新的內閣在孫承宗的主持下，迅速開始運轉。
首先處理的便是積壓如山的奏章。
有了明確的分工和皇帝“按計劃、依章程”處理的授權，效率大大提高。
不過在所有問題中遼東問題依然是一切的核心。
袁可立奉命立即著手評估遼東經略熊廷弼的防守方略，並協調兵、戶二部，優先保障遼東軍需，穩定了岌岌可危的關外防線。同時調原遼東巡撫王化貞回京，以免出現經撫不和的現象。
畢自嚴則開始梳理太倉庫，著手審計歷年虧空，並準備推行對“一條鞭法”的最佳化和改良，以增加國庫收入。
徐光啟上任後，首先就請求編練新軍，並請旨仿製、改進西洋火器，同時舉薦他的愛徒孫元化為工部右侍郎，主要負責仿製和改進西洋火器，得到了朱常洛的全力支援。
趙南星則在吏部開始梳理官員考成法，試圖將“五年任職計劃”的模式部分引入中高階官員的考核。
都察院、錦衣衛、東廠的派駐人員也各就各位，開始履行監督之責。
朝堂之上，雖然依舊有爭論，但爭論的焦點開始更多地集中在，具體政策的是非利弊上，而非純粹的黨爭和門戶之見。
然而，平靜之下，暗流依舊湧動。
那些落選的黨派，尤其是某些自視甚高的東林和浙黨成員們，心中不服，暗中串聯，準備在具體政務上給新內閣，尤其是準備給那些沒有背景的閣員製造麻煩。
“黨團”合法化後，雖然將爭鬥擺上了檯麵，但也使得派係界限更加分明，合縱連橫更加頻繁。
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雖然在錦衣衛和東廠的監督下，內閣下達的命令六部和各地州府都必須無條件執行，但萬事難就難在執行。
而執行的關鍵則在於“錢”，明朝戶部空的能夠跑老鼠的庫房裡，沒有任何一絲多餘的錢糧來支撐內閣命令的執行。
哪怕是有，他們也會將其變得沒有。
雖然錦衣衛和東廠，高壓著六部和各地州府嚴格按照內閣的命令去執行，可他們就是一句話：“沒錢！”
皇帝也不差餓兵，沒錢哪怕內閣有再多的計劃，一切都隻能乾瞪眼。
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而僅靠皇帝的內庫，則根本無法支撐一個國家的執行。
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麵對空空如也的太倉庫和四麵八方來的要錢的手，首輔孫承宗急得角起泡，往日裡揮灑自如的乾練形象也添了幾分憔悴。
他與畢自嚴幾乎住在了戶部衙門，算盤打得震天響，試圖從石頭裡榨出油來，可惜的是巧婦也難為無米之炊。
更讓人氣憤的是各地的地方員們，都不約而同的在給新立的閣製造各種各樣的麻煩，那些本應該從南方按時押解到京城的稅收和錢糧，也都被各種各樣的原因拖著。在這種狀況下，本應進到國庫的秋季稅收，還不到往年的一半，僅有區區500萬兩，且就是這點錢，也在尚未進庫的時候，就被瓜分殆儘。
一時間京城裡的價高漲，民怨沸騰。
與此同時，朝堂上要求加徵“遼餉”的呼聲再次高漲起來。
以部分浙黨和一些保守派員為首，引經據典，陳述遼東局勢如何危急，不加餉則軍隊潰散，國門開。
“為社稷計，唯有苦一苦百姓……”這類論調開始佔據上風。
