維持係統。劇烈的爆炸和管道破裂引發的連鎖反應，癱瘓了E區大部分功能，也阻斷了自毀程序的完全執行。
而指揮中心方向，重傷的李博士終於在被炸毀的主控台殘骸下，找到了躲藏的總監“代達羅斯”。這位曾經高高在上、意圖駕馭“歸墟”的狂人，此刻衣衫不整，眼神渙散，手中緊緊抓著一個類似起爆器的紅色東西。
“結束了，代達羅斯。”李博士用槍指著他，鮮血從手臂不斷滴落。
總監看著他，忽然古怪地笑了：“結束？不，李，這隻是開始……‘歸墟’會證明我是對的……你們……都會成為它的一部分……”他猛地按下了手中的按鈕！
然而，什麼也沒發生。除了遠處E區傳來的又一聲悶響，那是備用起爆裝置被索菲亞小隊破壞的結果。
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總監愣住了，隨即像被抽空了所有力氣般癱軟下去，口中喃喃著無人能懂的話語。
隨著指揮中心被控製、E區被癱瘓、各層“哨兵”部隊在起義軍內外夾擊和“希望號”在地堡外部空域進行的威懾性巡航下逐漸喪失鬥誌或投降，持續了將近十個小時的激烈內亂，終於以起義軍的慘勝告終。
清點結果，起義軍和平民傷亡超過八百人，“哨兵”部隊大部被殲，少數投降。總監代達羅斯被俘，E區實驗室被徹底封閉，等待後續處理。地堡滿目瘡痍，但一種混雜著悲痛與希望的情緒，開始在幸存者中蔓延。
三天後，傷勢未愈但堅持出席的漢森將軍，與李博士、米勒、索菲亞以及新推選出的平民代表一起，在曾經的總監辦公室，如今被簡單布置成臨時議事廳與“希望號”的趙剛，以及龍宮總部的林薇，舉行了三方會談。
李博士代表新生的伊甸地堡管理委員會，正式宣布：徹底廢除總監代達羅斯的“升華計劃”及一切相關研究；在龍宮技術監督下進行銷毀所有“融合實驗體”及高危樣本；承諾遵循基本人道原則，重建地堡社會秩序；並申請以平等成員身份，加入龍宮全球抵抗聯盟，共享情報、技術，共抗“歸墟”。
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