府，區域不變；
將孟璉宣慰司改名為孟璉都督府，區域不變；
將孟定府、鎮康州、猛緬安撫司合並為孟定府，以馬援城為首縣；
將灣甸州、順寧府、大侯州、景東府合並為順寧府；
將永昌府更名為保山府，將府內的高黎共山以北區域劃出，將境內的安撫司、宣撫司一律更名為縣；
將南甸宣撫司、芒市安撫司、乾崖宣撫司、盞達付宣撫司、隴川宣撫司、以及緬甸境內的蠻莫安撫司、摩勒江以北以及大金沙江（即緬甸伊洛瓦底江）以東部分全部劃為隴川都督府管轄；
將原裡麻司區域加上從保山府劃出的高黎共山以北區域，成立茶山都督府；
撤銷永寧府，將永寧府的府城劃入麗江府，組成新的麗江府，將永寧府的香羅甸司、刺次合司和瓦魯之司劃歸四川；
將鶴慶府、大理府、蒙化府三府合並，成立新的大理府；
將姚安府和北寧州合並，組成新的姚安府。
綜上，整個雲南省縮編為十五府和四個都督府組成，行政效率大大提升。
中漢國皇帝張鹿安給雲南省行政班子的要求是，確保雲南內部安定，對外則是不斷給緬甸東籲王朝以及吳三桂的吳周軍施加壓力。
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為此任命趙良棟暫時兼任為隴川都督府大都督，在省府的領導下，全力對付西緬軍和吳周軍。
在趙良棟所部的壓力之下，吳三桂隻得帶兵翻越延綿不絕的高山、穿過了原始森林，開始進攻濕熱的阿豪馬王國，暫時根本無暇他顧；
而西緬的東籲王朝也不好過，一方麵要應對東緬的進攻，內部還有孟族之亂，南麵還有阿拉乾土匪和西洋人組織的海盜，已經讓東籲國王彌利提疲於應付，根本無力對北麵的中漢軍發動進攻。
在這樣的情況下，雲南省以及之前占據的廣南省、安南都護府和瀾滄都護府，便都有了一段難得的和平發展的時光。
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