謙天皇在宮廷鬥爭中失勢，被迫傳位給淳仁天皇。相應的，鑒真也遭受到排擠。758年，淳仁天皇下旨，以"政事煩躁，不敢勞老"為名，解除了鑒真“大僧都”一職，並將在宮廷鬥爭中敗死的原皇太子道祖王的官邸賜給鑒真。次年，鑒真弟子在該官邸草成一寺，淳仁賜名“唐招提寺”，鑒真從東大寺遷居至此。淳仁還下旨，令日本僧人在受戒之前必須前往唐招提寺學習，使得唐招提寺成為當時日本佛教徒的最高學府。
由於鑒真對世俗權勢並不在意，所以也沒有因“大僧都”一職被解除而失落，反而因為可以規範日本的受戒製度和將佛法在日本發揚光大而興奮，所以一直乾勁十足。
在日本多年的世俗經曆雖然沒有提升鑒真的修為，但是卻練就了他一雙看透世情、洞察人心的慧眼，不必像從前一樣，每次都要靠“他心通”來探知別人的內心活動了。這使他對佛法精要的領悟更近一成，領悟了“色即是空、空即是色，色不異空、空不異色”的道理，道行和境界又有所提升。
佛法本來就是講究“看透一切、看破一切、超脫一切”，鑒真這才明白了雲滄海在去創建陰陽教之前叮囑他“用心去看、用心去想，不要動輒施展法力，紅塵之中自有頓悟之機。”的話，隨後用心感悟紅塵之道，鑽研佛學，改革日本佛門製度，是日本的佛門秩序空前穩定、規範‘
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鑒真又通過普及知識，建立貧田院周濟平民等方式擴大佛教影響，並創立了日本佛教南六宗之一的律宗，繼續自己弘揚佛法的事業。唐招提寺很快因此成為日本佛教聖地。由於佛教在日本影響很大，所以又反過來影響了社會各階層，使社會製度為之一清，而且由於雲滄海創立的陰陽教發展壯大，掃清了不少盤踞地方的妖魔，為農民和地主、貴族騰出了大片的可耕作土地。
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