天佑元年甲子年（公元904年）
五月丙寅日，朝廷加封河陽節度使張漢瑜為同平章事。
昭宗在崇勳殿設宴款待朱全忠和文武百官，宴席散後，又召朱全忠到內殿赴宴。朱全忠心中起疑，沒有進去。昭宗說：“朱全忠不願意來，那就讓敬翔來吧。”朱全忠找個借口打發敬翔離開，還說：“敬翔也喝醉了。”辛未日，朱全忠動身返回東邊，乙亥日，抵達大梁。
忠義節度使趙匡凝派遣水軍逆著三峽而上，攻打王建占據的夔州，渝州知州王宗阮等人率軍將其擊敗。萬州刺史張武打造鐵索橫截長江中遊，在鐵索兩端修築營寨，稱之為“鎖峽”。
六月，李茂貞、王建、李繼徽傳布檄文，約定合兵討伐朱全忠。朱全忠任命鎮國節度使朱友裕為行營都統，率領幾萬步兵騎兵迎擊敵軍；又命令保大節度使劉鄩放棄鄜州，領兵駐守同州。癸醜日，朱全忠親自率軍從大梁出發，向西征討李茂貞等人。秋季七月甲子日，朱全忠路過東都洛陽，入城朝見昭宗。壬申日，抵達河中。
西川的眾將領勸說王建，趁著李茂貞勢力衰弱，出兵攻取鳳翔。王建就此詢問節度判官馮涓，馮涓回答：“兵器是凶險的器物，用兵會殘害百姓、耗費錢財，不能窮兵黷武。如今朱溫的汴梁軍和李克用的晉軍像猛虎一樣爭鬥，勢不兩立，要是他們兩家合並為一，發兵攻打蜀地，就算是諸葛亮複活，也抵擋不住。鳳翔是蜀地的屏障，不如和李茂貞締結姻親，和睦相處。天下太平就督促農耕、訓練軍隊，穩固邊疆；局勢有變就窺伺時機，等待破綻再行動，這樣才能萬無一失。”王建說：“說得好！李茂貞雖然是個庸才，但有強悍的名聲，遠近勢力都忌憚他，他和朱全忠硬碰硬較量肯定不夠，但自保綽綽有餘，讓他做我的屏障，好處太多了。”於是王建和李茂貞修複關係、重歸於好。丙子日，李茂貞派遣判官趙閎前往西川，替他的侄子、天雄節度使李繼崇求婚，王建把女兒嫁給了李繼崇。李茂貞多次向王建索要財物和兵器鎧甲，王建都如數供給。王建征收賦稅十分繁重，百姓沒人敢有怨言。馮涓借著王建生日獻上頌文，先讚美他的功德，再訴說百姓的疾苦。王建慚愧地道歉說：“有你這樣忠心進諫，我還愁什麼功業不成！”隨即賞賜馮涓金銀綢緞。從這以後，賦稅征收才稍有減輕。
當初，朱全忠從鳳翔護送昭宗車駕返回長安，看見德王李裕眉清目秀，而且已經成年，心裡十分厭惡，私下對崔胤說：“德王曾經妄圖篡奪帝位，怎麼能繼續留在世上！你怎麼不向皇上進言除掉他！”崔胤把這話轉告給昭宗。昭宗質問朱全忠，朱全忠說：“陛下父子之間的事，臣怎麼敢私下議論，這是崔胤出賣我啊。”昭宗自從離開長安，每天都擔心會有不測，整天和皇後借酒消愁，有時還相對哭泣。朱全忠派樞密使蔣玄暉暗中監視昭宗，昭宗的一舉一動他都了如指掌。昭宗曾神色從容地對蔣玄暉說：“德王是我的愛子，朱全忠為什麼執意要殺他？”說著就流下眼淚，咬得中指鮮血直流。蔣玄暉把這些事一五一十稟報給朱全忠，朱全忠心裡越發不安。
當時李茂貞、楊崇本、李克用、劉仁恭、王建、楊行密、趙匡凝之間互通檄文，都以興複唐室為借口。朱全忠正領兵討伐他們，又顧忌昭宗有英明果決的氣概，擔心宮中發生變故，想要擁立年幼的皇子做皇帝，方便謀劃禪讓帝位的事。於是他派遣判官李振前往洛陽，和蔣玄暉、左龍武統軍朱友恭、右龍武統軍氏叔琮等人謀劃除掉昭宗。
八月壬寅日，昭宗在椒殿，蔣玄暉挑選龍武軍牙官史太等一百人，在夜裡敲擊宮門，謊稱前線有緊急奏報，要當麵稟報昭宗。夫人裴貞一開門看見士兵，質問：“緊急奏報為什麼要帶士兵來？”史太當場殺死了她。蔣玄暉追問：“皇上在哪裡？”昭儀李漸榮走到欄杆邊大聲呼喊：“要殺就殺我們，別傷害皇上！”昭宗當時正喝醉了，急忙起身，穿著單衣繞著柱子逃跑，史太追上後將他殺害。李漸榮用身體護住昭宗，也被史太殺死。蔣玄暉等人又想殺何皇後，皇後向蔣玄暉苦苦哀求，才得以幸免。
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癸卯日，蔣玄暉假傳詔書，謊稱李漸榮、裴貞一謀反弑君，應當擁立輝王李祚為皇太子，改名為李柷，監理軍國政事。又假傳皇後的命令，讓皇太子在昭宗靈柩前即位。宮中上下一片恐懼，連哭出聲都不敢。丙午日，昭宣帝李柷即位，當時年僅十三歲。
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