崇禎五年十月至六年春（1633-1634年）
接過崇禎皇帝賜予的尚方寶劍與總督川、湖、雲、貴軍務的重任，秦良玉沒有絲毫遲疑。
她深知，皇帝要的不是擊潰，而是根除；不是招撫，而是重塑。
她的戰略，摒棄了一切懷柔與妥協，隻剩下鋼鐵般的意誌與精準如外科手術般的打擊：兵分三路，以“犁庭掃穴”之勢，徹底清除所有抵抗力量和組織，為接下來的“改土歸流”鋪平道路。
中路：直搗水西（主力——秦良玉親率）
目標：安邦彥的老巢，水西宣慰司腹地（今貴州大方、畢節一帶），徹底鏟除叛亂核心。
兵力：白杆軍主力兩萬，配屬李由所部魯軍精銳五千（攜帶重型攻城炮），輔以熟悉地形的投降土司向導。
叛軍預料秦良玉會從防守相對薄弱的東麵進攻。
然而，秦良玉卻選擇了一條險路——強渡烏江天險。
在投降土司的指引下，白杆軍利用其擅長的山地行軍與架設索橋的能力，夜間潛渡，一舉突破烏江防線，如同神兵天降，出現在水西腹地。
麵對叛軍憑借險要地勢修建的層層寨堡，秦良玉一改以往強攻傷亡大的戰法。
大軍所至，先是派出使者勸降，申明“隻誅首惡，脅從不問”。
若遇抵抗，則輕型野戰炮前出，對寨門、箭樓進行精準轟擊；若寨堡堅固，則調集魯軍攜帶的重型攻城炮，直至將寨牆轟塌。
寨破之後，負隅頑抗的土目、頭人及其核心黨羽，一律就地處決，梟首示眾。
其家產抄沒，充作軍餉。對於安邦彥的直係親屬和鐵杆追隨者，則嚴密搜捕，一個不漏，全部擒拿，以囚車裝載，派重兵押解進京，由朝廷明正典刑，以儆效尤。
主力大軍過後，秦良玉派出無數支由白杆軍小隊和投降向導組成的“清鄉隊”，像梳子一樣對水西的深山老林進行反複梳理。
所有隱匿的山洞、廢棄的村寨、可疑的路徑都被徹底搜查，殘存的叛軍散兵遊勇要麼被殲滅，要麼被迫出山投降。
至崇禎六年春，水西地區所有成建製的抵抗被徹底粉碎。
安邦彥經營多年的勢力被連根拔起，其家族勢力幾近滅絕。
水西，這片曾經獨立王國般的土地，被徹底“犁”了一遍，為後續設立流官掃清了所有障礙。
北路：掃蕩永寧（馬祥麟部）
目標：奢崇明父子的根據地，永寧宣撫司（今四川敘永、古藺一帶），徹底消滅奢氏殘餘。
兵力：秦良玉之子馬祥麟率領白杆軍偏師一萬，彙合部分川軍。
摧枯拉朽，擊潰主力：此時，奢崇明因傷重已死，其子奢寅早被暗衛刺殺，奢部群龍無首，軍心渙散。
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馬祥麟大軍壓境，在瀘州外圍與奢部最後的主力遭遇。
白杆軍燧發槍輪番齊射，叛軍簡陋的裝備和低落的士氣無法抵擋，瞬間崩潰。
馬祥麟乘勝追擊，攻占永寧宣撫司治所。
將象征土司權力的官印、法典、族譜等物當眾焚毀，宣布永久廢除永寧宣撫司。
分兵剿滅各地負隅頑抗的小股叛軍，安撫百姓，恢複秩序。
北路進軍最為迅速，奢氏勢力被徹底蕩平。
永寧地區成為最早完成軍事清算的區域，為後續設立流官縣治奠定了基礎。
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