那位大統領上任沒多久，就遇到了麻煩，一時間半島政壇風雲動蕩，班行遠無心也無力關注。
2003年5月，感覺到一直研究的數學問題到了突破的時候。除了每周上一節曆史文化課還有正常的學生指導，其他的活動全都推掉，全力攻堅。這一次的數學證明非常艱辛，耗儘了他全部的精力。
因為在證明過程中突然來了靈感，順手解決了一個計算機科學領域關於計算複雜性的問題。這個問題是計算機科學的核心問題之一，之前普遍認為這個問題是哥德爾描述的那類不可證明的問題，也就是在現有體係內不能證明真假。班行遠儘管沒有完整的證明這個問題，也沒有給出問題證明的路線方向，但是他最終證明了這一問題是可證的。這也是很了不起的突破，畢竟明確了今後工作的方向。同時在證明過程中還得到了一個很意外的結果：至少存在一個未知的嚴格順序執行並且能夠完整執行的算法，該算法前麵步驟的計算依賴後麵步驟的結果，該算法在現有體係下無法設計無法描述。論文發表後立即引起轟動。
那個計算複雜性問題可以證明的結論倒還好，關鍵是班行遠在論文裏提到的那個算法，這完全是一個重大發現，預示著在計算機科學方麵還有許多的未知需要探索。編寫排版軟件那次不算，班行遠這次算是進入計算機科學的圈子裏了。
不單是計算機學界，在數學界一些數學家受到班行遠論文的啟發，證明了存在一類數學問題，這類問題隻能用歸納法證明，並且在用歸納法證明時要想前麵的環節是正確的必須首先要後麵的環節正確。麵對這些成果，無數的學者陷入了沉默，因為現實中一些重要的數學猜想真的不能排除是這類問題的可能。這完全是顛覆性的，也意味著全新的方向和方法。數學家一向都不擔心有新的難題，反而跟擔心不知道有沒有難題。有困難解決就好，反正他們是世界上最聰明的人。
一些學者斷言，班行遠的這篇論文值得一個圖靈碗和一個菲爾茨獎。計算機科學和數學其實是不分家的。
班行遠已經顧不上外界的這些紛擾了。整個工作進展的十分順利，畢竟所有的內容都已經在腦子裏了，隻要把論文寫好就可以了，所有工作到7月中旬就可以完成。但是還是因為一場意外住院，延遲了一段時間。
班行遠是在非典爆發前返回韓國的，但還是意外的中招了，禽流感。
本來以為隻是普通的感冒，但是症狀越來越嚴重，不得不住院治療，最經確診禽流感。這下子熱鬨了，班行遠是一個老師還帶著課呢，整個首爾大學都緊張起來，寶兒、徐珠璿、金泰熙……數不清的密接、次密接。還好經過排查隻有他一個人確診。
也合該他倒黴。李惠安的離世對他的打擊太大了。雖然看上去沒什麽事的樣子，但實際上無時不刻都處於極度的痛苦之中，他的精神一直都處於崩潰的邊緣。高強度的腦力活動在榨乾他全部精力的同時，也透支了他的健康。
最初住院的時候情況並不算太嚴重，忽然有一天就凶險了起來，班行院被送入了重症監護病房。已經解除確診風危的寶兒收到醫院的病危通知後一下子就癱在了地上。得到消息匆匆趕來的金泰熙和徐朱璿兩個人合力攙扶著她趕到了醫院。寶兒的手抖得都沒有辦法在有關文件上簽字了，最後還是三個人中年齡最大的金泰熙簽署了有關的文件。情況緊急，她也顧不上是不是符合親屬關係的要求了。寶兒已經無法想像也無法承受親人的再一次離開了。三個人隔著玻璃窗看到渾身插滿各種管子的班行遠後抱在一起大哭起來。
還好有驚無險。在重症監護病房搶救了10天後，逐漸恢複的班行遠回到了普通病房。流調顯示，病原體是鳥類在他的院子停留帶來的，如果班行遠住的是樓房完全不會遇上這個無妄之害。醫生也告訴他但凡免疫力強一些也完全能抗得過去，班行遠的精神和身體狀況差不多到了油儘燈枯的地步。
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班行遠感覺恢複的差不多了，提出要回家休養。還沒等寶兒開口就被徐朱璿一把給按在了床上：“老師身體沒有完全恢複前一步也別想走出病房。”徐朱璿別看平時非常乖巧聽話，但是在原則問題上是非常有主見的，而且做決定時毫不猶豫，也不會輕易讓步。班行運這位老師恰恰是她心中最重的那個原則。這個在她看來比父母還要疼愛她的老師是她最敬重的。
班行運隻好住在醫院裏將養身體。至於做數學研究，想都不要想。還好他爭取到了審閱期刊稿件的權力，也不會過於無聊。同時班行遠也要求兩個人該工作工作，該上學上學，不用每天都陪在醫院裏。因為相關通報裏並沒有披露完整的個人信息，除了金泰熙不時過來，也不會有其他人來探視，日子倒也清靜，身體恢複的也很快。至於那個數學問題，論文已經基本上寫完了，就差收尾了，班行遠也不很著急。
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