物並不重視，且昭陵地宮結構複雜，很可能存在溫韜未發現的隱秘墓室。太宗或許早已預料到墓穴被盜的風險，將《蘭亭序》真跡藏於隱蔽的地方，未被溫韜察覺。
推測二：李治調包，真跡流出昭陵
北宋文學家蔡挺在《蔡寬夫詩話》中提出，唐高宗李治或許並未真正遵旨將真跡殉葬。他推測，李治本身也非常喜愛《蘭亭序》，可能以一件摹本替代真跡，將真跡留在了宮中，後可能傳入武則天手中。這一說法得到部分學者支持，認為以李治的性格，確實存在“違逆父命”的可能。
推測三：真跡被毀
溫韜出身武夫，文化素養極低，對書畫文物的價值認知有限。有學者推測，溫韜在盜墓時，可能將《蘭亭序》真跡當作普通廢紙，或因紙張脆弱在搬運中損毀，或被其隨意丟棄，最終化為塵土。
-推測四：鄭玄素證言與真跡散佚
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據《太平廣記》記載，溫韜的外甥鄭玄素曾隨溫韜一同進入昭陵地宮，親眼見過《蘭亭序》真跡，“紙墨尚新，字如龍鳳飛舞”。但溫韜後來因謀反被誅殺，其所盜文物也被瓜分散佚，《蘭亭序》真跡可能在此時流入民間，後因戰亂等原因徹底失蹤。
四種推測各有依據，卻都缺乏確鑿證據，昭陵之下的《蘭亭序》真跡，如同被曆史迷霧籠罩，真假難辨。
從晚唐開始，另一種關於《蘭亭序》真跡下落的說法逐漸流傳：真跡並未藏於昭陵，而是被武則天帶入了乾陵。
宋代文人歐陽修在《新五代史》中曾提及“或言《蘭亭序》在乾陵”，米芾在《書史》中也記載“《蘭亭序》真跡，為則天所秘藏，後隨葬乾陵”。
這種說法也並非捕風捉影，史書記載，武則天酷愛書法，尤其推崇王羲之。她在位期間，曾多次下詔搜求王氏墨跡，還命宮廷畫師、書法家臨摹《蘭亭序》達百卷之多，分賜各地寺院與重臣。若李治真以摹本調包真跡，將其留在宮中，作為李治皇後的武則天，極有可能將真跡據為己有。以武則天的權勢與對書法的癡迷，將《蘭亭序》真跡作為自己的陪葬品，完全是可能的。
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