來與裴炎交情深厚，人們因為他們的情誼始終沒有改變，稱他們為“耐久的朋友”。周興於是上奏誣告魏玄同，謊稱他說過“太後年紀大了，不如輔佐繼位的君主，這樣才能長久安穩”。太後聽後大怒，閏月甲午日，下令賜魏玄同在家自儘。監刑禦史房濟對魏玄同說：“您為何不主動告密，或許能借此獲得召見，趁機為自己辯白！”魏玄同歎息道：“被人殺死和被鬼殺死，又有什麼區別呢？我豈能去做告密這種事！”隨後從容赴死。太後又派人在隱蔽的地方殺死夏官侍郎崔詧。除此之外，朝廷內外還有很多大臣被處死或流放。
彭州長史劉易從也被徐敬真牽連，戊申日，在彭州被處死。劉易從為人仁厚孝順、忠誠謹慎，他在街市上將要受刑時，當地的官吏和百姓都憐憫他是無辜的，從四麵八方趕來，紛紛脫下自己的衣服扔在地上，說：“願用這些衣服為長史祈求陰間的福分。”官府清點這些衣服的價值，總共超過十萬錢。
周興等人誣告右武衛大將軍燕公黑齒常之謀反，朝廷將他召回京城關進監獄。冬季，十月戊午日，黑齒常之在獄中上吊身亡。
己未日，朝廷處死宗室鄂州刺史嗣鄭王李璥等六人。庚申日，嗣滕王李修琦等六人被免去死罪，流放到嶺南。丁卯日，朝廷任命春官尚書範履冰、鳳閣侍郎邢文偉同為同平章事。己卯日，太後下詔，規定太穆神皇後、文德聖皇後應當配享皇地隻的祭祀，忠孝太後陪同配享。
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右衛胄曹參軍陳子昂呈上奏疏，認為：“周朝稱頌周成王、周康王，漢朝稱頌漢文帝、漢景帝，都是因為他們能夠擱置刑罰、以德治國的緣故。如今陛下的治理雖然已經十分完善，但太平盛世的朝堂上下，百姓都樂於接受教化，不應該總有亂臣賊子每天觸犯國法、遭受上天的誅殺。近來大案要案不斷增多，被指控為叛逆的人越來越多。我愚昧遲鈍，起初以為這些人都罪有應得，直到上月十五日，陛下特地查清囚犯李珍等人無罪並赦免了他們，文武百官都為之慶賀喜悅，紛紛稱頌陛下聖明，我才知道原來也有無辜之人落入寬大的法網中。陛下一心致力於推行寬和的法令，而獄官卻急於施行嚴酷的刑罰，這既損害了陛下的仁德，也玷汙了太平盛世的清明政治，我私下裡對此深感痛惜。另外，陛下頒布敕令赦免張楚金等人死罪的時候，起初風雨交加，隨後便轉為吉祥的祥雲。我聽說，陰氣凝重代表刑罰嚴苛，陽氣舒朗代表君主德政；聖明的君主效法上天行事，上天也會輔佐聖明的君主。天意既然如此，陛下怎能不順應天意呢！如今又出現陰雨天氣，我擔心過錯出在獄官身上。凡是被關押在監獄裡的囚犯，大多被判處了死刑，民間百姓對此議論紛紛，意見不一。陛下為何不召見所有囚犯，親自審問他們的罪名？確實有罪的，就公開依法懲處；被冤枉的，就嚴厲懲治相關獄官，讓天下人都心悅誠服，人人都知曉朝廷的政令和刑罰，這難道不是陛下至高無上的德行彰顯於世的體現嗎！”
天授元年，公元690年，十一月庚辰朔日，冬至。太後在萬象神宮舉行祭祀大典，大赦天下。朝廷開始采用周曆，將永昌元年十一月改為載初元年正月，把十二月定為臘月，夏曆正月改為一月。朝廷將周朝、漢朝的後裔封為“二王後”，將舜、禹、成湯的後裔封為“三恪”，北周、隋朝的後裔則享受與列國諸侯同等的待遇。
鳳閣侍郎河東人宗秦客，改造了“天”“地”等十二個字進獻給太後。丁亥日，這些新字正式推行。太後為自己取名為“武曌”，同時將皇帝的“詔”書改為“製”書。宗秦客是太後堂姐的兒子。乙未日，司刑少卿周興上奏，請求廢除李唐皇室成員的宗族名籍。臘月辛未日，朝廷任命僧人薛懷義為右衛大將軍，賜封爵位為鄂國公。
春季一月戊子日，武承嗣升任文昌左相，岑長倩升任文昌右相、同鳳閣鸞台三品，鳳閣侍郎武攸寧被任命為納言，邢文偉暫代內史一職，左肅政大夫、同鳳閣鸞台三品王本立被罷免，改任地官尚書。武攸寧是武士彠哥哥的孫子。
當時武承嗣、武三思專權用事，宰相們都對他們阿諛奉承。地官尚書、同鳳閣鸞台三品韋方質身患重病，武承嗣、武三思前去探望，韋方質靠著床榻，沒有對他們行拜見之禮。有人勸說他要懂得變通，韋方質回答：“生死自有天命，大丈夫怎能屈身侍奉皇親國戚，來換取苟且偷生的機會呢！”不久後，韋方質就被周興等人誣陷構罪。甲午日，他被流放到儋州，家產也被官府查抄沒收。
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