發，將節點徹底摧毀。綠芽則用生命能量包裹住第三個節點，阻止其吸收能量，為林越爭取時間。
就在林越準備摧毀第三個節點時，祭壇頂部的黑色晶體突然裂開，一道暗紫色的能量柱從晶體中射出，直衝天空。能量柱穿過暗灰色的能量霧，在天空中形成一個巨大的能量漩渦，無數的暗蝕孢子從漩渦中飄落，落在暗蝕族守衛的身上，守衛們的身體開始發生變異，體型變得更加龐大，體表的吸收甲殼也更加堅硬。
“是暗蝕之主的能量分身！他在通過晶體吸收邊緣荒漠的能量！”洛溪的聲音帶著驚恐，她的光翼能量與能量漩渦產生了強烈的共鳴，“必須摧毀黑色晶體，否則他的分身會越來越強！”
“鐵毅，帶領學員牽製變異守衛；石烈，用赤陽礦能量乾擾能量漩渦；洛溪，用光翼能量引導我的秦魂能量，直擊黑色晶體！”林越的指令迅速傳遍小隊。鐵毅的機甲與秦鋒學員組成防禦圈，擋住了變異守衛的攻擊；石烈將大量的赤陽礦晶體拋向能量漩渦，暗紅色的礦能在漩渦中爆炸，乾擾了漩渦的能量流動；洛溪的光翼能量與林越的秦魂能量融合，形成一道金色與七彩交織的能量光束，直奔黑色晶體而去。
能量光束擊中黑色晶體的瞬間，晶體發出一聲刺耳的碎裂聲，暗紫色的能量柱瞬間消散，能量漩渦也逐漸平息。變異守衛失去了能量支持，身體逐漸恢複原狀，最終倒在沙漠中。林越走上祭壇，將鎮邪劍插入黑色晶體的核心，金色的能量徹底淨化了晶體中的暗能量。“暗影祭壇已被摧毀，暗蝕之主的蘇醒計劃暫時被阻止。”林越通過通訊頻道向聯盟議會彙報。
就在眾人以為危機解除時，寒鴉的緊急探測報告傳來：“林院長，維度之樹根部傳來緊急信號，蒙恬的艦隊遭遇了暗蝕族的主力部隊，他們的首領是暗蝕之主的另一個能量分身，擁有吸收維度之樹能量的能力！”
林越立即帶領先鋒小隊返回開拓者三號，艦隊全速向維度之樹根部駛去。途中，林越召集小隊成員開會，將暗蝕族的計劃文檔投影在屏幕上：“暗蝕族的真正目的，是通過汙染維度之樹的核心能量，控製整個維度網絡的能量流動，從而實現他們的‘淨化計劃’。之前的暗影祭壇和能量轉換裝置，都是為了給暗蝕之主的分身提供能量。”
“維度之樹的核心能量一旦被汙染，我們所有文明的能量係統都會癱瘓，機甲、戰艦、甚至文明驛站都會失去動力。”石烈的麵色凝重，他想起了赤岩族因虛空掠奪者而遭受的損失。洛溪則握緊了手中的光翼水晶：“光翼族的古籍記載，維度之樹的核心能量中，蘊含著星盟的守護能量，隻要能激活這種能量，就能徹底淨化暗蝕之主的分身。”
“激活守護能量需要什麼條件？”林越問道。洛溪回答道：“需要星盟遺民的能量信物，以及維度守護者的本源能量。我們光翼族的星盟信物，加上院長的本源印記，應該就能激活。”
當開拓者三號抵達維度之樹根部時，眼前的景象讓所有人震撼：一棵巨大的能量之樹矗立在空間中央，樹乾上布滿了璀璨的能量紋路，連接著維度網絡的各個區域；能量之樹的根部，蒙恬的秦鋒艦隊正在與暗蝕族的主力部隊激戰，暗紫色的能量與金色的秦魂能量交織在一起，形成一道巨大的能量屏障；暗蝕之主的分身懸浮在能量之樹的正下方，他的身體與能量之樹的根部相連，正在不斷吸收著核心能量，樹乾上的能量紋路已經開始出現暗紫色的侵蝕痕跡。
“林隊，你們終於來了！”蒙恬的聲音帶著疲憊，“暗蝕之主的分身能吸收秦魂能量，我們的攻擊對他無效！”
“蒙恬，率艦隊牽製住暗蝕族的主力，我帶先鋒小隊潛入能量之樹根部，激活守護能量！”林越下令道，隨後駕駛機甲衝出戰艦，先鋒小隊的機甲緊隨其後，在秦鋒艦隊的掩護下，向著能量之樹的根部飛去。
暗蝕之主的分身察覺到了他們的意圖，立即釋放出大量的暗蝕孢子，形成一道暗紫色的能量牆，擋住了他們的去路。“渺小的守護者，竟敢乾擾我的淨化計劃！”分身的聲音如洪鐘般響起，暗紫色的能量手抓向林越的機甲。
“秦魂·光翼歸宗！”林越將本源能量與光翼能量融合，鎮邪劍的劍氣劈開能量牆，帶領小隊衝了過去。鐵毅和石烈負責牽製分身的能量手，洛溪則將光翼族的星盟信物放在能量之樹的根部，林越將額頭的本源印記貼在信物上，金色的本源能量與七彩的光翼能量同時注入信物，信物瞬間爆發出耀眼的光芒，沿著能量之樹的紋路蔓延開來。
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