喜率軍抵達義鄉。孔璪駐紮在吳興南亭，太守王曇生前往孔璪處商議事務；得知朝廷軍隊已經逼近，孔璪大為恐懼，從床上摔下來，說：“朝廷懸賞捉拿的人，隻有我而已；如今不趕緊逃走，就要被人擒獲了！”於是與王曇生逃奔錢唐。吳喜進入吳興，任農夫領兵前往吳郡，顧琛棄郡逃奔會稽。明帝因吳、吳興、義興、晉陵四郡已經平定，便留下吳喜統領沈懷明等將領向東攻打會稽，征召張永等向北攻打彭城，江方興等向南攻打尋陽。
又任命吏部尚書蔡興宗為左仆射，侍中褚淵為吏部尚書。
二月初九，吳喜抵達錢唐，孔璪、王曇生逃奔浙東。吳喜派遣強弩將軍任農夫等領兵前往黃山浦；東部叛軍沿河岸紮寨，任農夫等擊敗叛軍。吳喜從柳浦渡江，攻取西陵，擊殺庾業。會稽人對此極為恐懼，將士大多逃亡，孔覬已經無法控製局勢了。二月二十日，上虞縣令王晏起兵攻打會稽郡城，孔覬逃奔脊山；車騎從事中郎張綏封存府庫等待吳喜。二月二十一日，王晏進入郡城，殺死張綏，在偏殿抓獲尋陽王劉子房。緊接著，放縱士兵大肆搶掠，府庫被洗劫一空；擒獲孔璪，並將其斬首。二月二十二日，脊山百姓捆綁著孔覬送給王晏，王晏對他說：“這事是孔璪乾的，與你無關，你可以寫一份自首狀，我會為你向皇上申訴。”孔覬說：“江東的謀劃部署，沒有一件不是我做主的；把罪責推給別人以求活命，這是你們這類人的做法罷了。”王晏於是將他斬首。顧琛、王曇生、袁標等人前往吳喜處請罪，吳喜都寬恕了他們。東部叛軍的主將共有七十六人，在戰場上斬殺十七人，其餘的全部赦免。
薛索兒攻打申闡，久攻不下；派申令孫進入睢陵勸說申闡，申闡出城投降，薛索兒隨後下令讓申令孫殺死申闡。
山陽王劉休佑駐紮在曆陽，輔國將軍劉勔進軍小峴。殷琰任命的南汝陰太守裴季之獻出合肥投降朝廷。
鄧琬性情鄙陋昏庸、貪婪吝嗇，掌握大權後，父子二人賣官鬻爵，還派婢女仆役到集市上販賣物品；日夜沉迷於飲酒高歌、下棋賭博，毫無節製；還自視甚高，有賓客登門拜訪，往往十幾天都見不到他；內部事務全部委托給褚靈嗣等三人，一群小人橫行霸道，爭相作威作福。於是官吏百姓怨聲載道，朝廷內外人心離散。
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鄧琬派遣孫衝之率領龍驤將軍薛常寶、陳紹宗、焦度等一萬兵力作為前鋒，占據赭圻。孫衝之在途中給晉安王劉子勳寫信說：“船隻已經備好，糧草武器也已整頓完畢，三軍將士鬥誌昂揚，人人爭相效命；正準備沿江東下，直取白下。希望迅速派遣陶亮等大軍日夜兼程前來接應，分兵占據新亭、南州，那麼一聲令下就能平定京都。”劉子勳加封孫衝之為左衛將軍；任命陶亮為右衛將軍，統領郢、荊、湘、梁、雍五州兵力共計二萬人，一同東下。陶亮本無才乾謀略，得知建安王劉休仁率軍北上，殷孝祖又已趕到，因此不敢前進，駐軍於鵲洲。
殷孝祖自恃忠誠節氣，便輕視侮辱各位將領，朝廷軍隊中凡是父子兄弟在南方叛軍轄區的，殷孝祖全都想追究治罪。因此人心背離，沒人願意為他效力。寧朔將軍沈攸之，對內安撫將士，對外協調各位將領，眾人都依賴他。殷孝祖每次作戰，常常讓儀仗隊跟隨在身邊，軍中將士相互議論說：“殷統軍可以說是找死的將領啊！如今與叛軍交戰，卻用儀仗隊標榜自己，要是有十個擅長射箭的人一起射擊他，想不死都難！”三月初三，各路軍隊水陸並進，攻打赭圻；陶亮等領兵救援，殷孝祖在戰場上被流箭射中，戰死。軍主範潛率領五百人向陶亮投降。人心極為震駭，眾人都認為沈攸之應當接替殷孝祖擔任主帥。
當時建安王劉休仁駐紮在虎檻，派遣寧朔將軍江方興、龍驤將軍襄陽人劉靈遺各自率領三千人趕赴赭圻。沈攸之認為殷孝祖已死，陶亮等人有乘勝進攻的心思，第二天如果不再發起進攻，就會向叛軍示弱。江方興與自己職位相當，必定不會屈居自己之下；軍政不統一，是導致失敗的原因。於是率領各位軍主前往江方興處說：“如今四方都在反叛，國家所保住的，不過百裡之地。隻有殷孝祖被朝廷托付重任，可剛一交戰，就兵敗身亡，文武官員士氣低落，朝野上下人心惶惶。事情能否成功，就看明天這一戰了；如果作戰失利，那麼國家大事就無可挽回了。明天的戰事，眾人有的認為應當由我統領，我自忖懦弱淺薄，才乾謀略不如你。現在就推舉你為主帥，我們隻應當同心協力作戰罷了。”江方興聽後十分高興，便答應了他。沈攸之出來後，各位軍主都責怪他，沈攸之說：“我本來是為了救國保家，哪裡計較職位的升降！況且我能屈居他之下，他必定不能屈居我之下。共同渡過難關，怎麼能計較彼此的異同呢！”孫衝之對陶亮說：“殷孝祖是一員猛將，一戰就被殺死，天下大事已經定了，不必再交戰，應當直接攻取京都。”陶亮沒有聽從。
三月初四，江方興率領各路軍隊進軍交戰，建安王劉休仁又派遣軍主郭季之、步兵校尉杜幼文、屯騎校尉垣恭祖、龍驤將軍京兆人段佛榮等三萬人前往會合作戰，從寅時到午時，大敗叛軍，追擊到姥山後返回。杜幼文是杜驥的兒子。
孫衝之在湖口、白口修築兩座城池，軍主竟陵人張興世攻下了這兩座城。
。事軍諸鋒前督都祖孝殷替接，節假、軍將國輔為之攸沈命任詔下帝明，五初月三
。湖濃守據力合，回撤部全也，寨營的置設岡山各及山姥在先原；圻赭守駐人等寶常薛下留，尾鵲回返之衝孫召忙急，懼恐為大，守失池城座兩口白、口湖知得亮陶
。位爵官散的等不品三至品五予授者或，郡、縣的蕪荒們他給賜賞，食糧財錢獻捐姓百募招廷朝，足不政財家國，起興模規大事戰時當
。德離心離人一有沒，軍大萬十此因；屬家士將亡陣恤撫自親，員傷問慰、者死悼哀，資物食糧配分均平，士將問慰撫安仁休劉王安建，缺短食糧中軍
騎甲鐵、人萬三領率胡劉史刺州豫遣派琬鄧
