《終末憲章》的公示餘波未平，另一道由帝君親筆簽署、加蓋了新製“帝君之璽”印鑒的諭令，便已通過剛剛投入試運行的、簡陋的“靈訊網絡”雛形，以及傳統的傳令兵，迅速傳遞至“新長安”的軍政院、研策院、內務監、外情司等核心機構，並張貼於各主要公告欄。
諭令的內容，是正式確立並明確皇朝的四大常設機構及其職權範圍。這被視為皇朝行政與軍事體係的“四柱”，其構建的清晰與否，直接關係到“終末皇朝”這台戰爭與生存機器能否高效運轉。
其一，軍政院。
“授周銘，軍政院院正，秩同三品，總領皇朝一應內政、民生、後勤、營造、外交諸事。凡戶籍、稅賦、徭役、工造、倉儲、貿易、律法初審、對外交涉、子民教化等，皆歸其統籌。軍政院下設：民政司（戶籍、稅收、教化）、工造司（營造、工程、官營工坊）、倉廩司（物資儲備、調配、運輸）、典客司（對外聯絡、接待、情報初步彙總）等。各司主官，由院正考核舉薦，帝君核準任命。”
“授大山，軍政院副院正，兼領軍機處主事，秩同從三品，主管皇朝軍事訓練、防禦、征伐、新兵招募、軍紀、及對外軍事行動。軍機處下設：作訓司（新兵訓練、老兵整編）、戍衛司（城防、要地守衛）、征伐司（對外作戰、清剿任務）、軍法司（軍紀監察、戰時審判）、軍械司（裝備維護、研發需求對接）等。軍機處直接對帝君負責，戰時擁有一切軍事指揮權，但重大軍事行動及將領任免，需報帝君核準。”
軍政院與軍機處，一文一武，構成皇朝統治的核心執行與暴力機關，兩者在周銘和大山的統領下，相互配合，又彼此製衡。
其二，研策院。
“授趙明、陳遠，並為研策院院正，秩同三品，共掌皇朝一切技術研發、知識整理、非常規現象研究、符文解析、裝備製造、能源開發等事。凡有利於皇朝生存、發展、強盛之技藝學問，無論其源自古籍、遺跡、異族、乃至‘非常’領域，皆可研究。研策院下設：符文工坊（基礎與應用符文研究、符文學徒培養）、亡靈研究所（僵屍、鬼魂等亡靈單位的控製、強化、安全應用研究）、能量核心實驗室（‘源力’、‘聖光轉化’及其他新型能源研究）、古籍整理館（搜集、修複、解讀一切技術文獻與神秘學資料）、奇物分析處（對不明物品、遺跡出土物進行鑒定與分析）等。研策院享最高等級資源優先權與保密權限，其研究成果，需經帝君與內務監共同評估後，方可決定應用範圍與級別。”
研策院被賦予了極高的地位和自由度，是皇朝技術突破和未來力量的源泉，同時也被納入了最嚴格的保密和監督體係。
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其三，內務監。
“授老貓，內務監監正，秩同三品，但獨立於軍政、研策體係之外，直接對帝君負責。掌皇朝內部監察、情報搜集與分析、反諜肅奸、治安維護、法典執行監督、特殊要犯關押與審訊等事。內務監下設：風聞司（情報網絡構建、信息收集、監聽監控）、鐵律司（內部執法、違憲案件初步偵查、配合裁決所執行判決）、黑獄（關押、審訊重犯要犯，獨立於普通牢獄之外）、帝君近衛處（負責帝君、核心機構及要員的安全警衛）。內務監享有獨立偵查、緝捕、審訊（需報備）之權，可監察除帝君外一切人員與機構，其行動可先於其他院司。凡涉及‘吞靈之主’等邪教、叛國、泄露核心機密等重案，內務監有優先處置權。”
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