就在朱慈烺專注於應對北方變局和鞏固內部之時，西南方麵，由陳子龍一手策劃的、解決孫可望問題的最終行動，也進入了收官階段。
困守夔州數月，外有豪格大軍壓境，內有部將離心離德，朝廷的援助更是幾乎斷絕，孫可望已到了山窮水儘的地步。他性情愈發暴戾多疑，動輒打殺屬下，使得人心更加離散。
陳子龍審時度勢，認為時機已然成熟。他秘密聯絡了對孫可望早已不滿的劉文秀、艾能奇，以及被策反的孫部將領，定下了裡應外合之策。
這一夜，夔州城內，風雨交加。被孫可望無故鞭笞的一名親衛隊長懷恨在心，按照與陳子龍約定的信號，悄然打開了西門。早已埋伏在城外的劉文秀部精銳，如同潮水般湧入城內！與此同時，城內被策反的將領也紛紛起事，圍攻孫可望的府邸。
孫可望猝不及防，身邊僅有少數死黨抵抗。混亂中，這位一度叱吒風雲、野心勃勃的梟雄，被亂箭射殺於自己的節度使府大堂之內。其殘餘部眾，大部分被劉文秀、艾能奇收編，小部分潰散。
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孫可望之死，標誌著西南地區最大的不穩定因素被徹底清除。劉文秀、艾能奇在陳子龍的協調和朝廷的支持下，正式整合了原大西軍餘部，並接受了朝廷的整編，分別被任命為四川總兵官和雲南總兵官，名義上歸湖廣總督何騰蛟節製。儘管他們仍保有相當大的獨立性，但至少在名分和戰略上，已完全納入南明體係。
消息傳回南京，朱慈烺終於鬆了一口氣。困擾多時的西南頑疾，終於以一種相對徹底的方式解決。他立刻下旨，嘉獎陳子龍之功，擢升其為右僉都禦史，仍留任西南，協調劉、艾二人，共同應對豪格。同時，厚賞劉文秀、艾能奇及其部下，並承諾將儘快輸送一批糧餉軍械，助其穩固川東防線。
西南局勢的初步安定，極大地減輕了朱慈烺的戰略壓力，使他能更專注於東部主戰場。
而就在此時，又一個意想不到的使者，漂洋過海，來到了南京。來的不是朝鮮人，也不是西洋人，而是來自大明最南端的藩屬——安南（越南）後黎朝的使臣。
原來，安南國內一直關注中原局勢。南明弘光政權建立，尤其是在江淮站穩腳跟並取得一係列軍事勝利後，安南國王決定重新向大明遣使朝貢，以確認藩屬關係，並試探這個新朝廷的態度。
朱慈烺在武英殿接見了安南使臣。使臣恭敬地行了三跪九叩大禮，獻上國書和貢品（象牙、香料、金銀器等），言辭懇切，表達了對大明正統的尊崇和對弘光皇帝中興的祝賀。
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