兩個方麵的內容，從正麵來說，諸葛亮治軍以明表現為：一、提出明確的道德要求。如《將苑·謹候》一文就集中表述了這方麵的內容。諸葛亮認為師出以律，失律則凶，律有十五，其中明白地指出要“勇”“廉”“平”“忍”“寬”“信”“敬”“明”“仁”“忠”等有關道德方麵的要求。《將苑·將材》一文中要求將帥要具備“仁”“義”“禮”“智”“信”的才能。《便宜十六策·陰察第十六》一文中說陰察之政要有五德：“禁暴止兵”“賞賢罰罪”“安仁和眾”“保大定功”“豐撓拒讒”。二、規定嚴格的法令規定。如諸葛亮親著的《法檢》兩卷、《軍令》兩卷（現存僅為《軍令》十五條），製定的《八務》《七戒》《六恐》《五懼》等條規。《便宜十六策·斬斷第十四》一文對不聽從教令的“輕”“慢”“盜”“欺”“背”“亂”“誤”七種情形的嚴肅處理。
其次，以信為本。諸葛亮治軍重信。諸葛亮認為，“信，重然諾也”，也就是說，“信”就是要做到言必行、行必果，言出必行。不誠者失信，如果不知道守信用，那麼作戰一定會失敗；如果有法令而不能夠執行，那麼即使有百萬之眾，也是毫無用處。反之，如果用信義來鼓勵將士，將士沒有不拚命效力的。因此，諸葛亮強調治軍要以信為本，“夫統武行師，以大信為本。”以信為本，就賞罰而言，諸葛亮認為要“賞罰有信”，因為用賞罰來判定功過，士卒就會知道守信用；就將帥而言，諸葛亮認為所謂信將，即“進有厚賞，退有嚴刑，賞不逾時，刑不擇貴”。
用兵南中
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蜀國大臣朱褒、雍闓、高定等叛變，南中豪強孟獲參與其中。在北有曹魏大兵壓境、東有孫權荊州軍威脅，南有三郡叛亂的困難形勢下，諸葛亮采取了“北抗曹魏、東和孫權”的戰略，在建興元年（公元223年）十月派鄧芝到東吳進行修好，並取得了外交上的成功。接著，在建興二年（公元224年）積極進行兵力補充、整訓等戰役準備工作。這樣，在建興三年（公元225年）初，已經具備了南下平叛作戰的條件，於是，諸葛亮在成都開始組織這次南征戰役。
建興三年（公元225年）五月，諸葛亮大軍渡過瀘水，進入益州郡。在克服了氣候、地形、運輸等困難後，在味縣（今雲南曲靖）以北地區追上了孟獲的部隊，經過激戰，擊敗了孟獲的部隊，生擒孟獲。接著，諸葛亮大軍南下到達味縣地區與李恢的部隊會師。隨後，大軍向西挺進，進兵滇池（今雲南晉寧東），並分兵平定了四周的部族。
建興三年（公元225年）秋。整個戰役勝利結束。
【《漢晉春秋》：亮至南中，所在戰捷。聞孟獲者，為夷、漢所服，募生致之。既得，使觀於營陳之間，問曰：“此軍何如？”獲對曰：“向者不知虛實，故敗。今蒙賜觀看營陳，若隻如此，即定易勝耳。”亮笑，縱使更戰，七縱七禽，而亮猶遣獲。獲止不去，曰：“公，天威也，南人不複反矣。”遂至滇池。南中平，皆即其渠率而用之。或以諫亮，亮曰：“若留外人，則當留兵，兵留則無所食，一不易也；加夷新傷破，父兄死喪，留外人而無兵者，必成禍患，二不易也；又夷累有廢殺之罪，自嫌釁重，若留外人，終不相信，三不易也；今吾欲使不留兵，不運糧，而綱紀粗定，夷、漢粗安故耳。”《三國誌·卷三十五·蜀誌·諸葛亮傳》：三年春，亮率眾南征，秋悉平。軍資所出，國以富饒，乃治戎講武，以俟大舉。】
北伐曹魏
諸葛亮為了匡扶漢室，統一中原，從建興六年（公元228年）春至建興十二年（公元234年）冬先後兵出漢中，對曹魏發動的五次戰爭。
建興六年（公元228年）春，諸葛亮第一次北伐，諸葛亮設疑兵於斜穀，自己率大軍攻祁山。張合大破馬謖於街亭，諸葛亮返回漢中。
【《三國誌·卷三十五·蜀誌·諸葛亮傳》：六年春，揚聲由斜穀道取郿，使趙雲、鄧芝為疑軍，據箕穀，魏大將軍曹真舉眾拒之。亮身率諸軍攻祁山，戎陳整齊，賞罰肅而號令明，南安、天水、安定三郡叛魏應亮，關中響震。魏明帝西鎮長安，命張合拒亮，亮使馬謖督諸軍在前，與合戰於街亭。謖違亮節度，舉動失宜，大為合所破。亮拔西縣千餘家，還於漢中，戮謖以謝眾。】
>P/<。軍退儘糧軍蜀，天多十二打攻，倉陳圍包，關散出。伐北次二第亮葛諸，冬）年822元公（年六興建
>P/<】。中漢還，雙斬，之破，戰與亮，亮追軍率雙王將魏。退儘糧，倉陳圍，關散出複，冬。克不，山祁攻出亮，春年六：》傳主後·誌蜀·三十三卷·誌國三《。中漢還，雙斬，之破，戰與亮，亮追軍率雙王將魏。退儘糧，倉陳圍，關散出複，冬）年六興建（：》誌國三《【
>P/<。郡二到得功成漢蜀，退撤淮郭，威建至軍率自親亮葛諸，救援兵帶淮郭將魏。平陰、都武占攻式陳遣派亮葛諸，伐北次三第亮葛諸，）年922元公（年七興建
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>P/<。殺射軍蜀被，門木至軍蜀擊追合張。軍退儘糧軍蜀，繼不糧運嚴李。救援兵帶合張和懿馬司，山祁圍包軍蜀，伐北次四第亮葛諸，）年132元公（年九興建
】。合殺射，戰交合張將魏與，軍退儘糧，運牛木以，山祁出複亮，年九：》傳亮葛諸·誌蜀·五十三卷·誌國三《【
