啟元四年夏，帝都北京的順利光複與迅速穩定，如同一顆投入湖麵的巨石，其引發的漣漪以無可阻擋之勢向帝國的每一個邊緣角落擴散。赤龍旗在紫禁城升起的那一刻，不僅標誌著愛新覺羅氏統治的終結，更向所有尚在觀望、猶豫甚至企圖負隅頑抗的勢力，發出了一個清晰無比的信號：天命已改，新朝鼎立，順之者昌，逆之者亡！
帝國的文告與諭令，伴隨著帝國的兵鋒，迅速傳遍四方。對於廣大的中原、江南乃至部分北方省份而言，清廷中樞的崩潰早已在預料之中。各地督撫、州縣官員，早已通過各種渠道了解了帝國的新政與軍威。此刻，見大勢已去，為保身家性命與官位前程，絕大多數人選擇了最明智的道路。
一道道降表、賀表如雪片般飛向北京的行營和新京的皇宮。原先的清朝總督、巡撫、知府、知縣們，紛紛主動派人或親自前往最近的帝國軍政長官處，表示歸順。他們交出印信，獻上戶籍圖冊，承諾效忠中華帝國皇帝柏淩雲，並積極配合帝國派來的接收人員開展工作。如兩江總督劉坤一、湖廣總督張之洞等地方實力派，在權衡利弊後，也相繼派出代表，表示接受新朝招撫，願為帝國效力。
帝國對此也展現了極大的包容。隻要誠心歸附，並無劣跡，大多準許留任原職或調任他職，前提是必須嚴格執行新政，推行帝國律法。這種“和平過渡”極大地減少了社會動蕩，保證了政權交接的平穩，使得帝國能夠以最小的代價，迅速將前清的大部分版圖納入有效統治之下。
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然而，並非所有勢力都甘心臣服。在西北、西南等一些偏遠地區，仍有部分受清廷恩惠較深、思想頑固的將領或少數民族土司，企圖憑借地形負隅頑抗。亦有大量潰散的清軍散兵遊勇，淪為土匪，禍害地方。
對此，帝國軍的回應是冷酷無情的鐵拳。
在陝甘交界處，一支由前清甘軍殘部組成的武裝，擁兵數千，占據險要山寨，拒不投降。大都督府下令調遣一個精銳步兵旅，配屬炮兵營，經過十天圍困和猛烈炮擊，最終強攻破寨，匪首被陣斬，餘眾或降或散。
在川滇邊地，幾個受清廷冊封的土司如涼山彝族茲莫、川西穆坪土司等聯合起來，阻斷驛道，襲擊帝國小股部隊。帝國並未急於強攻，而是采取分化策略，一方麵派能言善辯之士攜重金厚禮勸降搖擺者，另一方麵集中兵力，以絕對優勢痛擊最頑固者，焚其寨堡，另立親帝國的頭人。剿撫並用之下，西南邊陲漸趨平定。
針對遍地開花的土匪問題，帝國采取了駐軍清剿與地方團練相結合的方式。帝國軍主力負責打擊大股匪幫，新組建的地方保安團則負責清鄉靖匪，維護日常秩序。同時嚴格執行“首惡必辦，脅從不問”的政策，迅速瓦解了匪患的根基。
對於更為遙遠的西藏、蒙古、新疆等地，帝國的控製則更多地停留在象征層麵。
拉薩的噶廈政府、庫倫的哲布尊丹巴呼圖克圖、迪化的新疆巡撫饒應祺，在得知北京陷落、清帝西逃後，也紛紛派出了“朝貢”使團，攜帶地方特產和表示恭順的表文，前往北京或新京，覲見帝國欽差大臣或通過電文向皇帝表示臣服。
他們承認中華帝國為新的宗主，延續了與中原王朝的傳統關係。然而，柏淩雲和帝國高層都清醒地認識到，這種基於傳統羈縻政策的臣服是脆弱且不穩固的。這些地區地域廣闊，民族複雜，交通不便，且沙俄、英國等列強的勢力早已滲透其中，欲壑難填。
帝國目前的主要精力在於消化內地十八省，暫時無力也無意立即向這些邊疆地區投入大量行政和軍事資源進行直接、深入的治理。因此，當前策略是先行接納其象征性臣服，維持現狀，加緊溝通與情報收集，待中原徹底穩固、國力更加強盛之後，再徐圖切實有效的整合與控製。
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