纏於對孔胤植個人是殺是留的具體爭論，而是高屋建瓴，將重點放在了“製度長效建設”的第三步上。他在奏章中深刻指出：
“陛下，孔府之案，其罪在孔胤植，其弊在製度。觀其所以能橫行地方、積弊如山者，非獨一府之膽大妄為，實乃朝廷監管缺失、權責不清、法度於特權麵前往往失之於寬、失之於軟所致。今賴陛下聖斷，清吏司奮力，其利益鏈條已初步斬斷，山東吏治整飭已開其端，此誠可喜。然，若不能借此契機，速定章程，明立規矩，堵塞漏洞，則今日之孔府雖倒，明日難免有張府、李府依樣萌生。故，當務之急，在於固本清源。”
他再次強調：“臣前奏所請，速擬定《宗室行為約束則例》與《地方望族監管章程》一事，於此時而言，其意義遠超懲處一孔府。此章程猶如為蒸汽機設定壓力閥與巡檢規程，將為天下所有宗室、勳貴、聖裔等特權階層，明確劃定行為紅線，使其知所趨避；亦將使後續監管有法可依，有章可循，使清吏司及地方有司執法有所秉持，避免憑個人好惡或一時風向行事。望陛下敕令宗人府、禮部、戶部與清吏司，摒棄門戶之見，廣泛評議，博采眾議，求其公允切實，儘快頒行天下。如此，則孔府一案之代價，方能轉化為我大明革除積弊、奠定長治久安之基石。”
讓您第一時間享受最新章節，請訪問𝗼𝗼𝗽.𝘁𝘄
沈驚鴻此舉，意在將朝野的注意力從對孔府個人的窮追猛打，引導到更具普遍性、根本性和長遠性的製度建設上來。這既符合他一貫的“格物致用”、“係統思維”的執政理念，也巧妙地避免了在孔府具體處置問題上陷入無休止的意氣之爭和倫理困境，為更深層次的改革爭取了更寶貴的時間和最廣泛的支持。
朱由校覽奏，深以為然。他再次下旨，嚴厲催促宗人府、禮部、戶部與清吏司放下成見，通力合作，加快兩大章程的擬定工作，並明確要求，必須將此次孔府一案中暴露出的各類問題，如田產兼並、乾預司法、商業特權、依附人口管理等，作為製定細則時重點考量和完善的內容。
。中定製和論討的則規新了到入投力精將，心安稍稍也員官的延蔓境止無”暴風“心擔本原多許得使這。了則規新、序秩新的治吏清澄、權特束約久長夠能套一立建要更，”案個“個這府孔理處要僅不，心決定下是次此廷朝，到識意們人。移轉始開便點焦論爭的上堂朝，確明此如度態的帝皇
。受接和解理所士之識有多更被漸逐，出推的施措續後和入深步步的件案著隨也，念理的”治施統係“、”腐防度製“、”國治法依“的導倡所鴻驚沈而，值價的”器利垢刮“為作其了明證，中暴風的有未所前場這在司吏清。石金試和劑化催要重個一的理治度製向邁、新革我自求尋中境困在朝王明大為成然已它，件案腐貪的野朝動轟個一是僅僅再不，華升然悄已此至，案府公聖衍
。了多不的真許或，間時的新革我自明大給留，脅威的間水黑山白自來個那而。脅威的命致部外對應地力有更能國帝的老古個這讓了為是，新革與頓整的部內，知深他。地土的藏暗機殺、漫彌雪風片那外關海山了向投，力精的多更將經已，時同的革變度製場這內關注關切密在，鴻驚沈的寧廣在，刻此而。進推前向地定堅中體肢和臟心的國帝在，聲鼓戰的來傳約隱東遼著隨伴正，塑重的式模理治家國的遠深響影定注卻、的悄悄靜場一，明指經已向航，破打經已冰堅，何如論無但。題難的決解待亟是都，係關雜複的間之”統道“與”權法“、”權皇“衡平何如及以，應適不和力阻的到遇會然必中行推度製新、彈反的力勢舊，棘荊滿布然依路道的來未，白明都人有所管儘
