淩雲那份精心炮製的《格物真源疏》，如同一位身披儒袍卻懷揣機關巧器的說客，乘著快船，駛向了權力與傳統的漩渦中心——北京紫禁城。他試圖在儒家的話語體係內，為“科學”這頭闖入瓷器店的巨象尋找一個合宜的座位，哪怕隻是角落裡的一個小凳。
然而，思想的碰撞遠比戰艦的對轟更為複雜難測。奏疏送達通政司，其內容便如同滴入沸油的冷水，瞬間在朝堂上下炸開了鍋。
支持者，主要是那些已從南洋貿易、工礦建設中嘗到甜頭的勳貴、部分務實派官員以及悄然興起的“格物派”年輕學子。他們引經據典（主要是《考工記》、《天工開物》等相對邊緣的典籍），附和淩雲“即物窮理”、“利國惠民”的說法，認為格物之學乃是“聖學之羽翼”，“能佐王化，實倉廩，強甲兵”，是富國強兵的必由之路。天津衛格物分苑的初步成效——幾台改良後的蒸汽抽水機已開始試用於漕船維修碼頭，效率顯著——成為他們最有力的實證。
反對者，則主要是以翰林院、都察院清流為代表的保守派文官。他們抨擊淩雲“曲解聖賢”、“以末技充正學”，認為格物之學“徒擅奇巧，惑亂人心”，若任其發展，必將導致“禮崩樂壞，人心不古”。他們緊緊抓住“格物分苑招收生徒不分良賤”這一點大做文章，視其為對士農工商等級秩序的嚴重挑戰。更有甚者，翻出之前呂宋“役使土著”、“毀壞山林”的舊賬，將淩雲描繪成一個“苛虐百姓、罔顧仁政”的酷吏。
雙方在朝堂之上引經據典、唇槍舌劍，奏章如雪片般飛入內廷。朱棣端坐於龍椅之上，靜聽雙方辯論，麵色沉靜如水，內心卻波瀾起伏。他欣賞淩雲的能力和帶來的實際利益，帝國的財政、軍事實力因南洋體係而肉眼可見地增強，北征蒙古的後勤也因此受益。但另一方麵，他自幼接受儒家教育，深知意識形態對於維係統治的重要性。一個脫離儒家經典束縛、自成體係的知識和權力中心的出現，讓他本能地感到警惕。尤其是淩雲在奏疏中隱約流露出的，那種將“物理”置於“天理”之上的傾向，更讓他心生不快。
這場“名分之爭”暫時沒有定論。朱棣采取了慣用的平衡手段，他下旨褒獎淩雲“格物有功，利在社稷”，肯定了格物之學的實用性，但卻對《格物真源疏》中關於思想本源的部分不置可否，也未明確給予格物之學與科舉儒學同等的地位。同時，他默許了天津衛格物分苑的繼續存在和有限擴張，卻又暗中指示東廠，加強對分苑及與呂宋往來人員的監視。
這是一種典型的帝王心術：用其能，防其勢。
當京城的政治風波通過密信傳回呂宋時，淩雲隻是淡淡一笑，並未感到意外。他知道，思想的轉變非一日之功，能爭取到目前這種“不反對，有限支持”的局麵，已是階段性勝利。至少，格物之學有了在皇權默許下生存和發展的空間。他將更多精力投向了迫在眉睫的南方威脅。
就在朝堂爭論不休之際，“深淵應對特種艦隊”的訓練遭遇了真正的挑戰。
李參將率領艦隊，對之前發現異常信號的海域進行了一次主動的深潛探測。他們使用加裝了額外防護鋼纜和強光探照燈的重型潛水鐘，試圖近距離觀察海底“殖裝場”的情況。
下潛過程起初順利，但當潛水鐘接近那片依托海溝熱泉建立的、如同噩夢般蠕動的“囊泡”森林時，異變陡生！
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潛水鐘外部安裝的、由“禦靈”項目提供的實驗性靈能感應器（基於玄璣子的腦波模型製作，能探測特定頻段的意識場波動）突然發出了刺耳的警報！指針瘋狂擺動，顯示周圍存在著極其強大而混亂的靈能場！
緊接著，聲呐員聽到了密集的、令人頭皮發麻的刮擦聲和撞擊聲。通過潛水鐘的耐壓玻璃窗，操作員驚恐地看到，無數之前未曾見過的、體型更小、形如放大了千百倍的海虱或蠕蟲的變異體，從“囊泡”的縫隙中、從海底的沉積物裡蜂擁而出！它們似乎對潛水鐘散發出的微弱金屬信號和生命氣息極為敏感，瘋狂地撲上來，用鋒利的口器和附肢啃咬著潛水鐘的外殼和鋼纜！
更糟糕的是，一股強大的、帶著冰冷惡意的精神波動，如同無形的潮水，穿透了海水和厚厚的金屬艙壁，直接衝擊著潛水鐘內操作員的心神！
“啊！”操作員抱頭慘叫，感覺仿佛有無數冰冷的針在刺穿他的大腦，各種混亂、暴戾的幻象在眼前閃現，幾乎讓他精神崩潰。通訊頻道裡瞬間充滿了雜音和痛苦的嘶吼。
“緊急上浮！切斷連接！快！”李參將在旗艦上接到報告，當機立斷。
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