子根本理念的理解，也是他整合工作的總綱。
在“診法精微篇”，他不僅詳述了望聞問切的具體技巧，更專設一節“望氣觸機淺說”，嘗試用儘可能清晰的語言描述那種難以言傳的感知：“望氣者，非獨觀麵色。當靜心凝神，於患者不覺時，觀其整體神光之明晦、氣機之聚散。如草木之有榮枯，燈火之有明暗。觸機者，指下尋氣，不獨察脈象至數形體，更感其流動之滑澀、力道之剛柔、寒熱之微差，如探水之流、撫玉之溫。”他結合了自己為王母診病時的具體感受為例，力求將玄妙的感覺落實到可被理解和練習的“注意力指向”與“手感訓練”上。
“草藥氣化篇”是他著力最多的部分之一。他試圖打破單純按功效分類的慣例，而是以“氣化作用”為線索重新組織。例如，在“升發清陽”類下，他不僅列舉了柴胡、升麻等經典升提藥，還加入了師父常用的、氣味清輕的鮮薄荷、嫩蘇葉，並解釋：“此類藥物質輕氣揚，其性如春木生發，能引人體清陽上升，通達頭麵官竅，疏解鬱遏之氣。非獨治頭暈目眩，凡情誌抑鬱、頭麵諸竅不利屬清陽不升者，皆可參酌。”他將每味藥的性味歸經、現代常用功效與這種“氣化”層麵的理解相結合，並附上簡單的配伍舉例和注意事項。
“經絡導引與特種手法篇”，則幾乎完全基於師父微晶子的親傳。他詳細記錄了各種導引吐納的基本姿勢、呼吸節奏、意念引導，強調其“導正氣、通瘀滯、和陰陽”的作用，並指出這與單純體育鍛煉的區別在於“神與氣合，意到氣到”。在手法部分，他不僅描述了常見的推、拿、按、摩、揉、點、撥等技巧，更著重闡述了師父所傳的幾種特殊手法，如“振腹通樞法”、“循經透熱法”、“筋骨錯縫理正術”等的操作要領、適用症候及背後原理（如調節氣機樞紐、引導經氣深透、恢複筋骨力學平衡等）。每一步都配有簡單的線條圖示（他的繪畫功底有限，但力求清晰），並提醒操作者需心靜手穩，勿用蠻力，重在感應與引導。
“治則與驗案思考篇”，他將師父“治病必求於本”、“扶正祛邪，以順為補”、“因人、因時、因地製宜”等核心治則，與具體病案分析相結合。其中，他詳細剖析了救治錨爺（顱骨傷）、調理王母頑痹、處理獄中常見跌打損傷和腸胃病的不同思路，展示了如何在具體情境中運用陰陽五行、臟腑經絡理論進行辨證，並靈活組合草藥、手法、導引等不同治療手段。在每個案例後，他都附有“再思”環節，檢討得失，提出假設，記錄下尚未解決的疑問。這部分內容鮮活、具體，充滿了實踐的氣息。
寫作的過程，是孤獨的，也是充實的。常常，從清晨到日暮，陳墨都伏在案前，隻有筆尖劃過紙張的沙沙聲與他為伴。手腕酸麻了，就起身去藥圃走走，看看花草，活動筋骨；思路阻滯了，就靜坐片刻，或翻閱庫房中找到的舊醫書，尋找靈感；遇到難以表述的關竅，他便長時間地凝視窗外，仿佛在與無形的師父交流，等待那靈光一現的頓悟。
手稿一頁頁增厚，摞起來已有寸許。紙張粗糙，字跡卻工整而有力，間或有圖表穿插。墨跡深淺不一，記錄著不同時間的心境與光線。這不僅僅是一份醫學筆記，更是陳墨在極端環境下，精神世界的投射與結晶。它融合了微晶子道醫傳承的玄奧精髓與中醫體係的嚴謹框架，夾雜著陳墨個人獨特的生命體驗與獄中實踐的智慧。
偶爾，王勁鬆“巡查”至此，隔著窗戶看到陳墨如此專注地伏案書寫，會停留片刻，眼中閃過一絲複雜的讚許，然後悄然離去，從不打擾。他似乎明白，陳墨正在做的事情，其價值可能遠超乎他的想象。
當最後一頁關於“醫者心性修養”的思考落筆，陳墨長舒一口氣，輕輕合上厚厚的稿本。窗外，已是深秋，藥圃中的許多草藥進入了采收或休眠的季節。他感到一種前所未有的充實與平靜，仿佛完成了一場漫長的、與師父跨越時空的深度對話，也將自己這些年來所有的痛苦、掙紮、學習與領悟，都熔鑄進了這疊沉甸甸的紙頁中。
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