……上億個候選分子,如同過江之鯽,被投入到AKT1的虛擬“鎖孔”中。盤古模型的子程序,以每秒數百萬次的速度,冷酷地計算著每一個分子的“契合度”。
“形狀不對,滾!”
“電荷排斥,滾!”
“尺寸太大,滾!”
99.99%的分子,在這一關就被無情地刷掉。這場殘酷的海選,隻持續了不到二十分鐘。最終,隻剩下十萬名“幸運兒”進入了下一輪。
這十萬個分子,被投入到一個模擬真實細胞環境的“量子洗衣機”中。在這裡,有水分子的劇烈碰撞,有離子濃度的不斷波動,有無時無刻不在發生的熱振動。
“結合不穩,一個水分子撞過來就散架了?廢物!”
“構象僵硬,不懂得靈活調整姿勢?蠢貨!”
“誘導契合能力太差?滾蛋!”
每一個分子,都在這個虛擬的“細胞風暴”中被折磨了相當於現實世界中幾十納秒的時間。這短短的幾十納秒,對它們而言卻是一場漫長的生死考驗。
又是一輪慘烈的淘汰。最終,當一切塵埃落定,屏幕上隻剩下了三個閃耀著金色光芒的分子結構。
它們是經曆了億萬次廝殺,從屍山血海中爬出來的最終勝利者,是這場虛擬戰爭的“冠軍”、“亞軍”和“季軍”。
陳啟明看著這三個完美的分子,滿意地點了點頭。
“很好,劇本寫好了,演員也選定了。”
但光有這些還不夠。一份來自未來的“答卷”,不能隻給出問題和答案,它必須包含從理論到實踐的、讓魔鬼都挑不出任何瑕疵的完整“說明書”。
他深吸一口氣,雙手重新放回鍵盤。接下來的工作,是將這場虛擬世界的輝煌勝利,轉化為現實世界中切實可行的操作指南。
他開始瘋狂碼字。
文檔的標題,他取得極其囂張——
《盤古之心:基於生成式AI的從頭設計(DeNovoDesign)高特異性AKT1激酶抑製劑——從理論、預測到濕實驗驗證的全流程方案》
他首先用最精煉的語言,闡述了“盤古”模型的核心架構與顛覆性的設計哲學。
緊接著,他將那三個“冠軍分子”的詳細合成路線,一步步地羅列出來。每一步反應的原料、試劑、溫度、壓力、催化劑、純化方法……詳儘到仿佛是他親手在實驗室裡做過千百遍。
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然後,是最駭人聽聞的部分——“實驗結果預測”。
他直接調用“盤古”的預測模塊,將這三個分子在未來實驗中可能得到的所有關鍵數據,精確地計算了出來,並一一列出:
“候選分子Pangu-01:”
“生物物理性質:預計質譜分子量為XXX.XXXDa,與理論值完全一致。質量光度法(MP)檢測顯示,其在PBS緩衝液中99.8%以單體形式存在,無明顯聚集,性質優良。”
“功能活性:體外酶活實驗預測IC50值為0.52nM(納摩爾每升)。在A549肺癌細胞係中,有效抑製細胞增殖的EC50值為3.14nM。”
“特異性與毒性:對激酶家族其他成員(如AKT2,AKT3)的選擇性超過1000倍。在正常人肺上皮細胞係中,半數致死濃度(LD50)大於100μM(微摩爾每升),顯示出極高的安全性窗口。”
……
每一項數據,都精確到了小數點後兩位。這已經不是一份科研計劃書了,這是一份來自未來的“標準答案”,一份直接把期末考試的正確答案連同解題步驟一起拍在審稿人臉上的“天書”!
最後,作為點睛之筆,他用一個章節,提出了一個名為“設計-構建-測試-學習(DBTL)”的快速迭代閉環理念。
“本次提交的,僅僅是‘盤古’的第一次啼哭。”
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