采集諸家本草藥品總數
《神農本草經》三百四十七種，並入一十八種：
玉泉（並入玉石部）、丹砂（並入金石部）、空青（並入金石部）、曾青（並入金石部）、白青（並入金石部）、扁青（並入金石部）、石膽（並入金石部）、雲母（並入金石部）、樸硝（並入金石部）、硝石（並入金石部）、礬石（並入金石部）、滑石（並入金石部）、紫石英（並入金石部）、白石英（並入金石部）、五色石脂（並入土部）、太一禹餘糧（並入土部）、禹餘糧（並入土部）
青芝、赤芝、黃芝、白芝、黑芝、紫芝（六芝合並為“芝”類，計入木部）
草部一百六十四種:
菖蒲、菊花、人參、天門冬、甘草、乾地黃、術（白術）、菟絲子、牛膝、茺蔚子（益母草）、女萎（玉竹）、防葵、柴胡、麥門冬、獨活、車前子、木香、薯蕷（山藥）、薏苡仁、澤瀉、遠誌、龍膽、細辛、石斛、巴戟天、白英、白蒿、赤箭（天麻）、庵?子、菥蓂子、蓍實、赤芝、黑芝、青芝、白芝、黃芝、紫芝、卷柏、藍實、芎?（川芎）、黃連、絡石、蒺藜子、黃芪、肉蓯蓉、防風、蒲黃、香蒲、續斷、漏蘆、天名精、決明子、丹參、茜根（茜草）、飛廉、五味子、旋花、蘭草、蛇床子、地膚子、景天、茵陳蒿、杜若、沙參、徐長卿、石龍芻、雲實、王不留行、牡桂（肉桂）、菌桂、鬆脂、槐實、枸杞、柏實、茯苓、榆皮、酸棗、乾漆、蔓荊實、辛夷、杜仲、桑上寄生、女貞實、蕤核、藕實莖（蓮子）、大棗、葡萄、蓬蘽、雞頭實（芡實）、胡麻、麻黃、冬葵子、莧實、白瓜子、苦菜、龍骨、麝香、牛黃、熊脂、白膠（鹿角膠）、阿膠、丹雄雞、雁肪、石蜜、蜂子、蜜蠟、牡蠣、龜甲、桑螵蛸、海蛤、文蛤、蠡魚、鯉魚膽、烏賊魚骨、白僵蠶、蛇蛻、蜈蚣、蚯蚓、蠐螬、石蠶、雀甕、樗雞、斑蝥、螻蛄、馬陸、地膽、螢火、衣魚、鼠婦、水蛭、木虻、蜚虻、蜚蠊、?蟲、貝子、白堊、鉛丹、粉錫（鉛粉）、代赭、戎鹽、鹵堿、青琅玕、礜石、石灰、白石英、紫石英、五色石脂、太一餘糧、禹餘糧、空青、曾青、白青、扁青、石膽、雲母、樸硝、硝石、滑石、紫菀、槁本、狗脊、萆薢、白薇
升麻穀部七種：
胡麻（今稱芝麻）、麻蕡（大麻的果實）、飴糖（麥芽糖）、大豆黃卷（發芽的大豆）、赤小豆、黍米（黃米）、粟米（小米）
菜部一十三種：
冬葵子、莧實、瓜蒂（或作甜瓜蒂）、白瓜子（即冬瓜子）、苦瓠、水靳（即水芹）、蓼實、蔥實、薤（即藠頭）、韭、假蘇（即荊芥）、蘇（即紫蘇）、水蘇
果部一十一種：
橘柚（橘皮）、大棗、葡萄、蓬蘽（覆盆子類）、雞頭實（芡實）、藕實莖（蓮子與蓮藕）、杏核仁（杏仁）、桃核仁（桃仁）、梅實（烏梅）、木瓜、柿
木部四十四種：
