終極決戰結束後，葉宸帶領聯軍展開全麵的戰後清剿。多元宇宙海的各個角落，都殘留著混沌大軍的殘餘勢力，包括隱藏在各個宇宙群的混沌潛伏者、未被徹底摧毀的混沌據點，以及散落的混沌能量源。
葉宸將聯軍分成百支清剿小隊，由尊主級強者帶隊，前往各個宇宙群執行清剿任務。淩軒帶領一支小隊，前往星雲宇宙群，清剿隱藏在那裡的混沌潛伏者：“至尊戰?潛伏清剿！”至尊戰體爆發，金色能量穿透混沌潛伏者的隱匿能量，潛伏者被瞬間斬殺。
星瑤則帶領一支小隊，前往龍界宇宙群，淨化散落的混沌能量源：“至尊火?能量淨化！”彩色火海燃燒，黑色混沌能量被快速淨化，轉化為精純的多元本源能量，滋養著龍界的土地。
葉宸則親自帶領核心小隊，前往寂滅混沌在多元宇宙海的最後一個據點——混沌裂隙。這裡是寂滅混沌能量湧入多元宇宙海的通道，殘留著大量的混沌能量和混沌傀儡，由一頭戰力的混沌裂隙守護獸守護。
“多元至尊?裂隙破！”葉宸的金黑色能量劈出，混沌裂隙的入口被瞬間打開。守護獸咆哮著衝來，黑色混沌能量形成一道巨大的利爪：“混沌?裂隙爪！”
“多元至尊?守護獸斬！”葉宸一劍劈出，金色劍氣穿透守護獸的核心，守護獸轟然倒地，被徹底淨化：“-！暴擊！裂隙絕殺觸發！”
進入混沌裂隙，葉宸發現裡麵隱藏著一座混沌能量核心，正是維持裂隙穩定的關鍵。他抬手打出金黑色能量，將能量核心徹底摧毀，混沌裂隙開始緩慢閉合，再也無法湧入寂滅混沌能量。
清剿任務持續了一個月，多元宇宙海的所有混沌殘餘勢力被徹底清除，黑色混沌能量被全麵淨化，各個宇宙群恢複了和平與繁榮。葉宸帶領聯軍返回多元宇宙和平城，召開了盛大的慶功大會。
大會上，葉宸對作戰有功的勢力和將士進行了重賞：
1、龍界、鳳界、星雲等宇宙群，獲得進入多元宇宙核心修煉場的永久權限，共享寂滅混沌珠的能量；
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