接下來的一個月，盧方舟以雷霆手段，徹底整頓朝鮮局勢，清除隱患，鞏固統治，一步步將朝鮮納入大明的行省化管理軌道。
第一步，清洗親清勢力。
盧方舟下令，對原先積極附庸滿清、主動投靠黃台吉、參與助清攻明的朝鮮貴族、各級官員，進行嚴厲清算，絕不姑息。
首惡者，公開處決，抄沒家產，以儆效尤。
罪行較輕者，與鬆錦之戰中俘虜的滿蒙漢奸一同，發配至遼東或內地的礦場、道路，服苦役，終生不得赦免。
對那些雖未直接助清，但態度曖昧、不肯誠心歸附大明者，一律剝奪官職，貶為庶民，遷往偏遠地區安置。
第二步，遷移與同化。
為了加速朝鮮與中原的融合，盧方舟下令，挑選一批經過嚴格甄別、確係心向大明，或立場中立、品行端正的朝鮮中層士人、技術工匠及其家眷，遷往山東、北直隸等地安置，給予田宅、農具，鼓勵他們與中原百姓通婚、融合，學習中原文化與習俗。
同時，從山東、北直隸等地，招募大量貧苦漢民，遷往朝鮮北部的空地，實行屯墾，建立漢民村鎮，逐步改變朝鮮的人口結構，讓漢民成為朝鮮的主體族群，從根源上鞏固大明的統治。
第三步，文化與禮俗改革。
盧方舟下令，朝鮮全境，官方文書、科舉考試，一律使用漢字、漢語，禁止使用朝鮮本土文字。
鼓勵朝鮮百姓學習中原文化，興辦官學，教授儒家經典、大明律令，選拔優秀學子，送往中原深造，培養心向大明的人才。
同時，逐步改革朝鮮的服飾、禮俗，禁止朝鮮貴族穿戴本土服飾，推行中原服飾，倡導中原禮儀，鼓勵朝鮮百姓與漢民通婚，加速民族融合，讓朝鮮徹底融入華夏文化圈。
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盧方舟的目標極為明確，不再滿足於將朝鮮作為大明的藩屬國，而是要將其徹底納入大明的行省化管理軌道。
計劃經過百年的努力，使其在文化、血統、禮俗上，與中原內地無顯著差異，成為大明不可分割的一部分，成為大明穩固的東陲屏障。
整頓期間，盧方舟除了留下侯利斌麾下舊部，負責朝鮮境內的防務與清剿之外，還留下了自己麾下的一部精銳，駐守漢城、平壤等戰略要地，與侯利斌部相互製衡、協同作戰，確保朝鮮局勢穩定，不出現任何變數。
同時，下令陳永泰的水師，在仁川、釜山等地，建立永久性水師基地，駐紮一部分水師，控扼朝鮮周邊海道，防範海外勢力入侵，同時為日後東渡倭國，做好鋪墊。
……
八月底，朝鮮大局初定，防務穩固，民政有序，百姓安居樂業，漢化改革也逐步推進，一切都朝著盧方舟預期的方向發展。
盧方舟在侯利斌及李定國、曹變蛟等一眾將領的陪同下，來到朝鮮東南部的釜山浦。
站在海岸邊，眼前是浩瀚無垠的東海，碧波萬頃，海天相接，遠處的海霧之中，隱約可見對馬島的輪廓，更遠處，便是倭國的本土。
海風獵獵，吹動著盧方舟的衣袂，他抬手指向東方，對身邊的眾人說道：
“朝鮮已定，自此，這裡便是我華夏東陲的堅固屏障，再也不會成為外敵入侵華夏的跳板。然東邊海上，仍有大患未除，不可掉以輕心。”
侯利斌等人順著他手指的方向望去，眼中滿是疑惑，侯利斌上前一步，躬身問道：
“公爺所言，莫非是指倭國？萬曆年間，我大明大軍出征朝鮮，大敗倭國，已然將其打殘，這些年來，倭國一直安分守己，未曾敢再越雷池一步，似乎算不上什麼大患吧？”
盧方舟緩緩搖了搖頭道：
“倭人，秉性狡詐凶殘，貪婪無度，素來畏威而不懷德，慕強而淩弱。
萬曆援朝之役，不過是傷其皮毛，未能動搖其根本，其國內的擴張之心，從未熄滅。
此等族群，猶如餓狼在側，縱一時蟄伏，收斂鋒芒，一旦找到可乘之機，必定會再次露出獠牙，入侵華夏，劫掠百姓。
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