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鬆脂（鬆香）、鬆實（鬆子）、柏實（柏子仁）、茯苓、榆皮（榆白皮）、酸棗（酸棗仁）、槐實（槐角）、枸杞（枸杞子）、蘇合香、橘柚（橘皮，亦列於果部）、蔓荊實（蔓荊子）、辛夷、杜仲、女貞實（女貞子）、桑上寄生（桑寄生）、蕤核（蕤仁）、五加皮、牡荊實（牡荊子）、木蘭（厚樸或辛夷類）、桑根白皮、竹葉、吳茱萸、梔子、蕪荑、枳實、厚樸、秦皮、秦椒（花椒）、山茱萸、紫葳（淩霄花）、豬苓、白棘（酸棗刺）、龍眼（桂圓）、合歡（合歡皮）、衛矛（鬼箭羽）、紫菀（部分版本歸草部）、白楊皮、鬱李仁、莽草（有毒，非食用）、雷丸（菌類，歸木部）、梓白皮、桐葉（泡桐類）、石南（石楠葉）、黃環（鉤吻類，有毒）
土部二種：
伏龍肝（灶心土）、白堊（白善土）
金石部四十一種：
丹砂、雲母、玉泉、石鐘乳、礬石、消石（硝石）、樸消（樸硝）、滑石、石膽（膽礬）、空青、曾青、禹餘糧、太一餘糧、白石英、紫石英、五色石脂（赤石脂、黃石脂、白石脂、黑石脂、青石脂）、雄黃、雌黃、石硫黃（硫黃）、水銀、石膏、磁石、凝水石（寒水石）、陽起石、理石、長石、鐵精、鐵落、鉛丹、粉錫（胡粉）、代赭（代赭石）、鹵鹹（鹵堿）、白堊、冬灰、青琅玕、礜石、石灰、伏龍肝（灶心土）、銅鏡鼻、金屑、銀屑
蟲部二十九種：
）蟲書（魚衣、）蟲火螢（火螢、）繭蛾刺（甕雀、）部介歸分部，類貝（子貝、蝥斑、蛭水、牛蝸、）蟲涕鼻（蝓蛞、）蟲鱉地（蟲?、）螂蟑（蠊蜚、）虻牛（虻蜚、）蟲虻（虻木、）蜴蜥（子龍石、）蟲幼子龜金（螬蠐、蚓蚯頸白、）蛻蟬（蟬蚱、）子娘紅（雞樗、蠶僵白、）蛸螵海（骨魚賊烏、膽魚鯉、）部鱗歸分部，魚鱧（魚蠡、）部蟲歸本版分部，部介屬原（蛤文、）部蟲歸本版分部，部介屬原（蛤海、）鞘卵螂螳（蛸螵桑、）部蟲歸本版分部，部介屬原（甲龜、）部蟲歸本版分部，部介屬原（蠣牡、）蠟蜂（蠟蜜、）蟲幼蜂蜜（子蜂、）蜜蜂（蜜石
：種八部介
）蛸螵海即（骨魚賊烏、）載記有亦部介但，部鱗歸本版分部（膽魚鯉、）魚鱧為說一，魚鯉即（魚蠡、蛤海、蛤文、蠣牡、甲鱉、）屋神名亦（甲龜
：種七部鱗
）”甲鯉鯪“稱古，片鱗甲山穿即（甲魚蛇、）”魚鱣“作或（魚鱔、魚白、）蛸螵海即（骨魚賊烏、膽魚鯉、齒龍、骨龍
：種五部禽
）部禽歸古，蝠蝙即（翼伏、）便糞的子燕（屎燕、）鴨野為說一，肪脂的鴨家（肪鶩、）肪脂的雁大（肪雁、）雞公色赤即（雞雄丹
：種五十一部獸
燕、）丸睾豬（卵豚、）器殖生外的馬（莖馬白、）皮蝟刺（皮蝟、）”砂明夜“即，便糞蝠蝙（翼伏、茸鹿、）腎狗（莖陰狗牡、角羊羚、）代替角牛水用多現，用禁已（角犀、）膠角鹿（膠白、）白熊（脂熊、香麝、）膠皮驢（膠阿、黃牛、骨龍
